Geri Dön

Klinik açıdan önemli bakteriyel ve fungal patojenlerin DNA'sınıntayinine yönelik nano-polimeraz zincir reaksiyonu (nano-PCR) temelli yöntemlerinin geliştirilmesi

Development of nanoparticle-polymerase chain reaction (nano PCR) based methods for the detection of clinically important bacterial and fungal pathogen's DNA

  1. Tez No: 827071
  2. Yazar: KÜBRA ASLAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. SERAP EVRAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biochemistry, Biotechnology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 123

Özet

Enfeksiyonel hastalıklarda doğru tedavilerin zamanında uygulanabilmesi için hastalığa neden olan patojen mikroorganizmaların erken ve doğru bir şekilde tanımlanması oldukça kritiktir. Genotipik özelliklerden faydalanılarak mikroorganizmaları tür düzeyinde hassas, doğru ve hızlı bir şekilde tanımlamaya olanak sağlayan PCR (Polimeraz Zincir Reaksiyonu) tekniği modern tıp laboratuvarlarının ve klinik mikrobiyolojinin vazgeçilmez bir aracı haline gelmiştir. PCR tekniğinde kalıp DNA'ya erişimin sınırlı, kalıbın yüksek guanin-sitozin oranına sahip olması, reaksiyon içerisinde sekonder yapılaşma gibi yöntemin verimini ve spesifikliğini etkileyen birtakım zorluklar vardır. Bu zorlukları aşmak için PCR programında modifikasyonlar uygulanmış, bileşenlerine ekler yapılmış fakat bu sorunlara evrensel uygulamaya sahip bir çözüm üretilememiştir. Son yıllarda güçlü adsorban ve termal iletkenlik gibi özelliklere sahip nanomalzemeler ile PCR'ın performansını düşüren bu sorunların aşılabileceği yönünde iddialar öne sürülmüştür. Bu tez çalışmasında, klinik açıdan öneme sahip patojenlerin tespiti için geleneksel mikrobiyal tayin yöntemlerine kıyasla daha spesifik, hassas, hızlı ve bunun yanında çoklu analize imkan tanıyan bir PCR yöntemi geliştirildi. Patojenlerin genomlarında korunmuş bölgelerin amplifikasyonu ile birbiri yanında analizi hedeflenirken, nanomalzemelerin çoklu amplifikasyonun gerçekleştiği ortamda reaksiyon verimi üzerine etkisi araştırıldı.

Özet (Çeviri)

Early and precise identification of pathogen microorganisms those causing the disease is very crucial in infectious diseases. By providing sensitive, accurate and fast identification of the microorganism in species level through genotypic characteristics, polymerase chain reaction (PCR) technique has became essential tool in modern medicine laboratories and clinical microbiology. PCR faces certain challenges those affecting PCR effiency and specificity including limited availability of template, high guanin-cytosine content, secondary structure formation. Even though, PCR program modification have been adapted and additives have been used, a solution being universally applicable have not been introduced to overcome these challenges. In recent years, claims have been raised that nanomaterials adhering properties including strong adsorbance and thermal conductivity could be used to overcome these challenges causing decrease in PCR performance. In this thesis study, a PCR technique have been developed which is more spesific, sensitive, faster than conventional microbial identification method and is also offering multiple analysis for the detection of clinically important pathogens. Simultaneous detection of pathogen have been aimed through amplification of conserved region in pathogen's genome, whereas the effect of nanomaterials on the reaction efficiency in multiple amplification setting have been investigated.

Benzer Tezler

  1. Akut lösemili çocuklarda nötropenik ateş ataklarının değerlendirilmesi

    Evaluation of neutropenic fever attacks in children with acute leukemia

    BÜŞRA ÖZYALVAÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HÜSEYİN TOKGÖZ

  2. Klinik açıdan önemli bazı Trichophyton türlerinin hızlı tespiti için Multiplex Real-Time PCR temelli bir yöntem geliştirilmesi

    Developing a method based on Multiplex Real-Time PCR for rapid detection of some Trichophyton species are clinically important

    ARAS FAHRETTİN KORKMAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiTrakya Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BURHAN ŞEN

  3. Kanser hastalarında antineoplastik kemoterapi öncesi ve sonrası boğaz, idrar, gaita kültürleri sonuçlarının değerlendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    RUKİYE KORUR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSelçuk Üniversitesi

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET BİTİRGEN

  4. Renal transplantasyon sonrası üriner sistem infeksiyonları

    Urinary system infections after renal transplantation

    GÜRSEL ERSAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bakanlığı

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. PAŞA GÖKTAŞ

  5. Çocuk aşırı duyarlılık tepkilerinde özgül İgE ve sitokin düzeyleri

    Specific İgE and cytokine levels in childhood hypersensitivity reactions

    SÜLEYMAN ÖNAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    MikrobiyolojiFırat Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. VEDAT BULUT