Geri Dön

Molecular dynamics simulation of water clusters

Başlık çevirisi mevcut değil.

  1. Tez No: 82619
  2. Yazar: EMEL GÜNEYLER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ŞAKİR ERKOÇ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: su topakları, ampirik potansiyel enerji fonksiyonu, moleküler dinamik simülasyonu. iv, water clusters, empirical potential energy function, molecular dynam ics simulation. m
  7. Yıl: 1999
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 90

Özet

öz SU TOPAKLARININ MOLEKÜLER DİNAMİK SİMÜLÂSYONU GÜNEYLER, EMEL Yüksek Lisans, Fizik Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Şakir Erkoç Aralık 1999, 90 sayfa. Su topaklarının, [(H20)n,n = 2-8], lokal minimum geometrileri ve bun lara karşılık gelen enerji değerleri, moleküler dinamik simülâsyon metodu kul lanılarak incelendi. Simülâsyonda, merkezî-kuvvet modelinin iki farklı potan siyel enerji fonksiyonları olan CF ve CF2 kullanıldı. Bu iki ampirik potansiyel enerji fonksiyonlarının etkinliklerinin incelenmesine özel bir önem verildi. CF ve CF2'nin, su topaklarının lokal minimum geometrilerini ve enerjilerini belirlemede iyi çalıştıkları bulundu. CF2 kullanılarak elde edilen, bir su molekülü başına düşen bağlanma enerjisinin, topak büyüklüğüne göre değişimi, literatürle uyum içerisindedir. Diğer yandan, CF ve CF2'nin yüksek sıcaklıklarda iyi çalışmadıkları gözlenmiştir, n = 2, 5 ve 6 için (H2Ö)n topaklarının en kararlı lokal minimum ge ometrileri hakkındaki hatalı öngörüler, bu hesaplamalarda kullanılan potansiyel enerji fonksiyonu CF2'nin açık polarizasyon etkileşme terimleri içermemesinden kaynaklanmaktadır.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION OF WATER CLUSTERS GÜNEYLER, EMEL M.S., Department of Physics Supervisor: Prof. Dr. Şakir Erkoç December 1999, 90 pages. The local minimum geometries and corresponding energy values of water clus ters, [(H20)n,n = 2-8], were investigated by using the molecular dynamics simulation method. In the simulation, two different potential energy functions of central-force model, CF and CF2, have been used. Particular attention was payed to investigate the effectiveness of these two empirical potential energy functions. CF and CF2 have been found to work well in determining local minimum geome tries and energies of water clusters. The variation of binding energy per water molecule with respect to the cluster size obtained by using CF2 is in agreement with the literature. On the other hand, it has been observed that CF and CF2 do not work well at high temperatures. Mispredictions about the most stable local minimum geometries of (#20)n clusters for n = 2, 5 and 6 arise from the fact that the potential function CF2 used for these calculations does not involve explicit polarization interaction terms.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    318162

    HNO3' in katı su kümelerinde ve buz yüzeyindeki solvasyon ve iyonlaşması, ve klor içeren kuvvetli asitlerin solvasyon prosesine etkisi

    Solvation and ionization of HNO3 on/in cold water clusters and ice, and the effect of chlorine containing strong acid on the solvation process

    FATİME MİNE BALCI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    KimyaSüleyman Demirel Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NEVİN AYTEMİZ

  2. Tez No

    431999

    Suyun özelliklerinin teorik bir çalışması: Moleküler kümelerden sıvı yapıya

    A theoretical study of the properties of water: From molecular clusters to liquid structure

    MİNE AK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÖNÜL BAŞAR

    PROF. DR. ZEHRA AKDENİZ

  3. Tez No

    139488

    Molecular simulations of gas transport in copolymers

    Kopolimerlerde gaz taşınımının moleküler simülasyonları

    ESRA KÜÇÜKPINAR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2003

    Kimya MühendisliğiBoğaziçi Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. PEMRA DORUKER TURGUT

  4. Tez No

    683627

    Experimental and computational investigation of clustering behavior of cyclodextrin-perfluorocarbon inclusion complexes through molecular dynamics simulations

    Siklodekstrin-perflorokarbon konuk-konak komplekslerinin kümelenme davranışının deneysel ve moleküler dinamik simülasyonları ile incelenmesi

    BETÜL KAYMAZ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    Biyomühendislikİstanbul Medipol Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YASEMİN YÜKSEL DURMAZ

  5. Tez No

    909008

    Modeling dynein dynamics and its interactions with microtubules and microtubule-associated proteins using molecular dynamics simulations

    Moleküler dinamik simülasyonları kullanarak dinein dinamiğinin ve mikrotübüller ve mikrotübül ilişkili proteinlerle etkileşimlerinin modellenmesi

    MERT GÖLCÜK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    Biyofizikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MERT GÜR

Geri Dön