Geri Dön

Kolistin dirençli klebsiella pneumoniae izolatlarında plazmid aracılı direnç mekanizmalarının araştırılması

Investigation of plasmid mediated resistance mechanisms in colistin resistant klebsiella pneumoniae isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 787325
  2. Yazar: FATMA ERDOĞAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FÜSUN CÖMERT
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Klebsiella pneumoniae, kolistin direnci, plasmid, mcr, Klebsiella pneumoniae, colistin resistance, plasmid, mcr
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Zonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

Amaç: Bu çalışmada, Ekim 2017- Ağustos 2020 tarihleri arasında laboratuvarımızda kolistin dirençli olduğu tespit edilen K. pneumoniae izolatlarındaki plazmid aracılı direnç mekanizmalarının araştırılması amaçlanmıştır. Yöntem: Klinik örneklerden elde edilen bakterilerin tanımlanmasında, konvansiyonel yöntemler ve gereği durumunda otomatize sistemler kullanıldı. Antibiyotik duyarlılık sonucu otomatize sistemlerle belirlenen izolatların kolistin duyarlılığı sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle doğrulandı. İzolatların ait olduğu hastaların demografik özellikleri hastane bilgi yönetim sisteminden elde edildi. İzolatların filogenetik ilişkisi Arbitrarily primed PCR (AP-PCR) ile değerlendirildi. Plazmid aracılı direnç genlerinin (mcr 1-5) varlığı multipleks PCR ile araştırıldı. Bulgular: Belirtilen tarih aralığında, izole edilen 2567 K. pneumoniae izolatlarının %1,7'si (44 izolat) otomatize sistemle kolistin dirençli bulundu. Sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle bu izolatların üçünün kolistine duyarlı olduğu tespit edildi. İzolatların elde edildiği hastaların yaşlarının 20-92 (Mean 63 ve SD ± 18) olduğu saptandı. Hastaların %56'sının yoğun bakım ünitesinde tedavi aldığı ve %31'inin yoğun bakım ünitesinde yatış öyküsünün olduğu belirlendi. AP-PCR sonucuna göre, izolatların iki farklı genotipte toplandığı, en büyük genotip olan genotip 1 içinde 37 izolatın yer aldığı ve kümeleşmenin %100 olduğu saptandı. Genotip 1 ve 2 arasında %83,6 oranında benzerlik bulundu. Çalışılan izolatların hiçbirinde mcr 1-5 genleri tespit edilmedi. Sonuç: İzolatlarımızda kolistin direnci %1,6 olarak belirlendi. Bu süreç içerisinde izolatların ön filogenetik incelemesi büyük oranda aynı genotip içinde kümeleştiğini, dolayısıyla horizontal taşınım olduğunu gösterdi. Hastaların %87'sinin yoğun bakım öyküsünün mevcut olduğu belirlendi. Plazmid aktarımlı kolistin direnci tespit edilmedi.

Özet (Çeviri)

Aim: In this study, it was aimed to investigate the mechanisms of plasmid mediated resistance in K. pneumoniae isolates that were found to be resistant to colistin in our laboratory between October 2017 and August 2020. Method: Conventional methods and, if necessary, automated systems were used for the identification of bacteria obtained from clinical specimens. Colistin susceptibility of the isolates determined by automated systems and was confirmed by broth microdilution method. The demographic characteristics of the patients to which the isolates belonged were obtained from the hospital information management system. Arbitrarily primed PCR (AP-PCR) was performed for the phylogenetic analysis of isolates. The presence of plasmid mediated resistance genes (mcr 1-5) was investigated by multiplex PCR. Results: In the specified date range, 1,7% (44 isolates) of 2567 K. pneumoniae isolates were found to be resistant to colistin by automated system. Three of these isolates were found to be susceptible to colistin by broth microdilution method. It was determined that the ages of the patients from whom the isolates were obtained were 20-92 (Mean 63 and SD ± 18). It was determined that 56% of the patients received treatment in the intensive care unit and 31% had a history of hospitalization in the intensive care unit. According to the AP-PCR results, it was determined that the isolates were collected in two different genotypes, 37 isolates were included in the largest genotype, genotype 1, and the aggregation was 100%. There was 83,6% similarity between genotypes 1 and 2. Mcr 1-5 genes were not detected in any of the studied isolates. Conclusion: Colistin resistance was determined as 1.6% in our isolates. Preliminary phylogenetic analysis of the isolates during this period showed that they were mostly clustered within the same genotype, thus horizontal transport. It was determined that 87% of the patients had a history of intensive care. Plasmid-transferred colistin resistance was not detected.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    632494

    Klebsiella pneumoniae izolatlarında karbapenem ve kolistin direnç mekanizmalarının moleküler olarak araştırılması

    Molecular investigation of carbapenem and colistin resistance mechanisms in klebsiella pneumoniae isolates

    NESLİHAN GENİŞEL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıDicle Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KADRİ GÜL

  2. Tez No

    569650

    Enterobacteriaceae üyelerinde plazmid aracılı (mcr-1, mcr-2) ve kromozomal kolistin direnç genleri (phop/phoq, pmra/pmrb) varlıklarının araştırılması

    Investigation of existance of plasmid-mediated (mcr-1, mcr-2) and chromosomal colistin resistance genes (phop/phoq, pmra/pmrb) in members of enterobacteriaceae

    YAŞARGÜL ÖZHELVACI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiAfyonkarahisar Sağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BEYTULLAH KENAR

  3. Tez No

    785217

    Çocuk ve yenidoğan yoğun bakım ünitelerinden izole edilen karbapenem dirençli klebsiella suşlarının moleküler epidemiyolojisi

    Molecular epidemiology of carbapenem resistant klebsiella species isolated from pediatric and neonatal intensive care units

    AYŞE HANDE TÜRK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DEVRAN GERÇEKER

  4. Tez No

    820192

    Klebsiella pneumoniae suşlarında kolistin direncinin araştırılması ve yöntem karşılaştırılması

    Investigation of Colistin resistance and method comparison in klebsiella pneumoniae strains

    AYÇA AYDIN UYSAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiEge Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALPER TÜNGER

  5. Tez No

    893164

    Klinik örneklerden izole edilen 'klebsıellapneumonıae' izolatlarında kolistin duyarlılığınındeğerlendirilmesinde altın standartmikrodilüsyon ve güncel otomatize ticarisistemin performans kıyaslaması ve mcr genvarlığının araştırılması

    Performance Comparison of Gold Standard Microdilution and CurrentAutomated Commercial System in the Evaluation of ColistinSusceptibility in 'Klebsiella Pneumoniae' Isolates from Clinical Samplesand Investigation of mcr Gene Presence

    IRMAK ÖZKUBAT KORKMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BEDİA DİNÇ

Geri Dön