Biyolojik kontrol ajan potansiyeline sahip Trichoderma atroviride'nin F. graminearum üzerinde antagonistik etkisinin transkriptomik analizi
Transcriptomic analysis of antagonistic effect of Trichoderma atroviride that has potential biological control agent on F. graminearum
- Tez No: 825535
- Danışmanlar: PROF. DR. EVRİM KAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Manisa Celal Bayar Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Temel ve Endüstriyel Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Fusarium graminearum arpa, buğday ve mısır gibi ekonomik öneme sahip tahıllarda 'Başak Yanıklığı' hastalığının dünya genelinde majör etmenidir. Bu hastalık mikotoksinlerle kontaminasyon, ürün kalite ve miktarında kayıp ve ekonomik zararlara neden olmaktadır. Dünya genelinde bu hastalıkla mücadelede en yaygın yöntem olarak fungisitler kullanılmaktadır. Ancak gelişen fungisit direnci yeni yaklaşımların uygulanmasını gerekli kılmıştır. Biyokontrol ajanlarının kullanımı bu kapsamda güvenilir, düşük maliyetli ve tekrarlanabilir bir uygulamadır. Trichoderma atroviride dünya genelinde önemli bir biyokontrol ajanıdır. Ancak F. graminearum üzerindeki potansiyel etkilerine dair moleküler bilgiler kısıtlıdır. Bu tezde, T. atroviride'nin F. graminearum üzerindeki etkileri transkript seviyesinde incelenmeye çalışılmıştır. T. atroviride kültürü ile konfronte edilmiş ve edilmemiş F. graminearum kültürleri üzerine antagonizmin, transkriptom seviyelerindeki değişimleri RNA dizileme analizi ile değerlendirilmiştir. Transkriptom analizi sonucunda; F. graminearum kültüründe gen ekspresyonları regüle edilen genlerin olduğu bulunmuştur (p<0,05). Upregüle olan genlerin; yağ asidi biyosentezi, AMP-bağımlı biyosentez, aminoasit tanıma/aktivasyon prosesleri, sekonder metabolit üretimleri ile ilişkili oldukları, downregüle edilen genlerin; aminoasit sentezi, oksidasyon-redüksiyon prosesleri, metal-iyon bağlama ve metabolik/katalitik aktivitelere ilişkin oldukları belirlenmiştir. Transkriptom analizi sonucunda T. atroviride'nin F. graminearum'un primer metabolit sentezini baskılarken, sekonder metabolit üretimine ilişkin genlerde arttırıcı etki görüldüğü belirlenmiştir. Antagonistik aktiviteye sahip bir tür olarak T.atroviride kültürünün, biyolojik kontrol ajanı olarak geliştirilebilecek aday bir fungal organizma potansiyeli taşıdığı ortaya konmuştur.
Özet (Çeviri)
Fusarium graminearum is world-wide known major cause of 'Fusarium Head Blight' disease in many crop plants having economic importance such as barley, wheat and corn. This fungal originated disease of plants also cause devastating losses of quantitative and qualitative due contamination by mycotoxins. The effective way to struggle with fungal diseases of plants have been achieved by the fungicides, mostly. However, disturbing and distributing resistance to these fungucides by the fungal pathogens have necessitated the new challenging methods to struggle. In this context, the use of biocontrol agents offers a way that is more safe, low-cost and reproducible. Trichoderma atroviride is a well-known biocontrol agent in worldwide. As far as we know by the literature, the potential inhibiting activities of its at the molecular level on the disease agents are restricted. In this thesis study, the molecular level effects of T. harzianum on F. graminearum have been investigated due to transcriptomics by the known as most validated RNA-Sequencing method For this investigation; mRNA transcripts of the pathogen that was confronted and unconfronted with T. atroviride cultures were obtained and evaluted. As result of transcriptome of the pathogen culture that was confronted with T. harzianum; many number of genes regulated were identified as up and down (p<0.05). Upregulated genes were found mainly involved in; fatty acid synthesis, AMP-dependent biosynthesis, aminoacid recognition/activation processes and secondary metabolite synthesis, while downregulated genes were involved in mainly aminoacid synthesis, oxidation-reduction processes, metal-ion chelating and metabolic/catabolic activities. It was shown that T. atroviride inhibitingprimary metabolite synthesis of the pathogen while activating the secondary metabolism. By the findings of this study, T. atroviride, as a fungal species with antagonistic activity was proven having a developable potential for biological control agent.
Benzer Tezler
- Biological control of Aspergillus flavus growth and its aflatoxin b1 production by antagonistic yeasts
Antagonistik mayalar ile Aspergillus flavus gelişimi ve aflatoksin b1 üretiminin biyolojik kontrolü
DİLARA NUR DİKMETAŞ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HATİCE FUNDA KARBANCIOĞLU GÜLER
DR. HAYRETTİN ÖZER
- Tasarım alan yolu ile oluşturulan iloprost- termosensitif jelin insan dental pulpa kök hücreleri üzerindeki etkilerinin in-vitro olarak incelenmesi
In vitro study of the effects of iloprost-thermosensitive gel on human dental pulp stem cells
FEYZA IŞIK KABLAN
Doktora
Türkçe
2025
Diş HekimliğiAltınbaş ÜniversitesiÇocuk Diş Hekimliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİGEN SEYMEN
DR. ÖĞR. ÜYESİ ARKAN YASHAR EZZULDDIN BARBAR
- Farklı habitatlardan izole edilen aktinomiset genomlarında yeni ilaç adaylarının taranması
Mining of actinomycete genomes for the discovery of new natural products
SÜLEYMAN ÖZAKIN
- Deneysel spinal kord hasarında oridonin tedavisinin NLRP3 inflamazom kompleksi ve miR-125a-5p ekspresyonu üzerine etkileri
Effects of oridonin treatment on the NLRP3 inflammasome complex and miR-125a-5p expression in experimental spinal cord injury
AMMAR ALNAGEEB
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2026
NöroşirürjiÇukurova ÜniversitesiNöroşirürji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FARUK İLDAN
- Çinko nanotanecik içeren polimer nanokompozit malzeme üretimi ve karakterizasyonu
Fabrication and characterization of polymer nanocomposite materials incorporated zno nanoparticles
ALEV AKBAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SADRİYE KÜÇÜKBAYRAK OSKAY