Geri Dön

Tüberküloz dışı mikobakterilerin maldı-tof ms yöntemi ile tanımlanması

Identification of non-tuberculous mycobacteria by maldi-tof ms method

  1. Tez No: 803296
  2. Yazar: VUGAR HUSEYNOV
  3. Danışmanlar: PROF. DR. CÜNEYT ÖZAKIN
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Bursa Uludağ Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 45

Özet

Son yıllarda tüberküloz dışı mikobakteri (TDM) enfeksiyonlarında artış ve bu enfeksiyonların tedavilerinin tüberkülozdan farklı olması nedeniyle tür düzeyinde tanımlama gereklidir. Çalışmamızın amacı MALDI-TOF sisteminin Mycobacterium tuberculosis kompleks dışı mikobakterilerin tanımlanmasında etkinliğini göstermek, suşların referans laboratuvarına gönderilip tanımlanıp raporlanması için geçen süre göz önüne alındığında daha hızlı klinisyene sonuç vermek ve bu metodun kurumumuzda rutin kullanımını sağlamaktır. Bursa Uludağ Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Merkezi Tıbbi Mikrobiyoloji laboratuvarındaki klinik örneklerden 2016-2021 tarihlerinde izole edilmiş Ulusal Tüberküloz Referans Laboratuvarına gönderilerek tür tanımlaması yapılarak saklamaya alınmış 65 suş içinde canlandırılabilen 20 TDM suşu çalışmaya alınmıştır. Mikobakterilerin MALDI Biotyper numunesinin hazırlanması için Bruker Daltonik GmbH tarafından tavsiye edilen inaktivasyon ve ekstraksiyon prosedürü MycoEX yöntemi kullanılmıştır. Sonra MALDI-TOF sonuçları ile GenoType CM/AS kiti ile çalışılmış referans laboratuvarından gelen sonuçlar karşılaştırılmıştır. İki yöntem arasındaki uyum 20/20 (%100) olmuştur. Bir izolat GenoType CM/AS yöntemi ile M. fortuitum group olarak tanımlanmasına rağmen MALDI-TOF ile aynı grubun içinde yer alan tür M. farcinogenes olarak tanımlandığından uyumlu kabul edilmiştir. Yedi izolat >2,0; 2 izolat 1,8-2,0; 9 izolat 1,6-1,8; 2 izolat

Özet (Çeviri)

Due to the increase in non-turberculous mycobacteria (NTM) in recent years and different treatment strategies other than tuberculosis, identification at the species level is necessary for NTM. The aim of our study is to demonstrate the effectiveness of the MALDI-TOF system in the identification of NTM, to provide faster results to the clinician when considering the time taken for the strains to be sent to the reference laboratory, identified and reported, and to ensure the routine use of this method in our institution. Sixty-five NTM strains isolated from clinical samples between 2016 and 2021 at the Medical Microbiology laboratory of Bursa Uludag University Health Application and Research Center were sent to the National Tuberculosis Reference Laboratory and classified and stored, and 20 NTM strains that could be revived among them were included in the study. The MycoEX method, the inactivation and extraction procedure recommended by Bruker Daltonik GmbH, was used for the preparation of the MALDI Biotyper sample of mycobacteria. The MALDI-TOF results were then compared with the results from the reference laboratory studied with the GenoType CM/AS kit. The agreement between the two methods was 20/20 (100%). Although an isolate was identified as M. fortuitum group by GenoType CM/AS method, it was considered compatible because the species in the same group with MALDI-TOF was identified as M. farcinogenes. Seven isolates were identified with a score of >2.0, 2 isolates between 1.8-2.0, 9 isolates between 1.6-1.8, and 2 isolates with a score of

Benzer Tezler

  1. Matriks destekli lazer dezorpsiyon/iyonizasyon-uçuş zamanı kütle spektrometresi ile tüberküloz dışı mikobakterilerin tür düzeyinde tanımlanması

    Identification of nontuberculous mycobacteria at species level by matrix assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry

    MERT MANYASLI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAN ESEN

  2. Tüberküloz dışı mikobakteri türlerinin matriks destekli lazer desorpsiyon/iyonizasyonu-uçuş zamanı kütle spektrometresi ile sıvı besiyerinden tanımlanmasında üç farklı protokolün karşılaştırılması

    Comparison of three di̇fferent protocols for matrixassisted laser desorption/ionization-time of flight massspectrometry identification of non-tuberculous mycobacteri̇aisolated from liquid culture

    NEZİHAT DESEN BÜYÜKSOY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURAN ESEN

    DOÇ. DR. ÖZGÜR APPAK

  3. Klinik örneklerden izole edilen tüberküloz dışı mikobakteri TDM suşlarının tanımlanmasında MALDI-TOF MS yönteminin yeri

    Place of MALDI-TOF MS method in the identification of non-tuberculous mycobacteria strains isolated from clinical samples

    MELDA DEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DİLEK ŞATANA

  4. Mycobacterıum abscessus izolatlarının sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile antibiyotik duyarlılık paterninin belirlenmesi

    Determination of antibiotic susceptibility patterns of mycobacterium abscessus isolates using the broth microdilution method

    HANDE ÖZCAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA GÜNEY

  5. Tüberküloz dışı mikobakterilerin PCR-RFLP (polymerase chain reaction restrioction fragment lenght polymorphism) ile tiplendirilmesi

    Typing of non-tuberculosis mycobacteria by PCR-RFLP (polymerase chain reaction restrioction fragment lenght polymorphism)

    TURAN NAJAFLI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Sağlık EğitimiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÖNÜL ASLAN