Theoretical and experimental investigation of the structural properties of 1-(4-R-benzoyl)-3-(2-trifluoromethyl-phenyl)thiourea (R: Cl, CH3) compounds
1-(4-R-benzoil)-3-(2-triflorometil-fenil)tiyoüre (R: Cl, CH3) bileşiklerinin yapısal özelliklerinin teorik ve deneysel olarak incelenmesi
- Tez No: 779327
- Danışmanlar: PROF. DR. HAKAN ARSLAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 56
Özet
1-(4-Kloro-benzoil)-3-(2-triflorometil-fenil)tiyoüre ve 1-(4-metil-benzoil)-3-(2-triflorometilfenil) tiyoüre bileşikleri iki aşamalı reaksiyonla sentezlenmiştir. Bileşiklerin yapıları elemental analiz, FT-IR, 1 H NMR ve 13C NMR teknikleri ile aydınlatılmıştır. X-ışını tek kristal difraksiyon analizi ile 1- (4-kloro-benzoil)-3-(2-triflorometil-fenil)tiyoüre bileşiğinin moleküler ve kristal yapısı belirlenmiştir. Kristal yapının Hirshfeld yüzey analizi, kristal paketleme için en önemli katkıların H···H (%23,8), H···S/S···H (%14,5), H···F/F···H (%14,3), C···H/H···C (%14,2) ve Cl···F/F···Cl (%9,0)'den kaynaklandığını göstermektedir. Optimize edilmiş geometriyi, moleküler elektrostatik potansiyeli (MEP), azaltılmış yoğunluk gradyan analizini (RDG), ve Frontier moleküler orbitalleri (FMO) elde etmek için 6-311G(d,p) temel seti ile B3LYP yoğunluk fonksiyoneli metodu kullanılmıştır. Teorik olarak optimize edilmiş yapı ile deneysel olarak elde edilen kristal yapı arasında çok iyi bir uyum tespit edilmiştir. Bileşiğin HOMO-LUMO enerji boşluğu 3,5307 eV olarak hesap edilmiştir. Ayrıca, enerjiçerçeve hesaplamaları, birim hücre yapısının üç boyutlu topolojisini analiz etmek ve görselleştirmek için kullanılmıştır. Elektrostatik enerji çerçevesinin, dağılım enerjisi üzerinde baskın olduğu tespit edilmiştir. Lineer olmayan optik özellikler (Polarize edilebilirlik, birinci dereceden hiperpolarize edilebilirlik ve dipol moment) teorik olarak belirlenmiştir. Elektron yoğunluğuna dayalı lokal reaktivite tanımlayıcıları olarak bilinen Fukui fonksiyonları, moleküldeki kimyasal seçiciliği veya reaktivite bölgelerini açıklamak için hesaplanmıştır. Farklı global kimyasal reaktivite tanımlayıcı parametreleri 1- (4-kloro-benzoil)-3-(2-triflorometil-fenil)tiyoüre bileşiği için hesaplanmıştır. 1-(4-Kloro-benzoil)-3-(2- triflorometil-fenil)tiyoüre bileşiğinin koronavirüsün (COVID-19) ana proteazına (6LU7) karşı inhibe edici etkisini belirlemek için moleküler docking çalışmaları yapılmıştır.
Özet (Çeviri)
The 1-(4-chloro-benzoyl)-3-(2-trifluoromethyl-phenyl)thiourea and 1-(4-methyl-benzoyl)-3-(2- trifluoromethyl-phenyl)thiourea compounds were synthesized with two-step reactions. The structure of the compounds was characterized by elemental analysis, FT-IR, 1 H NMR, and 13C NMR techniques. The molecular and crystal structure of the compound 1-(4-chloro-benzoyl)-3-(2-trifluoromethylphenyl) thiourea was determined by single-crystal X-ray diffraction analysis. The Hirshfeld surface analyzes of the crystal structure indicate that the most important contributions for crystal packing are from H···H (23.8%), H···S/S···H (14.5%), H···F/F···H (14.3%), C···H/H···C (14.2%), and Cl···F/F···Cl (9.0%). B3LYP density functional method with 6-311G(d,p) basis set was used to obtain optimized geometry, molecular electrostatic potential (MEP), reduced density gradient analysis (RDG), and Frontier molecular orbitals (FMO). A very good agreement was found between the theoretically optimized structure and the experimentally obtained crystal structure. The HOMO-LUMO energy gap of the compound was calculated as 3.5307 eV. In addition, energy-framework calculations are used to analyze and visualize the three-dimensional topology of the crystal packing. The electrostatic energy framework is dominant over the dispersion energy framework. Nonlinear optical properties (Polarizability, first-order hyperpolarizability, and dipole moment) values were theoretically determined. The Fukui functions as electron density-based local reactivity descriptors were also calculated to explain the chemical selectivity or the reactivity site in the molecule. The different global chemical reactivity descriptor parameters were also calculated for compound 1-(4-chloro-benzoyl)-3- (2-trifluoromethyl-phenyl)thiourea. Molecular docking studies were also carried out to determine the inhibitory action of the 1-(4-chloro-benzoyl)-3-(2-trifluoromethyl-phenyl)thiourea compound against the main protease (6LU7) of a new coronavirus (COVID-19).
Benzer Tezler
- İçi beton dolu çift cidarlı çelik tüplerin (CFDST) eksenel basınç altında deneysel olarak incelenmesi
Experimental investigation of concrete filled double skin steel tubes (CFDSTs) under axial compression
BERİKA CEREN CİHAN YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Mimarlıkİstanbul Teknik ÜniversitesiMimarlık Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OĞUZ CEM ÇELİK
- N-(Bis(2,4-dimetoksibenzil)karbamotiyoil)-(R)-benzamid (R: o-, m- ve p-nitro) bileşiklerinin sentezi, karakterizasyonu ve yapısal özelliklerinin Teorik ve deneysel olarak incelenmesi
Synthesis, characterization, and theoretical and experimental investigation of the structural properties of N-(bis(2,4-dimethoxybenzyl)carbamothioyl)-(R)-benzamide (R: o-, m- and p-nitro) compounds
BİRDAL ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
KimyaMersin ÜniversitesiNanoteknoloji ve İleri Malzemeler Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜN BİNZET
- Antihistaminik ilaç etken maddeleri ile perklorat kompleks oluşumunun teorik ve deneysel olarak incelenmesi
Theoretical and experimental investigation of perchlorate complex formation with antihistaminic drug active ingredients
SEBAHATTİN TOPALOĞLU
Doktora
Türkçe
2024
Fizik ve Fizik MühendisliğiKocaeli ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEDA GÜNEŞDOĞDU SAĞDINÇ
- Gama ışınlarına maruz kalmış ZrO2 ince filmlerin karakterizasyonu
The characterization of ZrO2 thin films irradiated with gamma radiation
DEFNE ABAYLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Nükleer Mühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiNükleer Araştırmalar Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİLGÜN BAYDOĞAN
- Nanoparçacık takviyeli epoksi malzemelerin teorik ve deneysel incelemesi
Theoretical and experimental investigation of nanoparticle reinforced epoxy materials
CAN DİKİCİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EKREM TÜFEKCİ