Evolutionary genetics of Behcet's disease
Behçet hastalığı'nın evrimsel genetiği
- Tez No: 796656
- Danışmanlar: DOÇ. DR. EFE SEZGİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Tıbbi Biyoloji, Biotechnology, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 194
Özet
Behçet Hastalığı (BH), damarların iltihaplanmasına neden olan kompleks bir otoimmün/otoinflamatuar hastalıktır. BH'nin nedenleri bilinmemektedir. Hastalığın en sık görüldüğü popülasyonlar antik ipek yolu üzerindeki popülasyonlardır, bu da hastalığın kökeninin bu antik ticaret yoluna dayanma ihtimalini arttırır. Eğer, hastalığa neden olan genler seçilim geçirdiyse, bu seçilim bizi çeşitli patojenler ve bulaşıcı hastalıklar gibi stres faktörlerine karşı koruma amaçlı ortaya çıkmış olabilir. Böylesine bir seçilimin de izlerini BH ile ilişkilendirilmiş genlerde bulmayı bekleriz. Bu çalışmanın amacı BH'nin nötral veya seçilimsel süreçlerden nasıl etkilendiğini bulmaktır. Çalışmamızda HLA-B üzerinde önceki çalışmalarda da belirtildiği üzere bir seçilim tespit ettik, ancak seçilim izi sadece HLA-B'ye özgü değildi. HLA-B dışında BH ile ilişkilendirilmiş 14 genin daha seçilim geçirdiğini gördük. Bu seçilim izlerinden bazıları HLA-G gibi MHC lokusunda bulunan genlerdeyken, MHC lokusu dışında bulunan KCNK9 ve NOD2 gibi bazı genler HLA-B'den daha büyük bir seçilim izi göstermekte. Sonuçlar, BH alellerinin sadece BH'nin görüldüğü popülasyonlara özgü olmadığını, aksine diğer dünya popülasyonlarında da kayda değer bir miktarda bulunduğunu göstermekte. Bu da BH'nin sık görüldüğü popülasyonlarda BH alellerini özellikle destekleyen bir seçilim olma olasılığını düşürmekte. Çeşitli evrimsel süreçler, BH genlerindeki genetik çeşitliliği şekillendirmiştir ve bu süreçlerin altında yatan seçilim mekanizmalarını kesin olarak anlamak zordur. BH diğer inflamatuar hastalıklarla ortak bazı genlere sahip. Sonuç olarak, bulgularımız sadece BH için değil, genel olarak diğer inflamatuar hastalıklar için de geçerli olabilir.
Özet (Çeviri)
Behcet's Disease (BD) is an auto-immune/autoinflammatory complex disease that causes inflammation of the blood vessels. The underlying cause of BD is unknown. The highest prevalence is seen in populations along the ancient silk road, raising the possibility that it may have its origins along these historic trade routes. The genetic makeup that increases BD susceptibility in modern populations might have been advantageous for certain environmental stress factors such as resistance to infections and pathogens. Such an advantage is expected to leave signs of selection on the genes associated with BD. We have observed a possible recent selection on HLA-B as suggested in previous reports, but recent selection signature was not unique to HLA-B, 14 other BD-associated genes also showed recent selection including other MHC loci such as HLA-G, and other genes such as KCKN9 and NOD2 showed even a stronger selection than HLA-B. Results indicate that the BD alleles are not specific to East Asians. They are present in other world populations with appreciable frequencies. This shows that there is no selection favouring specifically these variants in populations with high BD prevalence. In conclusion, a variety of evolutionary processes have shaped the genetic diversity in BD risk genes, and it is difficult to understand the precise mechanisms of selection that underlie these processes. There are some common genes with BD and other inflammatory diseases. Consequently, our findings may not only apply to BD but also to other inflammatory illnesses in general.
Benzer Tezler
- Investigation of novel genes in autosomal dominant Behçet syndrome
Otozomal dominant Behçet sendromunda özgün genlerin araştırılması
GAMZE TURAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI
- Disease gene identification using linkage and exome analysis
Bağlantı ve ekzom analizi kullanarak hastalık geni keşfi
DERYA YAVUZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI
- Hibrit bölge, koruma ve filocoğrafya bağlamında türkiye'deki iki kirpi türünün (Erinaceus roumanicus ve Erinaceus concolor) evrimsel genetiği: Batı, doğu ile karşılaşıyor
Evolutionary genetics of two hedgehog species (Erinaceus roumanicus and Erinaceus concolor) in turkey with particular emphasis on hybrid zone, conservation and phylogeography: West meets to the east
METİN SİLSÜPÜR
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
GenetikOndokuz Mayıs ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSLAM GÜNDÜZ
- Türkiye Erinaceus (Erinaceomorpha: Mammalia) cinsinin moleküler filocoğrafyası
Molecular phylogeography of genus erinaceus (Erinaceomorpha: Mammalia) in Turkey
SADIK DEMİRTAŞ
- Hemiechinus auritus (Gmelin, 1770)'un Türkiye ve yakın çevresindeki moleküler filogenisi
Molecular phylogeny of Hemiechinus auritus (Gmelin, 1770) in Turkey and neighboring areas
MEDİNE ÖZMEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSLAM GÜNDÜZ