Protein-enzyme reaction followed by vibrational spectroscopy and DFT (density functional theory) characterization
Vibrasyonel spektroskopi ile protein-enzim reaksiyonu ve YFT (yoğunluk fonksiyonel teorisi) karakterizasyonu
- Tez No: 796657
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜNNUR GÜLER, DOÇ. DR. MEHMET YAĞMURCUKARDEŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyofizik, Biophysics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fotonik Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Enzimatik hidroliz ile proteinin yapısal özelliklerinin belirlenmesi, gıda kalitesinin iyileştirilmesini, alerjenlerin tanımlanmasını ve gıda zehirlenmelerinin daha iyi anlaşılmasını sağlar.Bu çalışmada, proteoliz süresince β-Laktoglobulin'in yapısal değişimleri araştırılmıştır. Model süt proteini olarak β-Laktoglobulin, model enzim olarak da tripsin kullanılmıştır. β-Laktoglobulin'in farklı konsantrasyonlarda tripsin tarafından sindirilmesi, gerçek zamanlı olarak çeşitli sıcaklıklarda yapısal değişiklikleri belirlemek ve sonuçları doğrulamak için Fourier dönüşümlü kızılötesi (FTIR) spektroskopisi ve Raman spektroskopisi ile ölçülmüştür. Sonuçlar iki boyutlu korelasyon spektroskopisi (2DCOS) ve protein ikincil yapı analizi gibi ileri veri analiz teknikleri kullanılarak analiz edilmiştir. Ek olarak, deneysel ölçümler temel düzeyde DFT simülasyonları ile desteklenmiştir.
Özet (Çeviri)
Determining the structural properties of the protein with the enzymatic hydrolysis makes it possible to improve food quality, identify allergens and better understand food poisoning.In this study, the structural alterations of β-Lactoglobulin (model whey protein) were investigated during proteolysis.Trypsin was used as a model enzyme. Digestion of β-LG by trypsin at different concentrations were measured by Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy as well as by Raman spectroscopy to identify the degradation of the protein and to verify the enzymatic reactions results at various temperatures in real time. Afterwards, the advanced analysis techniques, two-dimensional correlation spectroscopy (2DCOS) and curve-fitting analysis, were applied. In addition, the experimental measurements were supplemented with DFT simulations.
Benzer Tezler
- İpek fibroin kriyojellerinin sentezi ve mekanik özelliklerinin incelenmesi
Preparation of silk fibroin cryogels and investigation of their mechanical properties
FATİH AK
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Polimer Bilim ve Teknolojisiİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OĞUZ OKAY
- Protein engineering applications of novel esterase enzyme using rational design and directed evolution approaches
Rasyonel tasarım ve yönlendirilmiş evrim yaklaşımlarıyla yeni esteraz enziminin protein mühendisliği uygulamaları
ŞEYMA YILMAZ KÜPOĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyomühendislikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Polifenol oksidaz enziminin Iğdır kırmızı kişmiş üzümünden (Vitis Vinifera L.) afinite kromotografisi ile saflaştırılması, karakterizasyonu ve inhibisyonu
Purification of polyphenol oxidase enzyme from Iğdır city's grape kırmızı kişmiş (Vitis Vinifera L.) by affinity chromatography, characterization and inhibition
OGÜN BAĞCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Gıda MühendisliğiIğdır ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ELİF DUYGU KAYA
- Alanine scanning on the active site of a novel esterase
Yeni bir esteraz enziminin aktif bölgesinde alanin taraması
SEDA KARAKAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. NEVİN GÜL-KARAGÜLER
- NAD+ bağımlı mutant Candida methylica format dehidrogenaz enzimine ait katalitik bölgenin protein mühendisliği temelli analizi
Protein engineering based analsis of the catalytic domain of NAD+ dependent mutant Candida methylica formate dehydrogenase
UĞUR PALA
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyokimyaGebze Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BARIŞ BİNAY