Geri Dön

Kütle spektrometri yöntemi ile pozitif kan kültürü şişelerinden direkt bakteri identifikasyonunun araştırılması

Investigation of direct bacterial identification from positive blood culture bottles by mass spectrometry method

PDF İndir

  1. Tez No: 836257
  2. Yazar: ŞEYDA DURNA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET KÖROĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: sepsis, kan kültürü, direkt identifikasyon, MALDI-TOF MS, Bakteriler, Enfeksiyonlar, Kütle spektrometri, sepsis, blood culture, direct identification, MALDI-TOF MS, Bacteria, Infections, Mass spectrometry
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sakarya Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Giriş ve amaç: Kan dolaşımı enfeksiyonlarında etken mikroorganizmanın hızlı ve doğru bir şekilde tespit edilmesi tedaviye erken başlanılmasına olanak sağlayacağından hayati önem taşımaktadır. Bu çalışmada kütle spektrometri yöntemi ile pozitif kan kültürü şişelerinden çeşitli ön hazırlıklar yapıldıktan sonra direkt bakteri identifikasyonunun araştırılması amaçlanmıştır. Materyal ve Metot: Bu çalışmada hazırlayıp cihaza yüklediğimiz 40 spike örnek pozitif sinyal verdikten sonra 5 ml kan jelli tüplere alındı. Çeşitli süre ve hızda santrifüj aşamasından geçirilen örnek peletleri ince tahta çubuk yardımıyla MALDI-TOF MS slaytlarında ki kuyucuklara inoküle edilip kuruması beklendi. Kuruduktan sonra üzerlerine 1 µl matriks ilave edildi. Bu karışım da kuruduktan sonra slaytlar cihaza yüklenerek identifikasyon sonuçları değerlendirildi. Bulgular: E. coli suşlarında %80, K. pneumoniae suşlarında %100, A. baumannii suşlarında %66, E. cloacae suşlarında %50, S. aureus suşlarında %66, S. epidermidis suşlarında %66, S. hominis suşlarında %50, S. haemolyticus suşlarında %25, E. faecalis suşlarında %100 koloniden identifikasyon ile uyumlu sonuç elde edilmiştir. Bu sonuçlar doğrultusunda gram negatif bakterilerde %80 uyumlu sonuç görülürken; gram pozitif bakterilerde %45 uyumlu sonuç görülmüştür Sonuç: MALDI-TOF MS ile pozitif kan kültürlerinden yapılan direkt identifikasyon sonucunda gram-negatif bakterilerde %80 başarı elde edilirken farklı yöntemler denenmesine rağmen gram-pozitif bakterilerde bu oran %45 olmuştur. Bu konuda özellikle gram-pozitif bakteriler için geniş ve kapsamlı çalışmalara ihtiyaç vardır.

Özet (Çeviri)

Introduction and aim: Rapid and accurate detection of the causative microorganism in bloodstream infections is of vital importance as it will allow early initiation of treatment. In this study, it was aimed to investigate the direct bacterial identification after various preliminary preparations were made from positive blood culture bottles with mass spectrometry method. Materials and Methods: In this study, 40 pre-prepared spike samples were taken into 5 ml blood gel tubes after giving a positive signal. The sample pellets, which were passed through the centrifugation stage at various times and speeds, were inoculated into the wells in the MALDI-TOF MS slides with the help of a thin wooden rod and waited to dry. After drying, 1 μl of matrix was added to them. After this mixture was dried, the slides were loaded into the device and the identification results were evaluated. Results: Rapid identification results were consistent with the identification from the bakterial colonies with the following ratios: E. coli 80%, K. pneumoniae 100%, A. baumannii 66%, E. cloacae 50%, S. aureus 66%, S. epidermidis 66%, S. hominis 50%, S. haemolyticus 25%, E. faecalis 100%. In line with these results, 80% compatible results were seen in gram-negative bacteria; 45% consistent results were found in gram-positive bacteria Conclusion: As a result of direct identification from positive blood cultures with MALDI-TOF MS, 80% success was achieved in gram-negative bacteria, while this rate was 45% in gram-positive bacteria despite different methods being tried. In this regard, large and comprehensive studies are needed, especially for gram-positive bacteria.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    819713

    Pozitif sinyal veren kan kültür şişelerinden MALDI TOF MS ile direkt tanımlama ve BD Phoenix otomatize sistemi ile direkt antibiyotik duyarlılık testi çalışılması

    Direct identification with MALDI TOF MS and direct antibiotic susceptibility testing with the BD Phoenix automated system from positive blood culture bottles

    GÜLŞAH MİROĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYFER BAKIR

  2. Tez No

    668537

    Kan kültüründen matriks destekli lazer desorpsiyon iyonizasyon uçuş süresi kütle spektrometrisi (MALDI-TOF MS) ile direkt hızlı tanımlama

    Direct rapid identification of blood cultures by matrix-assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS)

    HAZAN ZENGİN CANALP

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BANU BAYRAKTAR

  3. Tez No

    805316

    Doğrudan pozitif kan kültür şişelerinden matriks aracılı lazer dezorpsiyon iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi (MALDI-TOF MS) ile hızlı mikrobiyal tanımlamada farklı yöntemlerin araştırılması

    Investigation of different methods in rapid microbial identification from directly positive blood culture bottles by matrix assisted laser desorption ionization time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS)

    DİLAN KARADAĞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MAHMUT CEM ERGON

  4. Tez No

    946413

    Kan kültüründe üreyen gram-negatif çomakların otomatize sistemlerle tanımlanmadan hızlı antimikrobiyal duyarlılık testi metoduyla üçüncü kuşak sefalosporin, karbapenem ve seftazidim-avibaktam duyarlılığın tespit edilmesi

    Rapid antimicrobial susceptibility testing method for third-generation cephalosporins, carbapenems, and ceftazidime-avibactam susceptibility of gram-negative rods cultured in blood culture without automated identification systems

    MUHAMMED BURAK SEVİNÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SENİHA BAŞARAN

  5. Tez No

    650597

    Kandidemilerin hızlı tanı ve identifikasyonunda direkt kan kültür şişesinden MALDI-TOF MS yöntemi, germ tüp testi ve kan kültüründe pozitifleşme süresinin kıyaslanması

    Rapid detection and identification of candidemia by MALDI-TOF MS, germ tube from blood culture bottles and time to positivity of blood culture

    KEREM YILMAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURTEN ALTANLAR

Geri Dön