Geri Dön

Investigation of the biofilm formation multiple drug resistance (MDR) Escherichia coli in uropathogenic and related with virulence gene in Baghdad

Bağdat bölgesinde üropatojenik ve virülans geni ile ilişkili Escherichia coli'ni̇n biyofilm oluşumu ve çoklu ilaç direncinin (MDR) araştırılması

  1. Tez No: 823960
  2. Yazar: WEAM JADDOA ABED AL ZAIDI
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKER ŞİMŞEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Biyofilmler, Biofilms
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Vitek 2 sistemi kullanilarak alinan 150 idrar örneğinden 85 inde Escherichia coli teşhisi kondu. Piperasilin/tazobaktam (%77,6), Imipenem (%77,6), Amoksisilin/Klavulanik Asit (%70,5), Sefiksim (%67,1), Tikarsilin-klavulanik asit (%65,8), Sefepim (%64,7), Seftriakson (%64,7), Seftazidim (%62,4), Siprofloksasin (%56,4), Sefotaksim (%52,9), Doksisiklin (%52,9) oranlarında antibiyotiklere dirençli görünmüş; Ampisilin-sulbaktam (%47), Cefoxitin (%45,9), Imipenem+EDTA (%42,4), Netilmisin (%41,2), Meropenem (%41,2), Cefalexin (%38,8), Tobramisin (%37,6), Levofloksasin (%32,9), Kolistin (%18,9), Amikasin (%15,3), Trimetoprim/sülfametoksazol (%8,2) ve Tetrasiklin (%5,9) oranlarında antibiyotiklere karşı düşük direnç göstermiştir. Ayrıca güçlü biyofilm üreten E. coli izolatları %48, orta düzeyde biyofilm üreten izolatlar %32 ve zayıf biyofilm üreten izolatlar %20 olmuştur. E. coli izolatlarında adeS-adeR geni varlığı %100, OmpA/MotB geni %26,7 ve CusE geni %23,3 olarak bulunmuştur. Sonuç olarak, bu çalışma, direnç genlerinin varlığı ile güçlü biyofilm üreten E. coli prevalansını ortaya koymuştur.

Özet (Çeviri)

It was diagnosed Escherichia coli in 85 urine samples out of 150 samples by using by Vitek 2 system. When it was performed the antibiotic resistances test, the results appeared isolates of E. coli were resistant to antibiotics: Piperacillin/tazobactam (77.6%) Imipenem (77.6%),Amoxicillin/Clavulanic Acid (70.5%), Cefixime (67.1%), Ticarcillin-clavulanic acid (65.8%), Cefepime(64.7%), Ceftriaxone (64.7%), Ceftazidime (62.4%), Ciprofloxacin (56.4%), Cefotaxime (52.9%), Doxycycline (52.9%), and low resistance to antibiotics: Ampicillin-sulbactam (47%), Cefoxitin(45.9%), Imipenem+EDTA (42.4%), Netilmicin (41.2%), Meropenem (41.2%), Cefalexin (38.8%), Tobramycin (37.6%), Levofloxacin(32.9%), Colistin (18.9%), Amikacin (15.3%), Trimethoprim/ sulfamethoxazole (8.2%), and Tetracycline (5.9%). Besides, E. coli isolates that produce strong biofilm were 48 %, that produces moderate biofilm was 32%, and the isolates with weak production of biofilm were 20%. The presence of adeS-adeR gene in E. coli isolates was 100%, while OmpA/MotB gene was 26.7% and CusE gene was 23.3%. In conclusion, this study appeared to the prevalence of E. coli that produce strong biofilm with the presence of resistance genes.

Benzer Tezler

  1. Acinetobacter baumannii klinik suşlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin araştırılması

    Investigation of phenotypic and genotypic characteristics of acinetobacter baumannii clinical isolates

    NEZAHAT KOŞAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiHitit Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞE SEMRA GÜRESER

  2. In-Vitro investigation of the efficacy of chitosan-supported metal nanoparticles in the treatment of multidrug-resistant Candida auris

    Çok ilaca dirençli Candida auris tedavisinde kitosan destekli metal nanopartiküllerin etkinliğinin In-Vitro araştırılması

    PELİNSU ARMUTCUOĞLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    MikrobiyolojiKoç Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZLEM DOĞAN URAL

  3. Peltigera cinsine ait liken ve endolikenik fungus örneklerinin pseudomonas aeruginosa üzerine anti-quorum sensing ve anti-biyofilm etkinliklerinin ın vitro ve ın siliko yöntemlerle incelenmesi

    Investigation of anti-quorum sensing and anti-biofilm activities on pseudomonas aeruginosa of peltigera species by lichen and endolichenic fungus specimens in vitro and in silico methods

    ARHUN ALİ BALKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NÜZHET CENK SESAL

    PROF. DR. SERDAR DURDAĞI

  4. Acinetobacter baumannii izolatlarında efflux pompası ve quorum sensing genlerinin araştırılması

    Investigation of efflux pump and quorum sensing genes in acinetobacter baumannii isolates

    EBRU KARADAĞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UĞUR ARSLAN

  5. Klinik örneklerden izole edilen escherichia coli izolatlarının moleküler epidemiyolojik karakterizasyonuve yüksek riskli ST131 klonunun araştırılması

    Molecular epidemiological characterization of escherichia coli isolates isolated from clinical samples and investigation of HİGH-risk ST131 clone

    ELİF AYDIN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELAHATTİN ÇELEBİ