Antibiyotik dirençli Escherichia coli izolatlarının bakteriyofaj uygulaması ile belirli antibiyotiklere karşı duyarlı hale getirilmesinin araştırılması
Investigation of sensitizing of antibiotic-resistant Escherichia coli isolates to spesific antibiotics by bacteriophage application
- Tez No: 843276
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GİZEM ÇUFAOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kırıkkale Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Hijyeni ve Teknolojisi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
Bu tez çalışmasında, çoklu antibiyotik direnci gösteren Escherichia coli izolatlarında bakteriyofaj uygulamasının fenotipik antibiyotik direnci üzerine etkisinin in-vitro olarak araştırılması amaçlandı. Bu amaç doğrultusunda, tavuk boyun derisinden izole edilen P21x, P67b, P91 ve P106 jenerik E. coli izolatları ile sığır karkas sürüntüsünden izole edilen 120GA, 180KD, 19RA ve 10KoKC E. coli O157 izolatları test mikroorganizmaları olarak kullanıldı. Ayrıca, mezbaha atık sularından izole edilen ve karakterizasyonu yapılmış E. coli'ye litik etkili üç adet bakteriyofaj (M8A, M11A ve M12A) çalışmaya dahil edildi. Çalışmada kullanılan test suşları üzerine bakteriyofajların litik etkisi çift katlı katı besiyerinde konfirme edildi. Ardından, suşlarının antibiyotik direnci üzerine bakteriyofaj kokteylinin etkisini belirlemek için izolatların minimal inhibisyon konsantrasyon (MİK) değerleri EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing - Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testi Komitesi) tarafından belirtilen broth mikrodilüsyon yöntemi kullanılarak ortaya kondu. Bu kapsamda, faj ile muamele edilmeyen kontrol grubu, faj ile bakterinin aynı anda muamele edildiği faj+bakteri grubu ve faj ile muamele edildikten sonra canlı kalanların oluşturduğu faj mutant grubu olmak üzere üç grup oluşturuldu. Suşların MİK testi sonuçları EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing - Avrupa Antimikrobiyal Duyarlılık Testi Komitesi) tarafından Enterobacterales için belirtilen MİK değerlerine (μg/ml) göre yorumlanarak dirençli (R) veya duyarlı (S) olarak belirlendi. Çalışmada beş farklı antibiyotik grubuna mensup olan ampisilin, tobramisin, fosfomisin, kloramfenikol ve nitrofurantoin antibiyotikleri kullanıldı. Analiz neticesinde, E. coli O157 izolatlarının tamamının fosfomisin faj+bakteri grubunda ve kloramfenikol faj ile faj mutant grubunda duyarlı hale geldiği tespit edildi. Jenerik E. coli izolatlarında ise nitrofurantoine dirençli suşların faj mutant grubunda tamamının duyarlı hale geldiği tespit edildi. Bununla birlikte, tüm ampisilin dirençli suşlarda faj+bakteri grubunda MİK değerlerinin belirgin şekilde arttığı gözlendi. Tobramisin için tüm izolatlarda faj+bakteri grubunda genel olarak MİK değerlerinde artış gözlenirken, faj mutant grupta duyarlılaşma tespit edildi. Sonuç olarak, bakteriyofaj ve antibiyotiklerin kombinasyonlarının çoklu antibiyotik direnci gösteren suşlarda fenotipik antibiyotik direncinde duyarlılaşmaya neden olduğu ancak, faj ve antibiyotik sinerjik etkisinin suşa ve antibiyotiğe göre büyük değişkenlik gösterdiği belirlendi. Bu durum antibiyotiklerin terapötik amaçla kullanılmadan önce faj-antibiyotik sinerjizminin in-vitro olarak ortaya konmasının altını çizmektedir. Öte yandan, faj-antibiyotik sinerjizm mekanizmalarının daha net bir şekilde ortaya konması için daha ileri in-vivo ve moleküler çalışmaların gerçekleştirilmesi gerekmektedir. Faj ve antibiyotiklerin sinerjik etkisinden faydalanılarak, yalnızca çoklu antibiyotik dirençli bakterilere karşı klinik etkinliğin artması değil, aynı zamanda antibiyotiğe dirençli bakteriyel patojenlerin insidansını potansiyel olarak yavaşlatılabileceği veya tersine çevrilebileceği öngörülmektedir.
