Antikanser ilaç yüklü manyetik nanoparçacıkların kanser hücreleri üzerindeki sitotoksik etkisi ve moleküler docking çalışmaları
Cytotoxic effect of anticancer drug loaded magnetic nanoparticles on cancer cells and molecular docking studies
- Tez No: 808869
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ TEVFİK RACİ SERTBAKAN, PROF. DR. SERAP YALÇIN AZARKAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyofizik, Biyoteknoloji, Biophysics, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kırşehir Ahi Evran Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 127
Özet
Bu çalışmada bir antikanser ajan olan İrinotekan (Irinotecan) yüklü PHB (poli-3-hidroksibutirat) ile kaplanmış demir oksit nanoparçacıklarının kanserli hücreler üzerindeki etkisinin belirlenmesi amaçlanmaktadır. Çalışmada İrinotekan (Irinotecan) ve PHB (poli-3-hidroksibutirat) moleküllerinin 3 boyutlu çizimleri, Gauss View/5.0 paket programı ile optimizasyonu ise Gaussian/09 paket programı ile yapıldı. Daha sonra bu yapıların bağlanma bölgelerini belirlemek için Gauss View/5.0 paket programı ile MEP haritaları oluşturuldu. Origin85 programı ile de teorik IR ve Raman spektrumları çizildi. İrinotekan (Irinotecan) ve PHB (poli-3-hidroksibutirat) moleküllerinin geometrik yapı parametreleri, moleküllerin en kararlı yapısındaki bağ uzunlukları, bağ açıları ve bağlanma enerjileri gibi özellikleri teorik olarak hesaplandı. İlaç yüklü nanoparçacıklar, Biodraw ve Gaussian programlarında tamamlanıp hesaplandı. Bu yapıların anti-apoptotik proteinlerle moleküler kenetleme ve dinamik analizleri yapıldı. Aynı zamanda PHB (poli-3-hidroksibutirat) kaplı nanopartiküller nanotaşıyıcı sistemler olarak in situ sentezlendi ve İrinotekan (Irinotecan) ilacı yüklendi. Nanopartikülün ilaç yükleme kapasitesi, ilaç salınımı ve stabilitesi analiz edildi. Nanoparçacık, ilaç ve ilaç yüklü nanoparçacıkların sitotoksisitesi in vitro XTT analizleri ile test edildi. In-vitro analizde meme kanseri hücreleri üzerinde IC50 belirlendi. Hedef proteinler olan İrinotekan (Irinotecan), nanopartiküller ve İrinotekan (Irinotecan) yüklü nanopartiküllerin farklı sınıfları üzerinde in-silico analiz ve moleküler kenetleme çalışmaları yapıldı. Analiz sonucunda İrinotekan (Irinotecan) yüklü PHB kaplı nanopartiküllerin kansere karşı etkili olduğu ve potansiyel bir ilaç olma ihtimalinin yüksek olduğu görüldü.
Özet (Çeviri)
In this study, it is aimed to determine the effect of iron oxide nanoparticles coated with PHB (poly-3-hydroxybutyrate) loaded with Irinotecan (Irinotecan), an anticancer agent, on cancerous cells. In the study, 3-dimensional drawings of Irinotecan (Irinotecan) and PHB (poly-3-hydroxybutyrate) molecules were made with the Gauss View/5.0 package program, and the optimization with the Gaussian/09 package program. Then, MEP maps were created with the Gauss View/5.0 package program to determine the binding sites of these structures. Theoretical IR and Raman spectra were drawn with the Origin85 program. The geometrical parameters of irinotecan (Irinotecan) and PHB (poly-3-hydroxybutyrate) molecules, their properties such as bond lengths, bond angles and binding energies in the most stable structure of the molecules were calculated theoretically. Drug-loaded nanoparticles were completed and calculated in Biodraw and Gaussian programs. Molecular coupling and dynamic analysis of these structures with anti-apoptotic proteins were performed. At the same time, PHB (poly-3-hydroxybutyrate) coated nanoparticles were synthesized in situ as nanocarrier systems and the drug Irinotecan (Irinotecan) was loaded. The drug loading capacity, drug release and stability of the nanoparticle were analyzed. The cytotoxicity of nanoparticles, drugs and drug loaded nanoparticles was tested by in vitro XTT assays. IC50 was determined on breast cancer cells in in-vitro analysis. In-silico analysis and molecular coupling studies were performed on different classes of nanoparticles loaded with target proteins, Irinotecan (Irinotecan), nanoparticles and Irinotecan (Irinotecan). As a result of the analysis, it was seen that PHB coated nanoparticles loaded with Irinotecan (Irinotecan) are effective against cancer and have a high probability of being a potential drug.
Benzer Tezler
- Synthesis of Poly(dl-lactic-co-glycolic acid) coated magnetic nanoparticles for anti-cancer drug delivery
Anti-kanser ilaç taşınmasına yönelik Poli(dl-laktik-ko-glikolik asit) kaplı manyetik nanoparçacıkların sentezlenmesi
GÜLİSTAN TANSIK
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Bölümü
PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ
- The preparation and characterization of dendrimer coatedmagnetic nanoparticles for targeted cancer therapy
Kanser tedavisinde, ilaç hedeflenmesi için kullanılacakdendrımer kaplı manyetik nanoparçacıkların sentezi ve ilaçtaşıma özelliklerinin incelenmesi
ALTAY SAVALAN
Doktora
İngilizce
2013
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ
PROF. DR. GÜNGÖR GÜNDÜZ
- Conjugated polymer nanoparticles for biomedical applications including bioimaging and drug delivery
Konjuge polimer nanoparçacıkların ilaç taşınımı ve biyolojik görüntüleme içeren biyomedikal uygulamaları
ÖZLEM ÜNAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Kimyaİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiKimya Bölümü
DOÇ. DR. DÖNÜŞ TUNCEL
- Çok fonksiyonlu teranostik hibrit nanoparçacıkların sentezi ve meme kanseri üzerindeki uygulamaları
Synthesis of multifunctional teranostic hybrid nanoparticles for breast cancer applications
ŞEYMA BAYRAK
- Controlled release of bioactive agents
Biyoaktif ajanların kontrollü salımı
ELİFCAN ZENGİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2019
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA NEŞE KÖK
DOÇ. DR. ESRA ALVEROĞLU DURUCU
