Sert çekirdekli meyvelerde RT-PCR yöntemi ile plum pox virus (PPV) taraması
Plum pox virus (PPV) screening by RT-PCR method in stone fruits
- Tez No: 820143
- Danışmanlar: DOÇ. DR. KAHRAMAN GÜRCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Prunus spp, plum pox virus, RT-PCR, sekans analizi, Prunus spp, plum pox virus, RT-PCR, sequencing
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Birçok biyotik ve abiyotik faktör sert çekirdekli meyve üretimini sınırlar ve ürün kalitesinin ve miktarının düşmesine neden olur. Biyotik faktörler arasında, Potyviridae familyasının bir üyesi olan plum pox virus (PPV) sert çekirdekli meyve ağaçlarının en etkili hastalık etmenidir. Erik, kayısı ve şeftali türlerinin PPV ile yoğun olarak enfekteli olması, Türkiye'nin PPV-D, -M, -Rec ve -T ırklarının genetik çeşitlilik merkezi olması bu virüsün diğer olası konukçuları olan kiraz, vişne ve bademe bulaşma riskini gündeme getirmiştir. Bu çalışma kiraz, vişne ve bademde PPV varlığını belirlemek için yapılmıştır. 2020-2022 yılları arasında 8 farklı ilden toplanan çoğunlukla kiraz, vişne ve bademden oluşan toplam 395 adet sert çekirdekli meyve yaprak örneğinin PPV ile bulaşık olup olmadığı PPV spesifik P1/P2 (9340-9583 nt) ve PP3/PCI (2915-3750 nt) primerleri kullanılarak test edilmiştir. Kontrol olarak kullanılan erik (17 pozitif), kayısı (27 pozitif) ve şeftali (3 pozitif) örneklerinin dışında, 6 badem örneğinde PPV tespit edilmiştir. Kiraz ve vişne'de ise PPV bulunmamıştır. Sonuçlar bademin PPV'ye konukçu olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
There are many biotic and abiotic factors that limit stone fruit production and cause quality and quantity loss in the product. Among the biotic factors, sharka disease caused by plum pox virus (PPV), a member of the Potyviridae family, is known as the most important viral disease of stone fruit trees. The fact that plum, apricot and peach species are heavily infected with PPV and that Turkey is a center of genetic diversity of PPV-D, -M, -Rec and -T races has brought the risk of transmission of this virus to other possible hosts such as cherry, sour cherry and almond. This study was conducted to determine the presence of PPV in cherries, sour cherries and almonds. A total of 395 stone fruit leaf samples collectedfrom 8 different provinces between 2020 and 2022, mostly cherry, sour cherry and almond, were tested for PPV infection using PPV specific primers P1/P2 (9340-9583 nt) and PP3/PCI (2915-3750 nt). Apart from plum (17 positive), apricot (27 positive) and peach (3 positive) samples used as controls, PPV was detected in 6 almond samples out of 395 samples. PPV was not detected in cherry and sour cherry. The results indicate that almonds are host to PPV.
Benzer Tezler
- Isparta kiraz üretim alanlarında görülen önemli virüslerin serolojik ve moleküler yöntemlerle teşhisi ve kılıf protein gen dizilimlerinin belirlenmesi
Detection of important viruses on cherry production region of Isparta by serological, moloculer methods and determination of coat protein gene sequences
YUSUF ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2012
ZiraatSüleyman Demirel ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BAYRAM ÇEVİK
- Cydia pomonella granulozis virüs (CpGV)'ün cydia molesta'da transkripsiyonal analizi
Transcriptional analysis of cydia pomonella granulovirus (CpGV)in cydia molesta
DÖNÜŞ TOY
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İSMAİL DEMİR
- Doğu Akdeniz bölgesinde sert çekirdekli meyvelerde plum pox potyvirüs (PPV, Sharka)'ünün durumunun belirlenmesi ve karakterizasyonu
Determination and characterization of plum pox potyvirüs (PPV, Sharka) on stone fruits at east mediterranean region
GÖKMEN KOÇ
- Sert çekirdekli meyve ağaçlarında yüksek kapasiteli dizilemeyle (HTS) virüs ve viroid hastalık etmenlerinin belirlenmesi
Determination of virus and viroid disease factors by high throughput sequencing (HTS) in strone fruit trees
İZEM NUR KARABAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
ZiraatErciyes ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KAHRAMAN GÜRCAN
- Sert çekirdekli meyve ağaçlarında enfeksiyon yapan ilarvirüslerin RT-PCR ile tanısı ve karakterizasyonu
Identification and characterization of ilarviruses infecting stone fruits
ÇİĞDEM ULUBAŞ