Yeni sentezlenen bazı organik moleküllerin anti-kanser özelliklerinin incelenerek ilaç olma potansiyellerinin araştırılması
Investigation of the potential of being a drug candidate by examining the anti-cancer properties of some newly synthesized organic molecules
- Tez No: 809217
- Danışmanlar: PROF. DR. YAKUP KOLCUOĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: hEGFR, Enzim inhibisyonu, ELISA, 4-triazol, Sitotoksisite, ADME, hEGFR, Enzyme inhibition, ELISA, 4-triazole, Cytotoxicity, ADME
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 139
Özet
118Z187 nolu TÜBİTAK projesi kapsamında, bu tez çalışmasında kullanılmak üzere, in silico yöntemlerle yapılan çalışmalarla hEGFR üzerinde etkili olabilecek 1,2,4- triazol iskeleti ve substituentler tasarlanarak moleküller sentezlenmiştir. Tez kapsamında, öncelikle ticari olarak satın alınan enzimin optimum reaksiyon şartları belirlenmiştir. Enzimin optimum protein ve substrat konsabtrasyonları sırasıyla 0,01 µg/mL ve 0,5 mM olarak hesaplandı. Kinetik çalışmalarla, her bir inhibitör molekülün IC50 değeri bulunmuştur. En iyi IC50 değerine sahip moleküllerin, 31 (0,0004 mM) ve 9, 27, 30 (0,0008 mM) numaralı moleküller olduğu belirlendi. İnhibitör moleküllerin inhibisyon türü araştırıldı ve en iyi Ki değerleri 0,00232 µM (31) ve 0,0889 µM (9) olarak hesaplandı. En iyi inhibisyon etkisine sahip moleküllerin (9, 27, 30, 31) biyouyumluluk testleri için A549, NCI-H358, WI-38, OVCAR-3 ve SKOV-3 hücreleri kullanıldı. 9 ve 27 numaralı bileşiklerin en iyi sitotoksisite özelliğine sahip olduğu tespit edildi. Gefitinib ve dört molekülün OVCAR-3 hücre hattına karşı, 9 numaralı molekülün ise WI-38 hücre hattına karşı aktivitesi belirlenememiştir. ADME çalışmalarında, moleküllerin hiçbirinin tahmini kan-beyin bariyer geçiş özelliği olmadığı, çoğu molekülün ise pasif gastrointestinal emilim özelliğinin olduğu görülmüştür.
Özet (Çeviri)
Within the scope of the TUBITAK project numbered 118Z187, 1,2,4-triazole skeleton and substituents that could be effective on hEGFR were designed by in-silico methods, and molecules were synthesized to be used in this thesis. Within the scope of the thesis, first of all, the optimum reaction conditions of the commercially purchased enzyme were determined. The optimum protein and substrate concentrations of the enzyme were calculate as 0,01 µg/mL and 0,5 mM, respectively. The IC50 value of each molecule was found by kinetic studies. Molecules with the best IC50 values were determined as 31 (0,0004 mM) and 9, 27, 30 (0,0008 mM). The inhibition types of molecules were investigated and the best Ki values of these molecules were calculated as 0,00232 µM (31) and 0,0889 µM (9). A549, NCI-H358, WI-38, OVCAR-3, SKOV-3 cells were used for biocompatibility tests of molecules (9, 27, 30, 31) with the best inhibitory effect. Molecules with the best cytotoxicity were found as 9 and 27. The activity of gefitinib and four molecules against the OVCAR-3 cell, and the activity of molecule 9 against the WI38 cell could not be determined. In ADME studies, it was predicted that none of the synthesized molecules had blood-brain barrier crossing properties, and most of them had passive gastrointestinal absorbtion properties.
Benzer Tezler
- Yeni aminonaftakinon bileşiklerinin mannich reakisyon ile sentezi, karaterizasyonu ve fotofiziksel/ elektrokimyasal özelliklerinin incelenmesi
Synthesis, characterization and investigation of the photophysical electroctemical properties of new aminonaphtaqui̇none compounds by mannich reaction
GÜLHAN KÖKLÜ
- Controlled delivery of chalcone via biopolyester nanohybrid
Biyopoliester nanohibrit ile kalkonun kontrollü salımı
YASEMİN KAPTAN
Doktora
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATOŞ YÜKSEL GÜVENİLİR
- Yeni kumarin temelli bileşiklerin sentezi ve potansiyel özelliklerinin incelenmesi
Synthesis of new coumarin-based compounds and investigation of their potential properties
BÜŞRA ARVAS
- Amino asit içeren kumarin türevlerinin sentezi ve özelliklerinin incelenmesi
Synthesis of some coumarin derivatives bearing amino acids
ÖZGÜL İLGEN
- Oksim grubu içeren potansiyel N4-tipi yeni Schiff bazı ligandlarının metal kompleksleri: Sentez, karakterizasyon ve DNA etkileşimleri
Metal complexes of new potential n4-type Schiff base ligands bearing oxime groups: Synthesis, characterization and DNA interactions
CANSU GÖKÇE TOPKAYA
