Determination of abiotic stress tolerance genes in gypsophila perfoliata
Gypsophila perfoliata'da abiyotik stres tolerans genlerinin belirlenmesi
- Tez No: 819056
- Danışmanlar: DOÇ. DR. MEHMET AYDIN AKBUDAK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bor toksisitesi Türkiye'de yerel bir mikro besin sorunu olup yapraklarda sararma ve nekroza, meyvelerde sayı, boyut ve ağırlıkta azalmaya neden olarak ürün verimini düşürmektedir. Bor hiperakümülatör türlerinde toksik bor stresi ile ilgili genlerin tanımlanması, bitkilerde bor tolerans mekanizmalarını aydınlatacağı düşünülmektedir. Bu düşünce göz önünde bulundurularak, bor stresi verilmiş G. perfoliata yaprak ve kök cDNA kütüphaneleri oluşturulmuştur. cDNA kütüphaneleri maya hücrelerine transforme edilip yüksek konsantrasyondaki H3BO3 varlığında taramaları gerçekleştirilmiştir. Bor toleransı gösteren 10 transformant arasından 1 transgenik maya plasmidi seçilip yeni nesil dizileme yapıldıktan sonra gen özellikleri BLASTX kullanılarak açıklanmıştır. Sonuçlar, tanımlanan GpEEFA1a geninin Saccharomyces cerevisiae'da stres sinyali metabolizmasını geliştirdiğini göstermektedir. Maya hücrelerinin seçilen plazmit ile retransformasyonu, hücrelerde bor toleransı sağlamıştır. Bu stresle ilişkili genin ekspresyon seviyeleri qPCR ile G. perfoliata yapraklarında kontrol edilmiştir. Bu çalışmada sonuç olarak G. perfoliata'da hafif bor toleransı sağlayan bir gen belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Identification of genes related to toxic boron stress in boron hyperaccumulator species is thought to illuminate boron tolerance mechanisms in plants. With this in mind, toxic amount boron treated G. perfoliata leaf and root cDNA libraries were created. cDNA libraries were transformed into yeast cells and screened in the presence of high concentration of H3BO3. After selecting 1 transgenic yeast plasmid among 10 boron-tolerant transformants and next generation sequencing, gene properties were annotated using BLASTX. The results show that the identified GpEEFA1a gene enhances stress signal metabolism in Saccharomyces cerevisiae. Retransformation of yeast cells with the selected plasmid provided boron tolerance in the cells. Expression levels of this stress-related gene were checked by qPCR in G. perfoliata leaves. In this study, a gene providing slightly boron tolerance was identified in G. perfoliata.
Benzer Tezler
- Salatalık ve kabak genomlarında ekspansin genlerinin belirlenmesi ve abiyotik stres koşulları altında gen ifade profillerinin değerlendirilmesi
Determination of expansin genes in cucumber and zucchini genomes and evaluation of gene expression profiles under abiotic stress conditions
BÜŞRA ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiKastamonu ÜniversitesiGenetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN ÇELİK ALTUNOĞLU
- Mentha x piperita L. bitkisinde soğuk stres toleransında etkili olduğu düşünülen bazı genlerin transkripsiyonel düzeyde ekspresyonlarının real-time PCR ile tespit edilmesi
Determination of transcriptional level expressions by real-time pcr of some genes thought to be effective on cold stress tolerance in the plant Mentha x piperita L.
SELİN GALATALI
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERGUN KAYA
- Ayrık tuz çimi'nde (Puccinellia distans) selenyum (Se) toksisitesine dayanıklılık genlerinin belirlenmesi
Determination of selenium (Se) toxicity tolerance genes in European alkali grass (Puccinellia distans)
KÜBRA BUDAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET AYDIN AKBUDAK
- Soğuk stresi altında geliştirilmiş ayçiçeği (Helianthus annuus L.) bitkisinde bbZIP, MYB, NAC, NF-YB ve WRKY tipi transkripsiyon faktör genlerinin mRNA ifade seviyelerinin belirlenmesi
Determination of mRNA expression levels of bZIP, MYB, NAC, NF-YB and WRKY transcription factor genes in sunflower (Helianthus annuus L.) plant grown under cold stress
ÇİĞDEM DÖNMEZ
- Fasulyede (Phaseolus vulgaris L.) melatoninin tuz stresindeki etkisinin belirlenmesi
Determination of the effect of melatonin on salt stress in common bean
İLYAS ASAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatAtatürk ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MURAT AYDIN