Geri Dön

Kültür mercimeğinde (Lens culinaris Medik.) geliştirilen genomik SSR Markörlerinin yabani mercimek türlerine transfer edilebilirliğinin belirlenmesi

Determination of transferability of genomic SSR Markers developed in cultured lentil (Lens culinaris Medik.) to wild lentil species

PDF İndir

  1. Tez No: 820839
  2. Yazar: MERVE KEKLİK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. MELİKE BAKIR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Erciyes Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 81

Özet

Basit Dizi Tekrarı (SSRs) bir başka ismi ile mikrosatellit markörler, bitki genetik ve genomik araştırmaları için yaygın olarak geliştirilen ve kullanılan önemli moleküler gereçlerdir. Ancak mikrosatellitlerin geliştirilmesi yüksek maliyeti ve iş gücü nedeniyle bitkilerde yaygın olarak kullanımını sınırlamaktadır. Bu nedenle bir türde geliştirilen SSR markörün, tür içi ve türler arası aktarılabilirliğinin tespiti, genetik ve genomik çalışmalara kolaylık sağlamaktadır. Bu çalışmanın amacı, kültür mercimeğinde geliştirilen SSR markörlerin yabani mercimek türleri L. nigricans, L. lamottei, L. ervoides, L. culinaris subsp. tomentosus, L. culinaris subsp. orientalis, L. culinaris subsp. odemensis'e transfer edilebilirliğini araştırmaktır. Bunun için kültür mercimeğinde geliştirilen 100 genomik SSR markörü test edilmiştir. Test edilen bu markörlerin yabani mercimek türlerindeki polimorfizm oranları sırasıyla % 41 (L. nigricans), %40 (L. culinaris subsp. tomentosus), %39 (L. culinaris subsp. orientalis), %34 (L. culinaris subsp. odemensis), %34 (L. ervoides) ve %31 (L. lamottei) olarak belirlenmiştir. Polimorfizm gösteren 41 adet markörün %51 (21 adet)'inin ise tüm türlerde ortak polimorfizm göstermiştir. Ortak polimorfizm gösteren bu markörlerin beklenen heterozigotluk (He) oranının ortalama 0.657 olduğu, gözlenen heterozigotluk oranının (Ho) ortalama 0.14 olduğu, polimorfik bilgi içeriği (PIC) değerinin ise, ortalama 0.61 olduğu tespit edilmiştir. Genetik benzerlik analizleri sonucu en yüksek benzerliğin L. culinaris subsp. orientalis ile L. nigricans (%81) türleri arasında olduğu, en düşük benzerliğin ise L. ervoides ile L. nigricans (%10) türleri arasında olduğu görülmüştür. Belirlenen aktarılabilir SSR markörlerinin tür içi veya türler arası çalışmalara, genetik çeşitlilik, gen akışı, filogenetik ve evrimsel ilişkileri araştırmak için bilimsel literatüre katkı sağlayabileceği düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

Simple Sequence Repeats (SSRs), also known as microsatellite markers, are commonly used essential molecular tools for plant genetic and genomic research. However, the development of microsatellites is limited for common use in plants due to high cost and labor requirements. Therefore, determining the transferability of an SSR marker developed in one species to other species or within a species can facilitate genetic and genomic studies. The aim of this study was to determine the transferability of SSR markers developed in cultivated lentil to wild lentil species including L. nigricans, L. lamottei, L. ervoides, L. culinaris subsp. tomentosus, L. culinaris subsp. orientalis, and L. culinaris subsp. odemensis. For this aim, 100 genomic SSR markers developed in cultivated lentil were tested pn wild types. The polymorphism rates of these markers in wild lentil species were determined as 41% (L. nigricans), 40% (L. culinaris subsp. tomentosus), 39% (L. culinaris subsp. orientalis), 34% (L. culinaris subsp. odemensis), 34% (L. ervoides), and 31% (L. lamottei), respectively. Of the 41 markers that showed polymorphism, 51% (21 markers) showed common polymorphism in all species. The expected heterozygosity (He) was determined to be 0.657 on average for these common polymorphic markers, while the observed heterozygosity (Ho) was 0.14 on average. The polymorphic information content (PIC) value was also found to be 0.61 on average. Genetic similarity analysis showed the highest similarity between L. culinaris subsp. orientalis and L. nigricans (81%), while the lowest similarity was between L. ervoides and L. nigricans (10%). The transferable SSR markers identified in this study can contribute to scientific literature on genetic diversity, gene flow, phylogenetic and evolutionary relationships in intra- or inter-specific studies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    297573

    Nohut (Cicer arietinum L.) ve mercimeğin (Lens culinaris Medik.) ilk gelişme dönemlerinde bazı yabancı otların allelopatik etkisi

    Allelopatahic effects of some weeds on the first growing periods of chickpea (Cicer arietinum L.) and lentil (Lens culinaris Medik.)

    MURAT IŞIK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAİME ÜNVER İKİNCİKARAKAYA

  2. Tez No

    305710

    Genetic transformation of lentil (Lens culinaris M. cv. Sultan.1) with a transcription factor regulator (MBF1c) and analysis of transgenic plants

    Mercimeğin (Lens culinaris M. cv. Sultan.1) transkripsiyon faktör regülatör proteini (MBF1c) ile genetik transformasyonu ve transgenik bitkilerin analizi

    HAMDİ KAMÇI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    PROF. DR. MERAL YÜCEL

    YRD. DOÇ. DR. UFK ÇELİKKOL AKÇAY

  3. Tez No

    299445

    SSR markörleri kullanılarak mercimek tür ve çeşitlerinde genetik çeşitliliğe dayalı taksonomik ilişkinin araştırılması

    Taxonomic relationships based on genetic diversity using SSR markers among lentil species (Lens sp.) and cultivars

    MUAZZEZ DERYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyoteknolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAKAN ÖZKAN

  4. Tez No

    757777

    History, time and culture in Peter Ackroyd's Hawksmoor and Edward P. Jones' The Known World

    Peter Ackroyd'un Hawksmoor'unda ve Edward P. Jones'un The Known Worldun'da tarih, zaman ve kültür

    HUDA KHORSHEED MOHAMMED

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    İngiliz Dili ve EdebiyatıKarabük Üniversitesi

    İngiliz Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TAVGAH GHULAM SAEED

  5. Tez No

    902958

    Pirinç ve mercimeğin probiyotik fermente içecek üretiminde potansiyel kullanım olanağının araştırılması

    Investigation of the potential use of rice and lentils in probiotic fermented beverage production

    ZEYNEP KİLCİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Gıda MühendisliğiBursa Uludağ Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ARZU AKPINAR BAYİZİT

Geri Dön