Geri Dön

High resolution fluorescence imaging to study dynamics ofclathrin-coated structures

Klathrin kaplı yapıların dinamiklerinin incelenmesi amacıyla yüksek çözünürlüklü floresan görüntüleme

  1. Tez No: 784618
  2. Yazar: AHMET ATA AKATAY
  3. Danışmanlar: PROF. DR. RICHARD FISHEL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyofizik, Fizik ve Fizik Mühendisliği, Biophysics, Physics and Physics Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: The Ohio State University
  10. Enstitü: Yurtdışı Enstitü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 192

Özet

Klatrin-kaplı yapıların (KKY) dinamikleri bir çok farklı floresan görüntüleme metodu ile çalışıldı. Tek molekül dinamiklerinin gerçek zamanlı görüntülenmesi için asimetrik aydınlatma (ASA) adı verilen yüksek kuvvetli arayüz aydınlatması tekniği geliştirdik. KKY'nin ASA altında gerçek zamanlı ağartma temelli konumlama mikroskobisi ile yüksek çözünürlüklü dinamikleri inşa edildi. Klatrin parçaların değiş tokuşları ve KKY'nin yeniden modellenmesi KKY'nin çevresinde yoğunlaştığı tesbit edildi. Ayrıca odaktaş üç boyutlu görüntüleme ile klatrin parçalarının ayrışmalarının yapıların kenarlarından olduğunu gösterildi. Bu sonuçlar KKY dinamiklerinin yapıların çevresine yoğunlaştığını destekler. Üç boyutlu hücre çıkıntılarının görüntülerinin ışık tabakası aydınlatması ile görüntülenmesi ile muhtemelen ufak KKY'lerden oluşmuş bir KKY yoğunluğunun, aktin geri akışı ile koordinasyonu gözlemlendi. Bu yapıların dinamikleri bunların çevreye tutunucu özellikler gösterdiğini belirtiyor. Ufak KKY ve büyük KKY'nin çevresindeki dinamikler, KKY'nin umumen tesbit edilmiş çevreye tutunucu ve mekanik sensör faaliyetlerini teyit ediyor. Asimetrik optik diye adlandırılan yeni bir optik tasarım metodu geliştirilmiş ve arayüz aydınlatması, ASA, için kullanılmıştır. Toplam iç yansımanın hızlı azalan aydınlatmasından daha verimli olduğu öne sürülmüştür.

Özet (Çeviri)

Dynamics of clathrin-coated structures (CCS) using various fluorescent imaging modalities are studied. In order to image single molecule dynamics in real-time we developed an intense surface illumination technique called skewed illumination (SKILL). Super-resolved dynamics of CCS are reconstructed by real-time bleaching assisted localization microscopy (rtBALM) imaging under SKILL. It is found that exchange of clathrin coat components and remodeling of the CCS likely to occur at the peripheral regions flat CCS. Confocal 3D imaging showed that removals of coat components also localize to the edges of the structures. These results support that CCS dynamics are localized towards their perimeters. Analysis of 3D reconstructions of cell protrusions imaged under light-sheet illumination showed that a dense population of CCS, likely to be dominated by small clathrin-coated plaques, associates with the actin retrograde flow. Their dynamics suggest they exhibit adhesive properties. The dynamics of adhesive small clathrin-coated plaques and remodeling of flat CCS around their perimeters confirm their reported adhesive and mechanosensitive roles. A novel optical design methodology, called skewed optics, is introduced and implemented for surface illumination, i.e. SKILL. It is suggested to outperform the fast decaying illumination of total-internal reflection (TIR).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    435841

    The development of genetically encoded imaging methods to study redox state and maturation of cytochrome C protein

    Cytochrome Cproteininin redoks durumu ve maturasyonunu çalışmak için genetik olarak kodlanabilen görüntüleme metotlarının geliştirilmesi

    SELEN MANİOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    BiyofizikKoç Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. HALİL BAYRAKTAR

  2. Tez No

    630635

    GPU tabanlı paralel hesaplama tekniği ile LED tabanlı ve DMD Uygulamalı yapılandırılmış aydınlatma kullanan bir görüntüleme sisteminin oluşturulması

    Development of an imaging system using LED based and DMD applied structured illumination with GPU based parallel computing

    MUSA AYDIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolMarmara Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ BUKET DOĞAN

    PROF. DR. ALPER KİRAZ

  3. Tez No

    765270

    Total internal reflection holographic microscopy for cell extension imaging

    Holografik tam iç yansıma mikroskobuyla hücre uzantılarının görüntülenmesi

    TOLGA GÜRCAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyofizikBoğaziçi Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ

    YRD. DOÇ. DR. MUHAMMED FATİH TOY

  4. Tez No

    679586

    The synthesis and characterization of thioglycolic acid and thiourea capped fluorescent zinc sulfide nanoparticles

    Tiyoglikolik asit ve tiyoüre kaplı floresan çinko sülfit nanoparçacıklarının sentezi ve karakterizasyonu

    CEMRE MERTOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MÜRVET VOLKAN

  5. Tez No

    521408

    Korelatif mikroskop ile veziküler yapıların görüntülenmesi

    Imaging of vesicular structure by correlative microscopy

    ŞEYDA DEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Bilim ve TeknolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSNÜ ALPER BAĞRIYANIK

Geri Dön