Nohut (Cicer arietinum L.) bitkisindeDidymella rabiei'ye dayanıklılık ile ilişkiliSNP markörlerinin GWAS analizi kullanılarakbelirlenmesi
Identification of SNP markersassociated with resistance againstDidymella rabiei in chickpea (Ccer arietinum L.)through GWAS
- Tez No: 830966
- Danışmanlar: PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyomühendislik, Genetik, Bioengineering, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 131
Özet
Nohut antraknozu (NA) nohut üretimin alanlarını tehdit eden en büyük problemlerden biridir ve uygun koşullar olması durumunda %100'e varan verim kaybına neden olabilir. Ülkemiz, nohut (Cicer arietinum L.) gen kaynaklarının merkezinde bulunması sebebi ile, yeni dayanıklılık gen kaynaklarını keşfetmek için yüksek potansiyele sahiptir. Bu çalışmada, 189 Cicer arietinum ve 87 Cicer reticulatum ait SNP markörleri GBS yöntemiyle belirlenmiştir. Bu nohut koleksiyonu, ülkemizde yaygın olan ve en agresif Didymella rabiei patotipi olan patotip IV izolatına karşı dayanıklılık seviyeleri belirlenmiştir. Uygulanan GWAS modelleri sonucunda C. arietinum genomunda kromozom 1, 2, 3, 4, 7 ve 8 üzerinde lokalize olan toplam 19 SNP bölgesi, C. reticulatum genomunda kromozom 1, 2, 3, 4, 6, 7 ve 8 üzerinde bulunan toplan 34 SNP bölgesinin NA dayanıklılığı ile ilişkisi belirlenmiştir. C. arietinum genomunda belirlenen SNP bölgelerinde sekizi daha önceki rapor edilirken, onbir tanesi ise NA direnci ile ilişkisi ilk tespit edilen SNP bölgeleridir. C. reticulatum genomunda belirlenen SNP bölgelerinde 6 daha önceki çalışmalarda rapor edilirken, 28 tanesi ise NA direnci ile ilişkisi ilk tespit edilen SNP bölgeleridir. Bu çalışmada tespit edilen bölgeler, NA direnci genetik mekanizmasını aydınlatmak için ileriki çalışmalarda ele alınabileceği gibi yeni bir nohut NA direncinin iyileştirilmesi amacıyla nohut ıslah programlarında da kullanılabilme potansiyelinin yüksek olduğu ön görülmektedir.
Özet (Çeviri)
Ascochyta blight (AB) is one of the major threatening problem in chickpea production areas that can cause yield losses of up to 100%. Thanks to the localization of Turkey at the origin of Cicer spp. gene sources, our country offers a high potential to discover novel sources of resistance against AB. In particular, Cicer reticulatum, has a great potential in combining new gene combinations to improve resistance level in chickpea. In this study, SNP markers were utilized in 189 Cicer arietinum and 87 Cicer reticulatum genotypes to perform GWAS through GBS. The resistance levels against the most aggressive Didymella rabiei pathotype were determined in this chickpea collection. As a result of different GWAS models, a total of 19 SNP regions on chromosomes 1, 2, 3, 4, 7, and 8 in the C. arietinum genome and a total of 34 SNP regions on chromosomes 1, 2, 3, 4, 6, 7, and 8 in the C. reticulatum genome were found to be associated with AB resistance. Eight of the associated SNP regions in the C. arietinum genome had been previously reported, while eleven of them were newly identified regions associated with AB resistance. In the C. reticulatum genome, 6 SNP regions had been previously reported, while 28 of them were considered as novel regions for AB resistance. In the study, these associated SNP regions are expected to be useful not only for elucidating the genetic mechanism of AB resistance but also for utilization in chickpea breeding programs to improve AB resistance in new chickp
Benzer Tezler
- Nohut (Cicer arietinum L.), bakla (Vicia faba L.) ve bezelye (Pisum sativum L.)'de besin elementlerinin verim ve verim unsurları üzerine etkisi
The effect of plant nutrients on the yield and yield components on the chickpea (Cicer arietinum L.), bean (Vicia faba L.) and pea (Pisum sativum L.)
SEVGİ SAYLAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatDicle ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BEHİYE TUBA BİÇER
- Farklı pişirme koşullarının bazı nohut çeşitlerinin fiziksel ve kimyasal özellikleri üzerine etkilerinin araştırılması
Investigation on the effects of different processing methods on physical and chemical properties of chickpeas
ALİME KOPAÇ KORK
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
Gıda MühendisliğiCelal Bayar ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NERİMAN BAĞDATLIOĞLU
- Eskişehir'de farklı ekim şekilleri ve herbisit uygulamalarının nohutta (Cicer arietinum L.) verim ve verim ögelerine etkisi
The effect of different sowing methods and herbicides practice on yield and yield components of chickpea (Cicer arietinum L.) in Eskişehir
YAVUZ KORKMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
ZiraatEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NİHAL KAYAN
- Konya ekolojisinde tarımı yapılan yerel nohut popülasyonları ve çeşitlerin tarımsal, teknolojik ve besinsel karakterlerinin belirlenmesi
Determining agricultural, technological and nutritional characteristics of local populations and varieties of chickpea cultivated in Konya ecology
HAKAN BAYRAK
- In vitro koşullarda siyah ve beyaz nohut (Cicer arietinum L.) genotiplerinde tuz stresinin çimlenme ve büyüme üzerine etkileri
Effects of salt stress on germination and growth of black and white chickpea (Cicer arietinum L.) genotypes under In vitro conditions
FATMA AKIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyoteknolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUHAMMAD ASIM