Tuzlanmış derilerden zayıf halofil bakterilerin izole edilerek tanımlanması ve biyoteknolojik önemlerinin araştırılması
Identification of slightly halophil bacteria from salted skin and investigation of their biotechnological importance
- Tez No: 838662
- Danışmanlar: DOÇ. DR. PINAR ÇAĞLAYAN, DOÇ. DR. DİDEM BERBER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 157
Özet
Ham deri örnekleri, yüzüldükten sonra mamul deri hâline getirilmediğinde tuzlanarak depolanmaktadır. Derilerin korunmasında kullanılan tuzlar işlem görmemişse, tuzlardaki halofil bakteriler derileri kontamine ederek deri kalitesini düşürmekte ve ekonomik kayıplara sebep olmaktadır. Çalışmamızda tuzlanarak 6 ay 20°C'de depolanmış 10 adet koyun derisi örneğinde bulunan zayıf halofil bakterilerin izole edilerek moleküler olarak tanımlanması, biyoteknolojik açıdan önemli enzimlerinin tespit edilmesi, bakteriyosin üretim kapasitelerinin belirlenmesi ve deri sektöründe kullanılan kimyasal bir maddenin (sodyum dimetilditiyokarbomat) hangi konsantrasyon değerlerinde bu bakterileri inhibe edebildiği araştırılmıştır. Örneklerdeki toplam zayıf halofil, proteolitik ve lipolitik aktivite gösteren zayıf halofil bakteri sayıları sırasıyla 1x104 -4x105 kob/g, 2x103 -4x104 kob/g ve 1x102 -3x104 kob/g olarak saptanmıştır. Örneklerden toplam 20 adet zayıf halofil bakteri izole edilmiştir. İzolatların optimum geliştiği tuz konsantrasyon, sıcaklık ve pH aralıkları sırasıyla %3-5, 37-45 °C ve 7-8 olarak tespit edilmiştir. İzolatların tamamı proteaz, 12 izolat lipaz (%60), 1 izolat üreaz (%5), 17 izolat DNaz (%85), 2 izolat pullulanaz (%10), 9 izolat ksilanaz (%45), 18 izolat selülaz (%90) aktivitesi göstermiştir. Hiçbir izolat amilaz ve β-galaktosidaz aktivitesi göstermemiştir. İzolatların tamamının Gram (+), çomak şekilli, katalaz ve oksidaz pozitif olduğu tespit edilmiştir. İzolatların farklı karbon kaynaklarından (D-ksiloz, D-mannoz, D-riboz, sukroz) asit üretebildiği saptanmıştır. İzolatların derilerin yapısında bulunan amino asitleri (L-alanin, L-sistein, L-glisin, L-treonin) parçalayabildiği tespit edilmiştir. İzolatlar, 16S rRNA dizi analiz sonuçlarına göre Bacillus aerius, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus atrophaeus, Bacillus haynesii, Bacillus kochii, Bacillus mojavensis, Bacillus pumilus, Bacillus rugosus ve Bacillus safensis olarak tanımlanmıştır. Tanımlanan izolatlardan Bacillus aerius bakteri suşu tarafından üretilen bakteriyosinin termostabil yapıda olduğu, yüksek pH ve tuz değerlerinde aktivitesini kaybetmediği, lipaz enzimiyle muamele edildiğinde aktivitesini koruduğu, proteinaz K enzimiyle muamele edildiğinde ise aktivitesini tamamen kaybettiği tespit edilmiştir ve deri endüstrisinde kullanılabilirliği öngörülmüştür. İzolatların deri endüstrisinde yaygın olarak kullanılan sodyum dimetilditiyokarbomat aktif içerikli kimyasal maddeye karşı duyarlılık durumları Kirby-Bauer disk difüzyon metoduyla araştırılmış ve izolatların bu kimyasala karşı duyarlı oldukları tespit edilmiştir. İzolatların belirtilen kimyasala karşı duyarlı olması sebebiyle bu maddenin ilgili bakterilerin inhibisyonu amacıyla deri endüstrisinde kullanılabilme potansiyelinin olduğu düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Rawhide samples are stored in salt curing in cases where they are not turned into finished leather immediately after skinning. If the salts used for the protection of the leather are not processed, the halophilic bacteria found in the salts contaminate the leather, reducing the leather quality and causing economic losses. In the present study, the isolation and molecular identification of slightly halophilic bacteria, determination of their biotechnologically important enzymes, and their bacteriocin production capacity, and their control with a chemical substance (sodium dimethyldithiocarbomate) were investigated in 10 salted sheepskin samples that were stored at 20 °C for 6 months. The total number of slightly halophilic