Antibiyotiğe dirençli escherichia coli suşlarına spesifik litik bakteriyofaj izolasyonu ve litik spektrumlarının belirlenmesi
Isolation of lytic bacteriophages against antibiotic-resistant escherichia coli and determination of the lytic spectrums
- Tez No: 777823
- Danışmanlar: PROF. DR. OKTAY GENÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Microbiology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 53
Özet
Escherichia coli, kanatlı hayvanlarda kolibasillozise neden olan patojen bir bakteridir. Kolibasillozis tedavisinde antibiyotikler yoğun şekilde kullanılmaktadır. Buna karşın, antibiyotiklerin fazla ve yanlış şekilde kullanılması neticesinde son zamanlarda E. coli suşlarının antibiyotiklere dirençli hale gelmesi kolibasillozisle mücadeleyi zorlaştırmakta ve önemli bir problem olarak karşımıza çıkmaktadır. Bakteriyofajlar, bakterileri enfekte eden virüsler olarak tanımlanmakta ve antibiyotiklere alternatif olarak düşünülmektedir. Bu çalışma kolibasillozis şüpheli etlik piliçlerden izole edilen çoklu antibiyotik dirençli E. coli suşlarına karşı litik etkili bakteriyofaj izolasyonu ve litik aktivitelerinin belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Çalışmada E. coli izolasyonu için 14 kolibasillozis şüpheli etlik piliç sekumları kullanılmıştır. Bakteriyofajların tespiti, 14 sekum içeriğinin birleştirilmesiyle oluşturulan karışımdan soft agar yöntemiyle gerçekleştirilmiştir. Çalışma sonunda 14 adet E. coli izolasyonu gerçekleştirilmiş olup seçilen 6 suşun antibiyotik direnç profilleri belirlenerek E. coli suşlarının en az 3 antibiyotiğe dirençli olduğu tespit edilmiştir. Suşların dirençli oldukları antibiyotikler sırasıyla linkomisin (%100), basitrasin (%100), amoksisilin (%83), siprofloksasin (%83), sülfametoksazol (%67), kolistin (%17) ve ampisilin (%17) olarak belirlenmiştir. Buna karşın, E. coli suşlarının tetrasiklin ve gentamisine duyarlı oldukları belirlenmiştir. Spot test yöntemiyle, çoklu antibiyotik dirençli 6 E. coli suşuna karşı 4 bakteriyofaj tespit edilmiş olup bunların 3 tanesi (BF1, BF2, BF4) saflaştırılmıştır. İzole edilen bakteriyofajların titreleri çoğaltma öncesi 1.41 x 106 ile 2.04 x 106 PFU/ml arasında bulunurken, çoğaltma sonrası 4.02 x 108 ile 4.36 x 1011 PFU/ml arasında tespit edilmiştir. Bakteriyofajların, çalışmada kullanılan konak bakterilerin haricinde, 9 klinik E. coli suşuna karşı litik spektrumları belirlenmiş olup BF1 fajının ve üç fajın karıştırılmasıyla oluşturulan faj kokteylinin litik spektrumu %22.2 bulunurken, BF2 ve BF4 fajları klinik suşlara litik etki göstermemiştir.
Özet (Çeviri)
Escherichia coli is a pathogenic bacterium that causes colibacillosis in poultry. Antibiotics are used extensively in the treatment of colibacillosis. On the other hand, as a result of excessive and incorrect use of antibiotics, E. coli strains have become resistant to antibiotics recently. This complicates the fight against colibacillosis and emerges as an important problem. Bacteriophages are defined as viruses that infect bacteria and can be considered as an alternative to antibiotics. This study was carried out to isolate lytic bacteriophages against E. coli strains obtained from colibacillosis-suspected broilers and to determine the lytic activities of isolated bacteriophages against various clinical E. coli strains. In the study, the cecums of 14 colibacillosis suspected broilers were used for the isolation of E. coli. Detection of bacteriophages was carried out by the soft agar method from the mixture formed by combining 14 caecum samples. As a result of the study, 14 E. coli were isolated and antibiotic resistance profiles of 6 selected strains were determined. E. coli strains were found to be resistant to at least 3 antibiotics. E. coli strains were found to be resistant to lincomycin (100%), bacitracin (100%), amoxicillin (83%), ciprofloxacin (83%), sulfamethoxazole (67%), colistin (17%) and ampicillin (17%). In contrast, E. coli strains are sensitive to tetracycline and gentamicin antibiotics. Four bacteriophages were detected by spot test method against 6 multi-antibiotic resistant E. coli strains and 3 of them (BF1, BF2, BF4) were purified. The titers of isolated bacteriophages were found between 1.41 x 106 and 2.04 x 106 PFU/ml before amplification, and between 4.02 x 108 and 4.36 x 1011 PFU/ml after amplification. The lytic spectra of bacteriophages were determined against 9 clinical E. coli strains in addition to the host bacteria used in the study. While the lytic spectrum of the BF1 phage and the phage cocktail prepared by mixing all three phages were found to be 22.2%, the BF2 and BF4 phages did not show lytic activity against the clinical strains.
Benzer Tezler
- Çevresel örneklerden Escherichia coli DH10B suşuna karşı litik bakteriyofaj izolasyonu ve klinik Escherichia coli suşlarına karşı etkinliklerinin belirlenmesi
Çevresel örneklerden Escherichia coli DH10B suşuna karşı litik bakteriyofaj izolasyonu ve klinik Escherichia coli suşlarına karşı etkinliklerinin belirlenmesi
ABDULKERİM KARAYNİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAydın Adnan Menderes ÜniversitesiMoleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BÜLENT BOZDOĞAN
- Antibiyotik dirençli Escherichia coli izolatlarının bakteriyofaj uygulaması ile belirli antibiyotiklere karşı duyarlı hale getirilmesinin araştırılması
Investigation of sensitizing of antibiotic-resistant Escherichia coli isolates to spesific antibiotics by bacteriophage application
AYÇE FADİME DÜZENLİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiKırıkkale ÜniversitesiGıda Hijyeni ve Teknolojisi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GİZEM ÇUFAOĞLU
- Antimicrobial activity of lugol solution against microorganisms isolated from clinical specimens
Klinik örneklerden izole edilen mikroorganizmalara karşı lugol solüsyonunun antimikrobiyal aktivitesi
MUSTAFA ALI MAQBOL
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
MikrobiyolojiKarabük ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN SOLMAZ
- Tarımsal su kaynaklarından izole edilen escherichia coli suşlarının antimikrobiyal dirençliliklerinin ve plazmit içeriklerinin belirlenmesi
Determination of antimicrobial resistance and plasmid content of escheri̇chia coli strains isolated i̇n agri̇cultural water resources
DİDEM TAŞDELEN KARASLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiMuş Alparslan ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HARUN ÖNLÜ
- Investigation of oxa type genes in multidrug resistant Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infections in Baghdad
Bağdat'ta idrar yolu enfeksiyonlu hastalardan izole edilen çoklu ilaç dirençli Escherichia coli'de oxa türü genlerin incelenmesi
MUNA MAJEED ALI AL-MUSAWI
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞİNASİ AŞKAR
DR. ÖĞR. ÜYESİ DUNYA JAWAD RİDH AL-FAILY