Geri Dön

Novel resistance-free ret tyrosine kinase inhibitor discovery through dynamic structure-based pharmacophore and qsar modeling and virtual screening of ultra large ligand libraries

Ultra büyük ligand kütüphanelerinin sanal taraması ve dinamik yapı temelli farmakofor ve qsar modellemesi ile yeni rezistans göstermeyen ret tirozin kinaz inhibitörünün keşfi

PDF İndir

  1. Tez No: 816163
  2. Yazar: EHSAN SAYYAH
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SERDAR DURDAĞI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyomühendislik, Biyoloji, Biyofizik, Bioengineering, Biology, Biophysics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Bahçeşehir Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Gen füzyonları ve nokta mutasyonları, gen füzyonunun non-small cell lung cancer ve papiller tiroid kanserlerinden sorumlu olduğu ve RET proto-onkogenindeki nokta mutasyonunun, reseptör tirozin kinazı olan RET proto-onkogeninin aktivasyonuna neden olduğu, multiple endokrin neoplazi tip 2A ve 2B (MEN2A, MEN2B) ve familial medüller tiroid kanseriyle ilişkilidir. Ayrıca, inhibitör olarak kullanılan küçük moleküller RET kinaz etki alanına bağlanarak enzimatik aktivitelerini engellerler. Bununla birlikte, RET kinaz pozisyonunda tek bir amino asit değişikliği, tirozin kinaz inhibitörlerine direnç sağlayabilir, bu nedenle RET mutasyonlarına karşı etkili bir bileşik bulmak önemlidir. Bu nedenle, moleküler dinamik trajelerin e-farmakofor modellemesi ve QSAR modelleri kullanılarak küçük moleküllerin çeşitli kütüphanelerinden elde edilen pIC50 değerlerinin tahmin edilmesi ile RET proto-onkogenin aktivasyonunu ve sinyal yolaklarını inhibe edebilen yeni küçük moleküller keşfedebileceğimizi hipotez ediyoruz. Bu şekilde, tümör büyümesini ve inhibitöre karşı en düşük direnci olan tümör boyutlarını durdurabiliriz.

Özet (Çeviri)

Gene fusion and point mutations cause to activate RET tyrosine kinase where the gene fusion is responsible for non-small cell lung cancer and papillary thyroid cancers and the point mutation on the RET proto-oncogene, which is the receptor tyrosine kinase, causes multiple endocrine neoplasia type 2A and 2B (MEN2A, MEN2B) and Familial medullary thyroid cancer. Furthermore, small molecules as inhibitors bind to the binding site of RET kinase domain to block their enzymatic activity. On the other hand, a single amino acid change on the RET kinase position can provide resistance to the tyrosine kinase inhibitors, so it is essential to find a compound with activity against RET mutants. So, we hypothesize that with in-silico E-pharmacophore modeling of molecular dynamics trajectories and predicting pIC50 values of small molecules from several libraries using QSAR models, we can discover new small molecules that can inhibit the activation of RET proto-oncogene and their signaling pathways, so it can stop the growth of tumor sizes with the lowest resistance to that inhibitor.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    809360

    A systematic research on rational design and synthesis of innovative materials for developing high-performance perovskite solar cells

    Yüksek performans perovskit güneş hücresi geliştirilmesi için yenilikçi malzemelerin mantıksal tasarımı ve sentezi üzerine sistematik bir araştırma

    ALİEKBER KARABAĞ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMRULLAH GÖRKEM GÜNBAŞ

    DOÇ. DR. SAFACAN KÖLEMEN

  2. Tez No

    220657

    Peter Weiss'in“Direnmenin Estetiği”romanı üzerine bir görsel okuma kılavuzu

    Novel“Aesthetics of Resistance”is based on visual reading guide which was written by Peter Weiss

    BAHAR BÜYÜKGENÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Güzel SanatlarÇukurova Üniversitesi

    Resim-İş Eğitimi Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ. MUSTAFA OKAN

  3. Tez No

    459382

    Synthesis of photopolymerizable macromers giving novel poly(β-amino ester)s for biomedical applications

    Biyomedikal uygulamalar için yeni poli(Beta-amino ester)ler veren fotopolimerleştirilebilir makromerlerin sentezi

    ECE AKYOL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    KimyaBoğaziçi Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DUYGU AVCI SEMİZ

  4. Tez No

    675450

    Novel approaches for protection of light metals under various wear conditions via micro arc oxidation process

    Hafif metallerin mikro ark oksidasyon yöntemiyle farklı aşınma şartlarında korunmasına yönelik yenilikçi yaklaşımlar

    FAİZ MUHAFFEL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Mühendislik Bilimleriİstanbul Teknik Üniversitesi

    Malzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN ÇİMENOĞLU

  5. Tez No

    948950

    Bortezomibe dirençli prostat kanseri hücre hattı PC3 kullanılarak kanser tedavisine yönelik yeni hedef moleküllerin belirlenmesi

    Identification of novel target molecules for cancer therapy using the bortezomib-resistant prostate cancer cell line PC3

    SEMİH ŞEKER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    OnkolojiKütahya Sağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AZMİ YERLİKAYA

Geri Dön