Theoretical and experimental investigation of the structural properties of 1-(4-R-benzoyl)-3-(2-trifluoromethyl-phenyl)thiourea (R: Cl, CH3) compounds
1-(4-R-benzoil)-3-(2-triflorometil-fenil)tiyoüre (R: Cl, CH3) bileşiklerinin yapısal özelliklerinin teorik ve deneysel olarak incelenmesi
- Tez No: 779327
- Danışmanlar: PROF. DR. HAKAN ARSLAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Anorganik kimya, Benzoil, Benzoil klorür, Sentez, Tek kristaller, Yüzey analiz teknikleri, Inorganic chemistry, Benzoyl, Benzoyl chloride, Synthesis, Single crystals, Surface analysis techniques
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
1-(4-Kloro-benzoil)-3-(2-triflorometil-fenil)tiyoüre ve 1-(4-metil-benzoil)-3-(2-triflorometilfenil) tiyoüre bileşikleri iki aşamalı reaksiyonla sentezlenmiştir. Bileşiklerin yapıları elemental analiz, FT-IR, 1 H NMR ve 13C NMR teknikleri ile aydınlatılmıştır. X-ışını tek kristal difraksiyon analizi ile 1- (4-kloro-benzoil)-3-(2-triflorometil-fenil)tiyoüre bileşiğinin moleküler ve kristal yapısı belirlenmiştir. Kristal yapının Hirshfeld yüzey analizi, kristal paketleme için en önemli katkıların H···H (%23,8), H···S/S···H (%14,5), H···F/F···H (%14,3), C···H/H···C (%14,2) ve Cl···F/F···Cl (%9,0)'den kaynaklandığını göstermektedir. Optimize edilmiş geometriyi, moleküler elektrostatik potansiyeli (MEP), azaltılmış yoğunluk gradyan analizini (RDG), ve Frontier moleküler orbitalleri (FMO) elde etmek için 6-311G(d,p) temel seti ile B3LYP yoğunluk fonksiyoneli metodu kullanılmıştır. Teorik olarak optimize edilmiş yapı ile deneysel olarak elde edilen kristal yapı arasında çok iyi bir uyum tespit edilmiştir. Bileşiğin HOMO-LUMO enerji boşluğu 3,5307 eV olarak hesap edilmiştir. Ayrıca, enerjiçerçeve hesaplamaları, birim hücre yapısının üç boyutlu topolojisini analiz etmek ve görselleştirmek için kullanılmıştır. Elektrostatik enerji çerçevesinin, dağılım enerjisi üzerinde baskın olduğu tespit edilmiştir. Lineer olmayan optik özellikler (Polarize edilebilirlik, birinci dereceden hiperpolarize edilebilirlik ve dipol moment) teorik olarak belirlenmiştir. Elektron yoğunluğuna dayalı lokal reaktivite tanımlayıcıları olarak bilinen Fukui fonksiyonları, moleküldeki kimyasal seçiciliği veya reaktivite bölgelerini açıklamak için hesaplanmıştır. Farklı global kimyasal reaktivite tanımlayıcı parametreleri 1- (4-kloro-benzoil)-3-(2-triflorometil-fenil)tiyoüre bileşiği için hesaplanmıştır. 1-(4-Kloro-benzoil)-3-(2- triflorometil-fenil)tiyoüre bileşiğinin koronavirüsün (COVID-19) ana proteazına (6LU7) karşı inhibe edici etkisini belirlemek için moleküler docking çalışmaları yapılmıştır.
Özet (Çeviri)
The 1-(4-chloro-benzoyl)-3-(2-trifluoromethyl-phenyl)thiourea and 1-(4-methyl-benzoyl)-3-(2- trifluoromethyl-phenyl)thiourea compounds were synthesized with two-step reactions. The structure of the compounds was characterized by elemental analysis, FT-IR, 1 H NMR, and 13C NMR techniques. The molecular and crystal structure of the compound 1-(4-chloro-benzoyl)-3-(2-trifluoromethylphenyl) thiourea was determined by single-crystal X-ray diffraction analysis. The Hirshfeld surface analyzes of the crystal structure indicate that the most important contributions for crystal packing are from H···H (23.8%), H···S/S···H (14.5%), H···F/F···H (14.3%), C···H/H···C (14.2%), and Cl···F/F···Cl (9.0%). B3LYP density functional method with 6-311G(d,p) basis set was used to obtain optimized geometry, molecular electrostatic potential (MEP), reduced density gradient analysis (RDG), and Frontier molecular orbitals (FMO). A very good agreement was found between the theoretically optimized structure and the experimentally obtained crystal structure. The HOMO-LUMO energy gap of the compound was calculated as 3.5307 eV. In addition, energy-framework calculations are used to analyze and visualize the three-dimensional topology of the crystal packing. The electrostatic energy framework is dominant over the dispersion energy framework. Nonlinear optical properties (Polarizability, first-order hyperpolarizability, and dipole moment) values were theoretically determined. The Fukui functions as electron density-based local reactivity descriptors were also calculated to explain the chemical selectivity or the reactivity site in the molecule. The different global chemical reactivity descriptor parameters were also calculated for compound 1-(4-chloro-benzoyl)-3- (2-trifluoromethyl-phenyl)thiourea. Molecular docking studies were also carried out to determine the inhibitory action of the 1-(4-chloro-benzoyl)-3-(2-trifluoromethyl-phenyl)thiourea compound against the main protease (6LU7) of a new coronavirus (COVID-19).
Benzer Tezler
- Investigation of the effects of praseodymium doping on the structural properties of hydroxyapatite: An experimental and theoretical study
Praseodim katkısının hidroksiapatitin yapısal özellikleri üzerine etkisinin araştırılması: Deneysel ve teorik çalışma
RIYADH SAEED AGID
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Fizik ve Fizik MühendisliğiFırat ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖMER KAYĞILI
- Bazı schiff bazı türevlerinin yapısal ve spektroskopik özelliklerinin deneysel ve teorik yöntemlerle incelenmesi
Experimental and theoretical investigation of the structural and spectroscopic properties of some schiff base derivatives
ABDURRAHMAN SUHTA
Doktora
Türkçe
2024
Fizik ve Fizik MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UFUK ÇORUH
- N-(Bis(2,4-dimetoksibenzil)karbamotiyoil)-(R)-benzamid (R: o-, m- ve p-nitro) bileşiklerinin sentezi, karakterizasyonu ve yapısal özelliklerinin Teorik ve deneysel olarak incelenmesi
Synthesis, characterization, and theoretical and experimental investigation of the structural properties of N-(bis(2,4-dimethoxybenzyl)carbamothioyl)-(R)-benzamide (R: o-, m- and p-nitro) compounds
BİRDAL ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
KimyaMersin ÜniversitesiNanoteknoloji ve İleri Malzemeler Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜN BİNZET
- Bazı azot uçlu ligandların spektroskopik özelliklerinin deneysel ve teorik olarak incelenmesi
Experimental and theoretical investigation on spectroscopic properties of some nitrogen-ended ligands
SİBEL TANRIBUYURDU
Doktora
Türkçe
2013
Fizik ve Fizik MühendisliğiGazi ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞENAY YURDAKUL
- 1-asetilpiperazin molekülünün titreşim spektroskopisi ile deneysel ve teorik olarak incelenmesi
Experimental and theoretical investigation of 1-acetylpiperazine by vibrational spectroscopy
NESRİN ATSÜREN
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Fizik ve Fizik MühendisliğiEge ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. METİN BİLGE