Klinik örneklerden izole edilen Candida glabrata kompleksi suşlarının moleküler yöntemlerle tür düzeyinde tanımlanması ve antifungallere duyarlılıklarının belirlenmesi
Identification of Candida glabrata complex strains isolated from clinical specimens at the species level by molecular methods and determination of their susceptibilities to antifungals
- Tez No: 820313
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GONCA ERKÖSE GENÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 98
Özet
Candida glabrata insanlarda gastrointestinal sistem ve mukokutanöz membranların mikrobiyotasının üyesidir. Risk faktörlerinin varlığında fırsatçı enfeksiyonlara neden olmaktadır. Suşlarda flukonazole direnç veya azalmış duyarlılık görülebilmekte, son yıllarda ekinokandinlere direnç gözlenme sıklığında da artış bildirilmektedir. İki yeni tür olan Candida nivariensis ve Candida bracarensis, C. glabrata sensu stricto ile birlikte C. glabrata kompleksi içinde sınıflandırılmaktadır. Bu iki yeni tür yüzeyel ve invazif çeşitli enfeksiyonların etkeni olarak izole edilmiş, C. glabrata'ya göre daha dirençli ve virülan oldukları belirlenmiştir. Ancak fenotipik ve biyokimyasal yöntemlerle C. glabrata'dan ayırt edilememekte, yanlış tanımlanabilmektedirler. Bu çalışmada, çeşitli klinik örneklerden izole edilmiş ve biyokimyasal temelli sistemlerle C. glabrata olarak tanımlanmış toplam 40 suş ITS bölgesinin dizi analizi ile tür düzeyinde tanımlanmış ve antifungallere duyarlılıkları Sensititre YeastOne duyarlılık paneli ile araştırılmıştır. Suşların tamamının (%100) C. glabrata sensu stricto olduğu belirlenmiş, C. nivariensis ve C. bracarensis'e rastlanmamıştır. Belirlenen minimum inhibitör konsantrasyonu (MİK) değerleri Clinical and Laboratory Standards Institute'ün (CLSI) türe özgü klinik sınır değerlerine, bu değerlerin belirlenmemiş olduğu antifungaller için ise epidemiyolojik eşik değerlerine göre değerlendirilmiştir. Suşların tamamının (%100) flukonazole doza bağlı duyarlı; kaspofungin, anidulafungin ve mikafungine 39'unun (%97,5) duyarlı, birinin (%2,5) dirençli olduğu belirlenmiştir. Amfoterisin B ve itrakonazol için 40 (%100), posakonazol için 37 (% 92,5), vorikonazol için ise 36 (% 90) suşun vahşi tip (wild type-WT) olduğu tespit edilmiştir. C. nivariensis ve C. bracarensis'in epidemiyolojisi, virülans özellikleri ve direnç profilleri ile ilgili daha fazla araştırma yapılmasının gerektiği, ayrıca rutin mikrobiyoloji laboratuvarlarında C. glabrata kompleksinin tür düzeyinde doğru olarak tanımlanması ve antifungallere duyarlılıklarının belirlenmesinin önem taşıdığı düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Candida glabrata is a member of microbiota of gastrointestinal tract and mucocutaneous membranes in humans. In the presence of risk factors, it causes opportunistic infections. Resistance or decreased susceptibility to fluconazole can be observed in strains, and an increase in the frequency of resistance to echinocandins has been reported in recent years. Two new species, Candida nivariensis and Candida bracarensis, are classified together with C. glabrata sensu stricto in C. glabrata complex. These two new species were isolated as the causative agent of various superficial and invasive infections, and they were determined to be more resistant and virulent than C. glabrata. However, they cannot be distinguished from C. glabrata by phenotypic and biochemical methods and can be misidentified. In this study, a total of 40 strains isolated from various clinical specimens and identified as C. glabrata by biochemical-based systems were identified at the species level by sequencing of ITS regions and their susceptibility to antifungals was investigated with Sensititre YeastOne susceptibility panel. All strains (100%) were determined to be C. glabrata sensu stricto, while C. nivariensis and C. bracarensis were not found. The minimum inhibitory concentration (MIC) values obtained were evaluated according to the species specific clinical breakpoints and epidemiological cut-off values determined by Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). It was determined that all strains (100%) were susceptible dose-dependent to fluconazole; 39 strains (97.5%) were susceptible, one (2.5%) was resistant to caspofungin, anidulafungin and micafungin. All strains (100%) for amphotericin B and itraconazole, 37 (92.5%) strains for posaconazole, and 36 (90%) strains for voriconazole were found to be wild type (WT). It was thought that more research should be done on epidemiology, virulence factors and resistance profiles of C. nivariensis and C. bracarensis, and it is important in the routine microbiology laboratories to correctly identify C. glabrata complex isolates at the species level and to determine susceptibility to antifungals.
Benzer Tezler
- Klinik örneklerden izole edilen candida glabrata kompleksi'nin moleküler epidemiyolojisi, antifungal ajanlara duyarlılıkları ve virülans faktörlerinin belirlenmesi
Molecular epidemiology of candida glabrata complex isolated from clinical samples, sensitivity to antifungal agents and determination of virulance factors
ÖZGE KAAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE NEDRET KOÇ
- Non-albicans candida türlerinin moleküler tiplendirilmesi ve antifungal duyarlılıklarının belirlenmesi
Molecular typing of non-albicans candida species and determination of antifungal susceptibilities
HULUSİ GÜVEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FİLİZ ORAK
- Karadeniz Teknik Üniversitesi Tıp Fakültesi Farabi Hastanesi'ndegörülen fungal infeksiyonlar ve antifungal duyarlılıkları
Appearance of fungal infections and antifungal susceptibilitiesat medical faculty, Farabi Hospital, Karadeniz Technical University
UĞUR KOSTAKOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıKaradeniz Teknik ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. KEMALETTİN AYDIN
- Klinik örneklerden izole edilen candida glabrata suşlarının amfoterisin B, flukonazol ve itrakonazole in vitro duyarlılığının araştırılması
In vitro susceptibility of clinical isolates of candida glabrata to amphotericin B, fluconazole and itraconazole
HÜSEYİN AVCILAR
Doktora
Türkçe
2004
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEVTAP ARIKAN
- Değişik klinik örneklerden izole edilen Candida türlerinin belirlenmesi ve antifungal maddelere karşı duyarlılıklarının araştırılması
Typing of Candida isolated from different clinical samples and investigation of their sensitivity against systemic antifungals
BERRİN UZMAN SERİNGEN