Meme kanseri hücreleri üzerinde sitotoksik etkili doğal ve sentetik bileşikler: Bir veri tabanı tasarımı
Cytotoxically active natural and synthetic compounds on breast cancer cells: A database design
- Tez No: 810968
- Danışmanlar: PROF. DR. EMİNE ŞEKÜRE NAZLI ARDA, DOÇ. DR. ÇİĞDEM EROL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 102
Özet
Kanser, anormal hücrelerin kontrolsüz bir şekilde bölündüğü, sağlıklı dokulara sızdığı ve yok ettiği bir hastalık grubunu ifade eder. Kardiyovasküler hastalıklardan sonra ikinci önde gelen ölüm nedenidir ve insidansı tüm dünyada hızla artmaktadır. Dünya Sağlık Örgütü 2020 verilerine göre kadınlarda meme kanseri görülme sıklığı ilk sırayı alırken, bunu akciğer, kolon ve rektum kanserleri takip etmektedir. Meme kanseri hücreleri üzerinde sitotoksik etki gösteren bileşiklerin tanımlanması ve sitotoksisite mekanizmalarının aydınlatılması kemoprevensiyon ve kemoterapötik ilaç geliştirme çalışmaları açısından büyük önem taşır. Literatürde meme kanseri hücre hatları üzerinde sitotoksik etki gösterdiği belirlenmiş çok sayıda bileşik yer almaktadır. Bu bileşikler ve sitotoksisite düzeyleri çok zengin bir veri havuzu oluşturmaktadır. Ancak bu verilerin ilgili yayınlarda dağınık bir biçimde yer alması, sistematik karşılaştırmaların yapılmasını zorlaştırmaktadır. Bu tezde, meme kanseri hücreleri üzerinde sitotoksik aktivite gösteren doğal ve sentetik bileşiklere ait verilere hızlı bir şekilde ulaşılabilmesi amacıyla ilişkisel bir veri tabanı tasarlanmıştır. Veri tabanı 402 sitotoksisite analizi sonucundan, 171 bileşikten ve 157 meme kanseri hücre hattından girdiler içermektedir. Tüm veriler, 2000-2022 yılları arasında saf bileşiklerin ve bitki ekstrelerinin incelendiği 90 çalışmadan derlenmiştir. Oluşturulan veri tabanındaki tüm bu veriler yapılandırılmış sorgu dili (SQL) ile sorgulandığında, deneylerde en çok kullanılan bileşiğin resveratrol olduğu, en çok kullanılan meme kanseri hücre hattının ise MCF-7 olduğu bulunmuştur. Ayrıca veri tabanındaki çalışmaların odağında doğal bileşiklerin yer aldığı ve 90 çalışmanın sadece 8'inde sentetik bileşiklerin analiz edildiği görülmüştür. Güncellenebilir bir dijital kütüphane olarak tasarlanmış bu veri tabanı, bu konuda çalışan araştırmacıların hücre tipi, doğal veya sentetik ajan, işlem süresi, dozu, sitotoksik konsantrasyonu gibi verilere çok kısa sürede ulaşmasını sağlayacaktır. Veri tabanının internet üzerinden kullanıcılara ulaştırılması, meme kanserine karşı yeni ilaç keşfinin çoğu zaman ilk adımı olan in vitro çalışmalara hız kazandıracaktır.
Özet (Çeviri)
Cancer refers to a group of diseases in which abnormal cells divide uncontrollably, infiltrate and destroy healthy tissues. It is the second leading cause of death after cardiovascular diseases and its incidence increases rapidly all over the world. According to the World Health Organization 2020 data, female breast cancer incidence ranks first, followed by lung, colon, and rectum cancers. Identification of compounds with cytotoxic effects on breast cancer cells and elucidation of cytotoxicity mechanisms are of great importance in terms of chemoprevention and chemotherapeutic drug development studies. There are many compounds that have been found to have cytotoxic effects on breast cancer cell lines in the literature. These compounds and their cytotoxicity levels constitute a very rich data repository. However, the fact that these data are scattered in the relevant publications makes it difficult to make systematic comparisons. In this thesis, a relational database was designed in order to quickly access data on natural and synthetic compounds showing cytotoxic activity on breast cancer cells. The database contains inputs from 402 cytotoxicity analysis results, 171 compounds, and 157 breast cancer cell lines. All data were compiled from 90 studies in which pure compounds and plant extracts were examined between the years 2000-2022. When all these data in the created database were queried with structured query language (SQL), it was found that the most used compound in the experiments was resveratrol, and the most used breast cancer cell line was MCF-7. In addition, it was observed that natural compounds were the focus of the studies in the database and synthetic compounds were analyzed in merely 8 of the 90 studies. This database, designed as an updatable digital library, will enable researchers working on this subject to access data such as cell type, natural or synthetic agent, treatment time, dose, and cytotoxic concentration in a very short time. Bringing the database to users through the internet will accelerate in vitro studies, which are often the first step of new drug discovery against breast cancer.
Benzer Tezler
- Yeni 5-kloro-6-metoksi-2-[4-(sübstitüe)benziliden]-2,3-dihidro 1H-inden-1-on türevlerinin sentezi ve biyolojik etki çalışmaları
Synthesis of new 5-chloro-6-methoxy-2-[4-(substituted)benzylidene]-2,3-dihydro-1H-inden-1-one derivatives and investigation of their biological effects
SEVTEM GÖKBULUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Eczacılık ve FarmakolojiAnadolu ÜniversitesiFarmasötik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET ÖZDEMİR
- Meme kanserinde doğal biyoaktif bileşenlerin antikanser etkilerinin karşılaştırmalı araştırılması
Comparative assessment of anticancer effects of natural bioactive compounds in breast cancer
ESRA EROĞLU KÖKSAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Tıbbi BiyolojiAnkara Yıldırım Beyazıt ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜNAY BALTA
- Effects of exosome encapsulated anticancer drug Lapatinib on breast cancer cells
Eksozom ile kapsüle edilmiş kemoterapötik ilaç olan Lapatinib'in meme kanseri hücreleri üzerinde etkileri
NURDAN SENA DEĞİRMENCİ
Doktora
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EVREN ÖNAY UÇAR
PROF. DR. FİKRETTİN ŞAHİN
- Quercetin'in anti-karsinojenik etkilerinin meme kanseri hücrelerinde incelenmesi
Examination of the anti-carcinogenic effects of Quercetin in breast cancer cells
RANIM SUMSUMİA
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyolojiİstinye ÜniversitesiSağlık Bilimleri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YELDA BİRİNCİ KUDU
- Fungal kaynaklı bassiatin'in (3R,6R) meme kanseri hücre hatları üzerindeki etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of fungal-sourced bassiatin (3R,6R) on breast cancer cell lines
ERKAY ÖZGÖR