Genetic characterization of ancient charred wheat from the Kaymakçi Archaeological Site
Kaymakçı Arkeolojık alanından alınan antik kömürleşmiş buğday tohumlarının genetik karakterizasyonu
- Tez No: 826572
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEKİ KAYA, DR. ÖĞR. ÜYESİ FUNDA ÖZDEMİR DEĞİRMENCİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Arkeoloji, Biyoloji, Genetik, Archeology, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
Buğday, dünyanın en önemli tarımsal bitkilerinden biridir ve buğdayın evrimsel tarihini anlamak; verimini ve besin kalitesini iyileştirmek için kritik öneme sahiptir. Bu çalışmada, Türkiye'deki, Manisa, Kaymakçı arkeolojik sit alanından çıkarılan kömürleşmiş buğday kalıntılarından izole edilen antik DNA (aDNA) analiz edilmiş ve elde edilen genetik veriler modern buğday çeşitleri ile karşılaştırılmıştır. 26s rDNA ve ITS2 (Internal Transcribed Spacer) bölgeleri, 3,500 yıllık kömürleşmiş buğday tohumlarının moleküler tanımlamasını yapmak için kullanılmıştır, IGS (Intergenic Spacer) bölgesi ise kömürleşmiş buğday tohumlarının genom tipini belirlemek için kullanılmıştır. Buğday gluten genlerinin yüksek moleküler ağırlıklı (HMW) alt birimleri, un kalitesinin temel belirleyicileridir ve bunların evcilleşme geçmişini anlamak, ıslah programlarını iyileştirmek için kritik öneme sahiptir. Bu çalışmanın sonuçları, antik buğday örneklerinde buğday glutenin genlerinin HMW alt birimlerinin genetik çeşitliliğinin binlerce yıldır korunduğunu ortaya çıkardı. Bu bulgular, aDNA araştırmalarının Türkiye'deki buğdayın genetik tarihini aydınlatmada potansiyelini vurgulamaktadır.
Özet (Çeviri)
Wheat is one of the world's most essential crops, and understanding its evolutionary history is critical for improving its yield and nutritional quality. In this study, ancient DNA (aDNA) from wheat remains from Kaymakçı archaeological site, Manisa, Türkiye, was analyzed and compared to modern wheat varieties to investigate the effects of domestication on evolution of wheat. The 26s rDNA and ITS2 (Internal Transcribed Spacer) regions were used to make molecular identification of the 3,500 years old charred wheat seeds, while IGS (Intergenic Spacer) region was used to determine the genome type of the charred wheat seeds. These DNA barcodes revealed previously undetermined Triticum aestivum/durum ancient wheat seeds were T. aestivum. High Molecular Weight (HMW) subunits of wheat glutenin genes were investigated in this study since these genes are essential determinants of flour quality, and understanding their evolution is important for future improvement programs.. Results of this study revealed that the HMW subunits of wheat glutenin genes in ancient samples were highly conserved and that the genetic diversity of these genes has been preserved over thousands of years. These findings underscore the potential of aDNA research in elucidating the genetic history of wheat in Türkiye.
Benzer Tezler
- Characterisation of DNA from archaeological wheat (Triticum L.) seeds from anatolıa
Anadolu kökenli arkeolojik buğday (Triticum L.) tohumlarından elde edilen DNA'nın karekterizasyonu
MEHMET SOMEL
Yüksek Lisans
İngilizce
2003
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYKUT KENCE
PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA
- Türkiye'nin yabani zeytin (Olea europaea subsp. europaea var. sylvestris) populasyonlarındaki genetik çeşitliliğin ITS-1 belirteçleri yardımıyla belirlenmesi ve yaygın olarak kullanılan kültür zeytini (O. europaea subsp. europaea var. europaea) çeşitlerinin bu belirteçlerle karakterizasyonu
Determination of genetic variation in wild olive (Olea europaea L. subsp. europaea var. sylvestris) populations and genetic characterization of commonly used cultivated olives (O. europaea L. subsp. europaea var. europaea) of Turkey by ITS-1 markers
ELÇİN ÇAĞATAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyoistatistikMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. BELGİN GÖÇMEN TAŞKIN
- The nuclear genetic diversity of Turkish native horse breeds and its conservation implications
Türk yerli at ırklarının nükleer genetik çeşitliliği ve koruma alanındaki etkileri
MELİS DENİZCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
BiyoistatistikBoğaziçi ÜniversitesiÇevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
DR. BERRİN ERDAĞ
YRD. DOÇ. DR. İ. RAŞİT BİLGİN
- Eski ve modern ekmeklik buğday çeşitlerinin tarımsal ve kalite özellikleri bakımından genotipik ve fenotipik tanımlanması
Genotypical and phenotypical characterization of old and modern bread wheat cultivars for agronomical and quality traits
MEHMET TEKİN
- Mitokondri (orfB - cox3) ve kloroplast (trnD-TpolyT) organel gen bölgeleri arasındaki dizileri kullanarak Muğla ili anakarası ve adalarındaki yabani zeytin (olea europaea subsp. europaea var. sylvestris) populasyonlarının ve yaygın kültür zeytini (O. europaea subsp. europaea var. europaea) çeşitlerinin moleküler karakterizasyonlarının yapılması
Molecular characterization of wild olive (Olea europaea subsp. europaea var. sylvestris) populations from Muğla province mainland and ıslands and common cultivated olive (O. europaea subsp. europaea var. europaea) varieties by using sequences between mitochondria (orfB- cox3) and chloroplast (trnD- TpolyT) organelle gene regions
ERTUĞRUL GÜNGÖR
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
BiyolojiMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BELGİN GÖÇMEN TAŞKIN