Dissecting the effect of viscosity of deep eutectic solvents on the structure and dynamics of thermostable lipases
Derin ötektik çözücülerin viskozitesinin termostabil lipazların yapısı ve dinamiği üzerindeki etkisinin incelenmesi
- Tez No: 811356
- Danışmanlar: PROF. DR. EMEL TİMUÇİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoistatistik, Biyoteknoloji, Biyokimya, Biostatistics, Biotechnology, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Lipazlar, Moleküler yapı, Termoalkalofilik lipazlar, Termostabilite, Viskozite, Çözücüler, Lipases, Molecular structure, Thermoalkalophilic lipases, Thermostability, Viscosity, Solvents
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoistatistik ve Biyoinformatik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Lipaz, lipitlerin karboksilik ester bağlarının hidrolizini katalize eder. Bu enzim, katalitik karmaşıklığını gösteren, yalnızca tek bir aktif bölge ile çok çeşitli reaksiyonları katalize edebilir. Derin ötektik çözücü (DES), organik çözücülerin aksine toksik değildir, uçucu değildir, yanıcı değildir, ucuzdur, biyolojik olarak parçalanabilir ve hazırlanması kolaydır. Lipaz katalizli reaksiyonlar için etkili bir şekilde kullanılmıştır. Farmasötik, biyoyakıt ve zirai kimyasalların üretimi lipaz uygulamalarının örnekleridir. DES, bir hidrojen bağı alıcısı ve bir hidrojen bağı donörü karıştırılarak hazırlanabilir. Bir hidrojen bağı ağı oluştururlar ve bununla sıvı olarak kalır. DES, bir enzimatik reaksiyonda çözücü, substrat ve hem çözücü hem de substrat olarak kullanılabileceği için çok önemlidir. DES'ler çok viskozdur ve enzimlerin çalışması için esnekliğe ihtiyacı vardır. Bu çalışmada, aynı konsantrasyon oranlarına sahip iki tip DES (gliselin ve etalin) karşılaştırılmıştır. Bununla birlikte, aynı konsantrasyondaki farklı DES türlerinin lipazın stabilitesini nasıl etkileyeceği ve solvent yapısının nasıl değişeceği hesaplamalı yöntemlerle kontrol edildi. Sistemler hazırlandı, açık lipaz %100 gliserol, gliselin 2:1 ve 6:1, etalin 2:1 ve 6:1 içinde çözüldü. Ethalin bazlı DES, solvent viskozitesi ile lipaz hareketliliği arasında negatif bir korelasyon gösterirken gliselin bazlı DES, pozitif bir korelasyon gösterdi. Termoalkalofilik lipazlar, DES bazlı endüstriyel reaksiyonlarda umut vaat etmektedir. Bu tezin bulguları, çözücünün bileşiminin yanı sıra fizikokimyasal özellikleri uyarlayarak DES'lerde optimal lipaz stabilitesine ilişkin yeni bilgiler sağladı.
Özet (Çeviri)
Lipase catalyzes the hydrolysis of carboxylic ester bonds of lipids. This enzyme can catalyze a wide range of reactions with only a single active site, indicating its catalytic complexity. Deep eutectic solvent (DES) is non-toxic, non-volatile, non-flammable, inexpensive, biodegradable, and easy to prepare, unlike organic solvents. It has been effectively used for lipase-catalyzed reactions. Production of pharmaceuticals, biofuels and agrochemicals are examples of lipase applications. DES can be prepared by mixing a hydrogen bond acceptor and a hydrogen bond donor. They form a hydrogen bond network and with this, it stays as liquid. DES is very important as it can be used as a solvent, substrate and both solvent and substrate in an enzymatic reaction. DESs are very viscous, and enzymes need flexibility to work. In this study, two types of DES (glyceline and ethaline) are compared while having the same concentration ratios. With this, how different types of DES at the same concentration would affect the stability of lipase and how the solvent structure would change were checked using computational methods. The systems were prepared, open lipase was dissolved in glycerol 100%, glyceline 2:1 and 6:1, ethaline 2:1 and 6:1. Ethaline-based DES showed a negative correlation while glyceline-based DES showed a positive correlation between solvent viscosity and lipase mobility. Thermoalkalophilic lipases show promise in DES-based industrial reactions. Findings of this thesis provided novel insights into the optimal lipase stability in DESs by tailoring physiochemical properties as well as composition of the solvent.
Benzer Tezler
- Farklı irtifalara göre tasarlanmış aerospike lülelerin çeşitli irtifalarda performans karşılaştırması
Designed for different altitudes at various altitude of aerospike nozzles performance comparison
BARTU AKMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Havacılık ve Uzay Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiSavunma Teknolojileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYDIN MISIRLIOĞLU
- A potential application for textile industrial waste to produce eco-friendly composite
Çevre dostu kompozit üretmek üzere tekstil endüstriyel atığı için potansiyel bir uygulama
ELÇİN EMEKDAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Tekstil ve Tekstil Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiTekstil Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ UMUT KIVANÇ ŞAHİN
- Rat serbest kasık flebi modelinde gentian violet ve brilliant blue boyalarının damar anastomozu üzerine etkileri
The effect of gentian violet and brilliant blue dye on vascular anastomosis in the rat free groin flap model
MIRFEYZULLA SEYIDLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Plastik ve Rekonstrüktif CerrahiSağlık Bilimleri ÜniversitesiPlastik Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SİNAN ÖKSÜZ
- TRAVMATİK PERİFERİK FASİYAL SİNİR PARALİZİSİ SONRASINDA DERMALİX'İN FASİYAL SİNİR REJENERASYONU ÜZERİNE OLAN ETKİSİ
THE EFFECT OF DERMALİX ON FACİAL NERVE REGENERATİON FOLLOWİNG TRAUMATİC PERİPHERAL FACİAL NERVE PARALYSİS
BURAK ZİVER ELDEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Kulak Burun ve BoğazSağlık Bilimleri ÜniversitesiKulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. RASİM YILMAZER
- Subkütanöz olarak siklosporin-A uygulanan sıçanlarda meydana gelen dişeti büyümesi üzerinde azitromisin ve klorheksidin kullanımının etkileri
The Effect of azithromycin and chlorhexidine application on the gingival enlargement in subcutanous cyclosporin A treated rats
ALTUĞ EKNİ