Geri Dön

Sığır ve koyunlardan elde edilen fasciola spp izolatlarındaki genetik çeşitliliğin multipleks pcr ve sekans analizi ile araştırılması

Investigation of genetic diversity in fasciola spp isolates obtained from cattle and sheep by multiplex pcr and sequence analysis

PDF İndir

  1. Tez No: 782847
  2. Yazar: VEYSEL UZUN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SAMİ ŞİMŞEK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Parazitoloji, Veteriner Hekimliği, Parasitology, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Fırat Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 104

Özet

Fasciolosis, Fasciola hepatica ve F. gigantica'nın neden olduğu oldukça yaygın bir helmint enfeksiyonudur. Bu çalışmada fosfoenol piruvat karboksikinaz (pepck) genini amplifiye ederek hibrid Fasciola türlerini tanımlamak amacıyla bir multipleks PCR yapıldı. Ayrıca Fasciola haplotiplerini belirlemek için mitokondriyal nad1 amplifiye edilerek dizi ve filogenetik analizleri yapıldı. Bu amaçla, Elazığ ilindeki mezbahanelerden kesimi takiben 51 sığır ve 51 koyundan erişkin Fasciola izolatları toplandı, genomik DNA izole edildi ve ardından pepck'i çoğaltmak için tek aşamalı multipleks PCR yapıldı. 510 bp'lik bir bant oluşturan izolatlar F. gigantica, 241 bp'lik bir bant oluşturanlar F. hepatica ve her iki bandı oluşturanlar da hibrid (aspermik) parazitler olarak tanımlandı. Multipleks PCR neticesinde, dört izolat F. gigantica ve 84 izolat da F. hepatica olarak tanımladı. On dört de hibrid izolat (beş sığır ve dokuz koyun) tanımlandı. nad1 PCR ürünlerinin tek yönlü DNA dizi analizinde, üç izolatın F. gigantica ve 99 izolatın da F. hepatica olduğu teyid edildi. Ayrıca F. hepatica nad1 sekansları ile tespit edilen 87 haplotipten dördünün daha önce rapor edildiği, geri kalan 83'ünün de bu çalışmaya özgü olduğu belirlendi. Sonuç olarak, bu çalışma ile Türkiye'de ilk kez hibrid Fasciola parazitlerinin ve F. hepatica'nın daha önce tanımlanmamış 83 haplotipinin varlığı ortaya konuldu.

Özet (Çeviri)

Fasciolosis is a highly prevalent helminthic infection caused by Fasciola hepatica and F. gigantica. With the aim of identifying hybrid Fasciola flukes, multiplex PCR was performed to amplify phosphoenolpyruvate carboxykinase (pepck) gene. Furthermore, to determine Fasciola haplotypes, mitochondrial nad1 was amplified and aldo sequence and phylogenetic analyses were performed. Adult Fasciola isolates were collected from 51 cattle and 51 sheep after slaughtering from the abbatoires in Elazig province of Turkey, genomic DNA was isolated, and one-step multiplex PCR was subsequently performed for amplifying pepck. Isolates that generated a 510 bp band were identified as F. gigantica, those that generated a 241bp band were identified as F. hepatica, and those that generated both bands were identified as hybrid (aspermic) flukes. Further, multiplex PCR data identified four isolates as F. gigantica and 84 as F. hepatica. Fourteen hybrid isolates (five cattle and nine sheep) were identified. On unidirectional DNA sequence analysis of nad1 PCR products, three sequences were identified as F. gigantica and 99 as F. hepatica. Besides, four of 87 haplotypes de-tected for F. hepatica nad1 sequences were found to be previously reported, while the remaining 83 are unique to this study. To summarize, this study reports for the first time the existence of hybrid Fasciola flukes and 83 unique haplotypes of F. hepatica in Turkey.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    437458

    Değişik konaklardan elde edilen fasciola hepatica izolatlarında β-tubulin geninin moleküler karakterizasyonu

    Molecular characterisation of b-tubulin gene of fasciola hepatica isolates obtained from different hosts

    SIDDIKA SADET ÇANAKOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    ParazitolojiFırat Üniversitesi

    Parazitoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAMİ ŞİMŞEK

  2. Tez No

    880565

    Kuzeydoğu Anadolu Bölgesinde koyun ve sığırlarda kistik echinococcosisin moleküler karakterizasyonu

    Molekular characterisation of cystic echinococcosis in sheep and cattle in the Northeastern Anatolia Region in Turkey

    CUMA SALTAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    ParazitolojiKafkas Üniversitesi

    Parazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GENCAY TAŞKIN TAŞÇI

  3. Tez No

    760170

    Ağrı yöresinde köpeklerde echinococcus granulosus yumurtaları ile koyun ve sığırlardan elde edilen kistik ekinokokkoz izolatlarının CYTB gen bölgesinin moleküler yöntemlerle araştırılması

    Investigation of CYTB gene region of echinococcus granulosus eggs in dogs and cystic echinococcosis isolates obtained from sheep and cattle by molecular methods in ağri province

    RAHMİ YILDIZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ParazitolojiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Tıbbi Parazitoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN YILMAZ

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMED GALİP HALİDİ

  4. Tez No

    138207

    Sığır ve koyunlara ait pnömonili akciğerlerden pasteurella haemolytica'nın izolasyonu, identifikasyonu, biyotiplendirilmesi ve antibiyotiklere olan duyarlılıklarının belirlenmesi

    The isolation of pasteurella haemolytication, biotyping and determination of the antibiotic susceptibility of the isolates

    ABDURRAHMAN GÜRBÜZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Veteriner HekimliğiKafkas Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MİTAT ŞAHİN

  5. Tez No

    195091

    Sığır ve koyun orijinli Campylobacter jejuni ve Campylobacter coli'nin moleküler tiplendirilmesi

    Moleculer typing of Campylobacter jejuni and Campylobacter coli isolated from cattle and sheep

    MEHMET NURİ AÇIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. BURHAN ÇETİNKAYA

Geri Dön