Geri Dön

Investigation of oxa type genes in multidrug resistant Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infections in Baghdad

Bağdat'ta idrar yolu enfeksiyonlu hastalardan izole edilen çoklu ilaç dirençli Escherichia coli'de oxa türü genlerin incelenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 846135
  2. Yazar: MUNA MAJEED ALI AL-MUSAWI
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. ŞİNASİ AŞKAR, DR. ÖĞR. ÜYESİ DUNYA JAWAD RİDH AL-FAILY
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 56

Özet

Yaygın olarak E. coli olarak bilinen Escherichia coli, idrar yolu enfeksiyonlarının önde gelen etkeni olarak karşımıza çıkmaktadır. Bu araştırmanın temel amacı, idrar yollarında iltihaplanmaya neden olan E. coli'nin patojenik suşlarını titizlikle izole etmektir. Araştırma, bu suşların spesifik kemoterapötik ajanlara, özellikle de oksa tipi gene bağlı olanlara karşı direncini kapsamlı bir şekilde değerlendirmeyi amaçlıyor. Gelişmiş Vitek 2 kompakt teknolojisi kullanılarak 150 idrar örneğinin incelenmesinde 75 örnekte E. coli tespit edildi. İzole edilen E. coli suşları, çeşitli antibiyotiklere karşı önemli direnç gösterdi. Amoksisilin/Klavulanik Asit (%90,7), Piperasilin/tazobaktam (%86,7), İmipenem (%86,7), Tikarsilin-klavulanik asit (%74,7), Meropenem (%73,3), Ampisilin dahil olmak üzere çeşitli antibiyotikler için direnç yüzdeleri oldukça yüksekti. -sulbaktam (%66,7), Sefepim (%66,7), Seftriakson (%66,7), Sefiksim (%62,7), Seftazidime (%62,7), Sefoksitin (%60), Siprofloksasin (%60), Doksisiklin (%56) ve Sefotaksim (%54,6). Bunun tersine, direnç, İmipenem+EDTA (%45,3), Sefaleksin (%40), Tobramisin (%33,3), Levofloksasin (%33,3), Amikasin (%22,6), Kolistin (%16), Tetrasikline (%9,3) karşı nispeten daha düşüktü. ve Trimetoprim/sülfametoksazol (%9,3). Ayrıca çalışma, E. coli'nin biyofilm üretimi açısından dikkate değer bir kapasitesini ortaya çıkardı. Suşların %44,4'ü güçlü biyofilm üreticisi, %31,1'i orta ve %24,4'ü zayıf biyofilm üreticisi olarak sınıflandırıldı. Araştırma aynı zamanda direnç genlerinin varlığını da gün ışığına çıkardı; suşların %10'u OXA-23 genini, %13,3'ü OXA-24 genini ve %33,3'ü OXA-69 genini barındırıyordu. Bu çalışma, güçlü biyofilm üretimi ve direnç genlerinin varlığı ile karakterize edilen E. coli suşlarının yaygınlığının altını çizerek, idrar yolu enfeksiyonları bağlamında antibiyotik direncinin ortaya çıkardığı zorlu zorluklara dair önemli bilgiler sunmaktadır.

Özet (Çeviri)

Escherichia coli, commonly known as E. coli, emerges as the predominant causative agent in urinary tract infections. The primary objective of this research is to meticulously isolate pathogenic strains of E. coli responsible for inducing inflammation in the urinary tract. The investigation aims to comprehensively evaluate the resistance of these strains to specific chemotherapeutic agents, particularly those linked to the oxa-type gene. In the examination of 150 urine samples, E. coli was discerned in 75 samples using the advanced Vitek 2 compact technology. The isolated strains of E. coli exhibited substantial resistance to a spectrum of antibiotics. The resistance percentages were notably high for various antibiotics, including Amoxicillin/Clavulanic Acid (90.7%), Piperacillin/tazobactam (86.7%), Imipenem (86.7%), Ticarcillin-clavulanic acid (74.7%), Meropenem (73.3%), Ampicillin-sulbactam (66.7%), Cefepime (66.7%), Ceftriaxone (66.7%), Cefixime (62.7%), Ceftazidime (62.7%), Cefoxitin (60%), Ciprofloxacin (60%), Doxycycline (56%), and Cefotaxime (54.6%). Conversely, resistance was comparatively lower against Imipenem+EDTA (45.3%), Cefalexin (40%), Tobramycin (33.3%), Levofloxacin (33.3%), Amikacin (22.6%), Colistin (16%), Tetracycline (9.3%), and Trimethoprim/sulfamethoxazole (9.3%). Moreover, the study uncovered a notable capacity of E. coli for biofilm production. Among the strains, 44.4% were classified as strong biofilm producers, 31.1% as moderate, and 24.4% as weak. The investigation also brought to light the presence of resistance genes, with 10% of the strains harboring the OXA-23 gene, 13.3% containing the OXA-24 gene, and 33.3% possessing the OXA-69 gene. This study underscores the prevalence of E. coli strains characterized by robust biofilm production and the existence of resistance genes, offering crucial insights into the formidable challenges posed by antibiotic resistance in the context of urinary tract infections.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    820733

    Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae klinik izolatlarında antibiyotik direnç genlerinin araştırılması

    Investigation of antibiotic resistance genes in clinical insulations of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae

    FATMA KAVALCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YEŞİM AKTÜRK DİZMAN

  2. Tez No

    336644

    Klinik Acinetobacter baumannii izolatlarında direnç genlerinin moleküler yöntemlerle araştırılması

    Investigation of resistance genes by molecular methods in clinical isolates of Acinetobacter baumannii

    GÜLŞAH AŞIK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MikrobiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İHSAN HAKKI ÇİFTCİ

  3. Tez No

    347721

    Acinetobacter baumannii suşlarında OXA-23 ve OXA-58 tipi genişlemiş spektrumlu Beta laktamaz varlığının araştırılması ve PFGE yöntemi ile klonal yakınlığının incelenmesi

    Detection of extended spectrum Beta lactamase type OXA-23 ve OXA-58 from the acinetobacter baumannii species and investigation of clonal relationship by PFGE

    ŞERAFETTİN KEYİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    MikrobiyolojiSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. UĞUR ARSLAN

  4. Tez No

    452396

    Hastane enfeksiyonu etkeni olan karbapenem dirençli A. calcoaceticus-A. baumannii kompleks izolatlarındaki yaygın karbapenemaz genlerinin in house multipleks PCR ile araştırılması ve metallobetalaktamaz üretiminin fenotipik yöntemle saptanması

    Investigation of the extensive carbapenemase genes in carbapenem resistant A. calcoaceticus-A. baumannii complex isolates that the cause of nosocomial infections by in house multiplex PCR and detection of metallobetalactamase production by phenotypic method

    HİLAL BÖLÜKBAŞI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ KUDRET ADİLOĞLU

    UZMAN UFUK ÖNDE

  5. Tez No

    496742

    Çeşitli klinik örneklerden izole edilen enterobacteriaceae türlerinde karbapenemaz varlığının fenotipik olarak araştırılması

    Phenotypic investigation of carbapenemase in enterobacteriaceae species isolated from various clinical specimens

    KÜBRA ALAY KARA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUHAMMET HAMİDULLAH UYANIK

Geri Dön