bacteria, proteolytic slightly halophilic bacteria, and lipolytic slightly halophilic bacteria in the samples were determined as 1x104-4x105 CFU/g, 2x103-4x104 CFU/g, and 1x102-3x104 CFU/g, respectively. Twenty slightly halophilic bacteria were isolated from the samples. The optimum salt concentration, temperature and pH ranges at which the isolates grew were 3-5%, 37-45°C, and 7-8, respectively. While all isolates showed protease activity, the number and percentage of isolates showing lipase, urease, DNase, pullulanase, xylanase, and cellulase activities were 12 (60%), 1 (5%), 17 (85%), 2 (10%), 9 (45%), and 18 (90%), respectively. None had amylase and β galactosidase activities. All isolates were Gram (+), rod-shaped, catalase and oxidase positive. The isolates were found to be able to produce acid from different carbon sources (D-xylose, D-mannose, D-ribose, sucrose) and to break down amino acids (L-alanine, L-cysteine, L-glycine, L-threonine) found in the skin structure. According to the results of 16S rRNA sequence analysis, the isolates were identified as Bacillus aerius, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus atrophaeus, Bacillus haynesii, Bacillus kochii, Bacillus mojavensis, Bacillus pumilus, Bacillus rugosus and Bacillus safensis. It has been established that the bacteriocin produced by Bacillus aerius from the identified isolates is resistant to heat, and does not lose its activity at high levels of salt and pH. Conversely, when treated with proteinase K enzyme, it loses its activity entirely but retains its effectiveness when treated with lipase enzyme. Additionally, its potential use within the leather industry has been predicted. The Kirby-Bauer disc diffusion method was used to investigate the susceptibility of the isolates against the chemical substance containing sodium dimethyldithiocarbomate as an active ingredient, which is commonly used in the leather industry. As the isolates exhibited sensitivity to the chemical, it is thought that this substance could be utilized within the leather industry to combat associated bacterial growth.
Benzer Tezler
- Ilımlı halofil bacıllus türlerinden polihidroksialkanoatların üretimi
Production of polyhydroxyalkanoates from moderately halophilic bacillus strains
MELIHA FETAHOVIC
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyokimyaMarmara ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE OGAN
DOÇ. DR. ÖZKAN DANIŞ
- Tornadoes, severe hail, and their environments in Turkey
Türkiye'de hortumlar, şiddetli dolu hadiseleri, ve oluştukları çevre koşulları
ABDULLAH KAHRAMAN
Doktora
İngilizce
2016
Meteorolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMeteoroloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİKDAT KADIOĞLU
- İlköğretim 4. sınıf 'Kesirler' ünitesi için geliştirilen bilgisayar destekli etkinliklerin öğrenci başarı ve tutumuna etkisi
The effect of computer assisted activities developed for 'Fractions' unit of primary school 4 th grade on the academic achievement and attitudes
HİLAL KARAKIŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Eğitim ve ÖğretimBalıkesir ÜniversitesiBilgisayar ve Öğretim Teknolojileri Eğitimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYDIN OKÇU
- Öğretmenlerde tükenmişliğin çeşitli değişkenler açısından incelenmesi: Bir meta analiz çalışması
The examination of teacher burnout in terms of some variables (A meta-analysis study)
YILMAZ İLKER YORULMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Eğitim ve ÖğretimMuğla Sıtkı Koçman ÜniversitesiEğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YAHYA ALTINKURT
- Hydrometeorological aspects and water resources management in the northern part of Libya
Hydrometeorological aspects and water resources management in the northern part of Libya
ALİ GEATH MAHMOUD ELJADİD
Doktora
İngilizce
1997
Meteorolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMetalurji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEKAİ ŞEN