Özet (Çeviri)
In this thesis study, it was aimed to investigate in-vitro the effect of bacteriophage application on phenotypic antibiotic resistance in multiple antibiotic-resistant Escherichia coli isolates. For this purpose P21x, P67b, P91, and P106 generic E. coli strains isolated from chicken neck skins and 120GA, 180KD, 19RA, and 10KoKC E. coli O157 strains isolated from beef carcass swabs were used as test microorganisms. Additionally, three bacteriophages (M8A, M11A and M12A) were included in the study, which were isolated from slaughterhouse wastewater and had lytic activity against E. coli. The lytic effect of bacteriophages on the test strains was confirmed in double-layer agar. Then, to determine the effect of the bacteriophage cocktail on the antibiotic resistance of the strains, the minimal inhibition concentration (MIC) values of the isolates were determined using the broth microdilution method specified by CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute). In this context, three groups were formed: a control group that was not treated with phage, a phage group in which phage and bacteria were treated simultaneously, and a phage mutant group consisting of those that remained alive after treatment with phage. The MIC test results of the strains were interpreted according to the MIC breakpoints (μg/ml) specified for Enterobacterales by EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) and were determined as resistant (R) or susceptible (S). Ampicillin, tobramycin, fosfomycin, chloramphenicol and nitrofurantoin antibiotics, which belong to five different antibiotic groups, were used in the study. As a result of the broth microdilution test, it was determined that all E. coli O157 isolates became sensitive in the fosfomycin phage group and in the chloramphenicol phage and phage mutant group. In generic E. coli isolates, it was determined that all nitrofurantoin-resistant strains became sensitive in the phage mutant group. However, it was observed that MIC values increased significantly in the phage group in all ampicillin-resistant strains. For tobramycin, a general increase in MIC values was observed in all isolates in the phage group, while sensitization was detected in the phage mutant group. As a result, it was determined that combinations of bacteriophages and antibiotics caused sensitization in phenotypic antibiotic resistance in multiple antibiotic-resistant strains, but the synergistic effect of phage and antibiotics varied greatly depending on the strain and antibiotic. This underlines that phage-antibiotic synergism should be demonstrated in vitro before antibiotics are used for therapeutic purposes. On the other hand, further in-vivo and molecular studies need to be carried out to more clearly reveal the mechanisms of phage-antibiotic synergism. By exploiting the synergistic effect of phages and antibiotics, it is foreseen that not only will clinical efficacy against multiple antibiotic-resistant bacteria be increased, but the incidence of antibiotic-resistant bacterial pathogens can also be potentially slowed or reversed.
Benzer Tezler
- Çevresel örneklerden Escherichia coli DH10B suşuna karşı litik bakteriyofaj izolasyonu ve klinik Escherichia coli suşlarına karşı etkinliklerinin belirlenmesi
Çevresel örneklerden Escherichia coli DH10B suşuna karşı litik bakteriyofaj izolasyonu ve klinik Escherichia coli suşlarına karşı etkinliklerinin belirlenmesi
ABDULKERİM KARAYNİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAydın Adnan Menderes ÜniversitesiMoleküler Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BÜLENT BOZDOĞAN
- Çevresel örneklerden izole edilen antibiyotik dirençli escherichia coli'ye özgü litik bakteriyofajların E. coli biyofilmlerinin eradikasyonunda etkinliğinin araştırılması
Investigation of the efficiency of antibiotic-resistant E coli-specific lytic bacteriophages isolated from environmental samples in eradication of biofilm of E. coli
DURSUN ALP GÜNDOĞ
Doktora
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiVeteriner Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim dalı
PROF. DR. ZAFER GÖNÜLALAN
- Yeni doğan buzağılardan patojenik escherichia coli identifikasyonu ve bu etkenlere karşı etkin bakteriyofaj izolasyonu
New born calf pathogenic escherichia coli identification and isolation of bacteriophage against these agents
MUSTAFA REHA COŞKUN
- Kistik fibrozlu hastaların solunum yolu etkenlerinin araştırılması
Investigation of respiratory pathogens in patients with cystic fibrosis
AYNURA ALISHOVA
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVRİYE GÖNÜLLÜ
DR. ÖĞR. ÜYESİ KÜBRA CAN KURT
- Phenotypic and molecular identification of escherichia coli isolates from various poultry with their antibiotic susceptibility patterns
Çeşitli kümes hayvanlarından elde edilen escherichia coli izolatlarının fenotipik ve moleküler identikasyonu ile antibiyotik duyarlılık profilleri
ROJAN İBRAHİM ALBAZAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMEL BANU BÜYÜKÜNAL BAL