Effect of Lys99Gln and Asp97Gly mutation in lachancea thermotolerance asparaginase active site on substrate affinity
Lachancea thermotolerance asparaginazın aktif bölgesinde Lys99Gln ve Asp97Gly mutasyonunun substrat afinitesi üzerine etkisi
- Tez No: 841126
- Danışmanlar: DOÇ. DR. BARIŞ BİNAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
L-asparaginazlar (L-ASNaz), L-asparajinin L-aspartik asit ve amonyağa dönüşümünü katalize eden baskın L-asparaginaz aktivitesine sahip amidohidrolaz enzimleridir. Ayrıca bazılarının ikincil L-glutaminaz aktivitesi vardır. Bu özellikleri nedeniyle L-asparaginaz, akut lenfoblastik löseminin (ALL) tedavisinde kullanılır. Elspar® ve Erwinaz® L-asparaginazlar ilaç endüstrisinde terapötik ürünler üretmek için yaygın olarak kullanılmaktadır. Ancak aşırı duyarlılık reaksiyonları ticari L-asparaginazların ana sınırlamalarıdır. Bu durum bilim adamlarını yeni kaynaklardan gelecek vaat eden L-asparaginazları aramaya zorladı. Bu nedenle, maya L-ASNazlarının alternatif kaynaklarının araştırılması, toksisitenin azaltılması ve etkinliğin arttırılması konusunda ümit vericidir; yine de bu kaynakların araştırılması sınırlı kalmaktadır. Bu çalışma, sahaya yönelik mutajenezin Lachancea thermotolerance (Lt) LtASNase enzim yapıları üzerindeki etkilerini incelemektedir. Enzimin Lys99Gln ve Asp97Gly bölgelerine odaklanan çalışmada KM ve kcat değerleri elde edilerek yabani tip enzimle karşılaştırıldı. Modelleme çalışması için SwissModel kullanılmıştır. Mutant ve yabani tipin kinetik özellikleri incelendiğinde Lys99Gln LtASNase'nin yabani tipe göre daha yüksek KM ve daha düşük kcat'a sahip olduğu görüldü. Asp97Gly mutasyonu kinetik parametreleri tahmin etmek için çok düşük aktiviteye sahiptir. Bu çalışma LtASNase enziminin yapısını ve etkileşimlerini aydınlatmak için önemli bir adım oluşturmaktadır. Yukarıda bahsedilen mutant enzim kinetiği çalışmalarına ek olarak depolama aktivitesi çalışmaları da yapılmıştır. Yapılan deneyler sonucunda depolama süresi arttıkça enzimin bağıl aktivitesinin azaldığı, en uygun saklama sıcaklığının -80°C olduğu sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
L-asparaginases (L-ASNase) are amidohydrolase enzymes which have a predominant L-asparaginase activity that catalyzes the conversion of L-asparagine to L-aspartic acid and ammonia. Also, some of them have secondary L-glutaminase activity. For this properties L-asparaginase is used to treat acute lymphoblastic leukemia (ALL). Elspar® and Erwinaz® L-asparaginases are widely used in the pharmaceutical industry to produce therapeutic products. But the hypersensitivity reactions are the main limitations of commercial L-asparaginases. This situation has forced scientists to search for promising L-asparaginases from new sources. Hence, the exploration of alternate sources of yeast L-ASNases holds promise in mitigating toxicity and improving efficacy; nevertheless, the investigation of these sources remains limited. This study examines the effects of site-directed mutagenesis on LtASNase enzyme structures from Lachancea thermotolerance (Lt). In the study focusing on the Lys99Gln and Asp97Gly regions of the enzyme, KM and kcat values were obtained and compared with the wild-type enzyme. SwissModel was used for the modelling study. When mutant and wild-type kinetic characteristics were examined, Lys99Gln LtASNase has a higher KM and lower kcat than wild-type. The Asp97Gly mutation has too low activity to estimate kinetic parameters. This study constitutes an important step for elucidating the LtASNase enzyme structure and interactions. In addition to the mutant enzyme kinetic studies mentioned above, storage activity studies were also carried out. As a result of the experiments, it was concluded that as the storage time increased, the relative activity of the enzyme decreased, and the most suitable storage temperature was -80°C.
Benzer Tezler
- Gastrointestinal adenokarsinomaları ile bazı dna onarım genleri arasındaki ilişkinin araştırılması
The investigation of the association between gastrointestinal adenocarcinomas and some dna repair genes
AYŞE BAŞAK ENGİN
Doktora
Türkçe
2008
Eczacılık ve FarmakolojiGazi ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ ESAT KARAKAYA
- Development of a novel L-asparaginase enzyme for acute lymphoblastic leukemia therapy
Akut lenfoblastik lösemi hastalığına yönelik yeni bir L-asparajinaz enziminin geliştirilmesi
BERİN YILMAZER AKTAR
Doktora
İngilizce
2024
GenetikGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BARIŞ BİNAY
- Effect of chymotrypsin on M1 type pyruvate kinase from rabbit muscle and L-type from sheep liver
Başlık çevirisi yok
NİLAY BAŞARAN
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MERAL YÜCEL
- Effect of metal surface coating on the moisture absorption characteristics of cfrp
Başlık çevirisi yok
SELMA ŞİMŞEK
- Effect of membrane fluidity on binding of 125I-Insulin to sheep liver membrane receptors
Başlık çevirisi yok
HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM