Biyolojik moleküllerin arsenik fosforen tek katmanlı hegzagonal yüzey üzerine adsorpsiyonunun incelenmesi
Investigation of the adsorption of biological molecules on the single layer hexagonal surface
- Tez No: 787915
- Danışmanlar: PROF. DR. HANDAN OLĞAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Adsorpsiyon, Biyolojik moleküller, Elektronik özellikler, Yapısal yöntem, Yoğunluk fonksiyonu teorisi, Adsorption, Biological molecules, Electronic properties, Structural method, Density function theory
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Fizik Mühendisliği Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Nanoteknolojinin en önemli alanlarından birisi de iki boyutlu malzemelerdir. Grafenin keşfi ve yığın halinden nano boyuta geçerken göstermiş olduğu eşsiz optik, mekanik, elektronik ve manyetik özelliklerinin anlaşılması geleceğe dair umutları artırmıştır. Özellikle Grafenin keşfiyle ortay çıkan iki boyutlu malzeme sınıfının organik moleküller ile kombinasyonu sayesinde bu malzemelerin özelliklerinin ayarlanabilir olması biyomedikal alandaki kullanımını öne çıkarmaktadır. Mavi arsenik fosforen iki boyutlu aile sınıfında bulunan ve potansiyel uygulamaları konusunda teorik çalışmaları süren bir malzemedir. Bu çalışmada mavi arsenik fosforenin Glisin ve Serin organik molekülleri ile olan etkileşimini anlayabilmek için Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi (YFT) kullanılmıştır. Çalışmanın ilk kısmında alttaş olarak kullanılan mavi arsenik fosforenin yapısal ve elektronik özellikleri ortaya konmuştur. İkinci kısımda ise yüzeyde kusurlar oluşturularak yapısal ve elektronik özelliklerin değişimi belirlenmiştir. Son bölümde de kusursuz ve kusurlu yüzeylerin biyomoleküller ile olan etkileşimi için yapısal optimizasyonları gerçekleştirilmiştir. Yüzeyin biyoalgılama kabiliyetini belirleyebilmek için yapısal ve elektronik özellikleri analiz edilmiştir. Tüm bu incelemeler sonucunda kusurlu mavi arsenik fosforen yüzeylerinin Glisin ve Serin etkileşimi için iyi bir aday olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
One of the most important areas of nanotechnology is two-dimensional materials. The discovery of graphene and the understanding of its unique optical, mechanical, electronic and magnetic properties as it transitions from bulk to nanoscale have increased hopes for the future. The fact that the properties of these materials can be adjusted, thanks to the combination of the two dimensional materials, which emerged with the discovery of graphene, with organic molecules, highlights their use in the biomedical field. Blue arsenic phosphorene is a material in the two-dimensional family and the theoretical studies on its potential applications are ongoing. In this study, Density Functional Theory (DFT) was used to understand the interaction of blue arsenic phosphorene with Glycine and Serine organic molecules. In the first part of the study, the structural and electronic properties of blue arsenic phosphorene, which is used as a substrate, were revealed. In the second part, the changes in the structural and electronic properties were determined by creating defects on the surface. In the last part, structural optimizations are carried out for the interaction of pristine and defective surfaces with biomolecules. In order to determine the biosensing ability of the surface, its structural and electronic properties were analyzed. As a result of all these investigations, it has been seen that defective blue arsenic phosphorene surfaces are good candidates for the interaction of Glycine and Serine.
Benzer Tezler
- Hibrit yüzeylerin organik molekül adsorpsiyonu ile ayarlanabilir özelliklerinin simülasyon yöntemleriyle incelenmesi
Investigation of tunable properties of hybrid surfaces by organic molecule adsorption using simulation methods
PINAR KAYA
Doktora
Türkçe
2025
Fizik ve Fizik MühendisliğiAnkara ÜniversitesiFizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HANDAN OLĞAR
- Synthetic biology approach for point-of-care device applications of biosensors
Biyosensörlerin bakım noktası cihaz uygulamaları ı̇çin sentetik biyoloji yaklaşımı
İLKAY ÇİSİL KÖKSALDI
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Biyomühendislikİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. URARTU ÖZGÜR ŞAFAK ŞEKER
- Biyolojik moleküllerin tayinine yönelik kantilever bazlı biyosensör sisteminin geliştirilmesi
Development of cantilever based biosensor system for detection of biological molecules
TAMER ÇIRAK
Doktora
Türkçe
2014
BiyomühendislikHacettepe ÜniversitesiNanoteknoloji ve Nanotıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİR BAKİ DENKBAŞ
- Biyolojik aktif olabilecek çeşitli organik moleküllerin sentezlenmesi
Synthesis of various organic molecules with biological active potential effect
ONUR TOPBAŞTEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
KimyaYıldız Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEHRA NÜKET ÖCAL SUNGUROĞLU
- Biyolojik öneme sahip bazı moleküllerin vücut sıvılarından tayinine yönelik modifiye elektrot temelli sensör geliştirilmesi
Development of modified electrode based sensors for the determination of some biologically important molecules in body fluids
SALİH İLKBAŞ