Molecular dynamics simulation of water clusters
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 82619
- Danışmanlar: PROF. DR. ŞAKİR ERKOÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: su topakları, ampirik potansiyel enerji fonksiyonu, moleküler dinamik simülasyonu. iv, water clusters, empirical potential energy function, molecular dynam ics simulation. m
- Yıl: 1999
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 90
Özet
öz SU TOPAKLARININ MOLEKÜLER DİNAMİK SİMÜLÂSYONU GÜNEYLER, EMEL Yüksek Lisans, Fizik Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Şakir Erkoç Aralık 1999, 90 sayfa. Su topaklarının, [(H20)n,n = 2-8], lokal minimum geometrileri ve bun lara karşılık gelen enerji değerleri, moleküler dinamik simülâsyon metodu kul lanılarak incelendi. Simülâsyonda, merkezî-kuvvet modelinin iki farklı potan siyel enerji fonksiyonları olan CF ve CF2 kullanıldı. Bu iki ampirik potansiyel enerji fonksiyonlarının etkinliklerinin incelenmesine özel bir önem verildi. CF ve CF2'nin, su topaklarının lokal minimum geometrilerini ve enerjilerini belirlemede iyi çalıştıkları bulundu. CF2 kullanılarak elde edilen, bir su molekülü başına düşen bağlanma enerjisinin, topak büyüklüğüne göre değişimi, literatürle uyum içerisindedir. Diğer yandan, CF ve CF2'nin yüksek sıcaklıklarda iyi çalışmadıkları gözlenmiştir, n = 2, 5 ve 6 için (H2Ö)n topaklarının en kararlı lokal minimum ge ometrileri hakkındaki hatalı öngörüler, bu hesaplamalarda kullanılan potansiyel enerji fonksiyonu CF2'nin açık polarizasyon etkileşme terimleri içermemesinden kaynaklanmaktadır.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION OF WATER CLUSTERS GÜNEYLER, EMEL M.S., Department of Physics Supervisor: Prof. Dr. Şakir Erkoç December 1999, 90 pages. The local minimum geometries and corresponding energy values of water clus ters, [(H20)n,n = 2-8], were investigated by using the molecular dynamics simulation method. In the simulation, two different potential energy functions of central-force model, CF and CF2, have been used. Particular attention was payed to investigate the effectiveness of these two empirical potential energy functions. CF and CF2 have been found to work well in determining local minimum geome tries and energies of water clusters. The variation of binding energy per water molecule with respect to the cluster size obtained by using CF2 is in agreement with the literature. On the other hand, it has been observed that CF and CF2 do not work well at high temperatures. Mispredictions about the most stable local minimum geometries of (#20)n clusters for n = 2, 5 and 6 arise from the fact that the potential function CF2 used for these calculations does not involve explicit polarization interaction terms.
Benzer Tezler
- HNO3' in katı su kümelerinde ve buz yüzeyindeki solvasyon ve iyonlaşması, ve klor içeren kuvvetli asitlerin solvasyon prosesine etkisi
Solvation and ionization of HNO3 on/in cold water clusters and ice, and the effect of chlorine containing strong acid on the solvation process
FATİME MİNE BALCI
- Suyun özelliklerinin teorik bir çalışması: Moleküler kümelerden sıvı yapıya
A theoretical study of the properties of water: From molecular clusters to liquid structure
MİNE AK
Doktora
Türkçe
2016
Fizik ve Fizik Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖNÜL BAŞAR
PROF. DR. ZEHRA AKDENİZ
- Molecular simulations of gas transport in copolymers
Kopolimerlerde gaz taşınımının moleküler simülasyonları
ESRA KÜÇÜKPINAR
Doktora
İngilizce
2003
Kimya MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. PEMRA DORUKER TURGUT
- Experimental and computational investigation of clustering behavior of cyclodextrin-perfluorocarbon inclusion complexes through molecular dynamics simulations
Siklodekstrin-perflorokarbon konuk-konak komplekslerinin kümelenme davranışının deneysel ve moleküler dinamik simülasyonları ile incelenmesi
BETÜL KAYMAZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Biyomühendislikİstanbul Medipol ÜniversitesiBiyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN YÜKSEL DURMAZ
- Modeling dynein dynamics and its interactions with microtubules and microtubule-associated proteins using molecular dynamics simulations
Moleküler dinamik simülasyonları kullanarak dinein dinamiğinin ve mikrotübüller ve mikrotübül ilişkili proteinlerle etkileşimlerinin modellenmesi
MERT GÖLCÜK
Doktora
İngilizce
2024
Biyofizikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MERT GÜR