Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae klinik izolatlarında antibiyotik direnç genlerinin araştırılması
Investigation of antibiotic resistance genes in clinical insulations of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae
- Tez No: 820733
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ YEŞİM AKTÜRK DİZMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 92
Özet
Enterobacteriaceae'de β-laktamlara karşı direnç dünya çapında artmaktadır. Bu çalışma, 50 klinik Echerichia coli ve 47 klinik Klebsiella pneumoniae izolatında antibiyotik direnç genlerinin sıklığını ve antibiyotik direnç oranlarını belirlemeyi amaçlamıştır. Antibiyotik duyarlılık testi için 24 farklı antibiyotik kullanıldı. Bakteri izolatlarının (sırasıyla E. coli ve K. pneumoniae) antibiyotiklere direnç profilleri sefiksim (%80-97,7), piperasilin/tazobaktam (%20-97,7), ampisilin (%100), seftriakson (%98-91,1), sefuroksim (%100-97,7), sefuroksim aksetil (%100-97,7), siprofloksasin (%76-100), fosfomisin (%6-35,7), gentamisin (%38-26,6), ertapenem (%26-22,2) ve seftazidim (%80-95,5) olarak tespit edildi. Trimetoprim/sulfametaksazola karşı sadece K. pneumonia'da %76,5 direnç gözlendi. E. coli ve Klebsiella pneumoniae izolatlarında çoklu ilaç direnç oranları sırasıyla %42 ve %42,2 olarak belirlendi. blaCTX-M1, blaTEM, blaKPC, blaGES, blaSHV, blaVIM, blaPER-2, blaVEB, blaIMP, blaCMY-2, blaCTX-M2, blaMOX, blaFOX, blaDHA, blaMIR, blaMCR-1 qnrS, qnrA, qnrB, fosA, fosC2, fosA3, murA, uhpT, glpT genleri PZR ile tespit edildi. blaOXA-51, blaOXA-23, blaOXA-48 ve blaOXA-24 benzeri genlerin tespiti için multipleks PZR kullanıldı. Multipleks PZR'da, bir E. coli suşunun blaOXA-51, 5 K. pneumoniae suşunun blaOXA-48 taşıdığı tespit edildi. Hiçbir izolatta OXA-23 ve OXA-24 tipi karbapenemaz tespit edilmemiştir. CTX-M1 tipi beta laktamazlar 14 izolatta ve TEM tipi beta laktamazlar 10 izolatta tespit edildi. Diğer direnç genleri hiçbir izolatta tespit edilmedi. Bu sonuçlar, CTX-M1 beta laktamazın, genişlemiş spektrumlu beta laktamaz üreten E. coli ve K. pneumoniae suşları arasında en yaygın A sınıfı beta laktamaz türü olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Resistance to β-lactams in Enterobacteriaceae has been increasing worldwide. This study has aimed to determine the frequency of antibiotic resistance genes and antibiotic resistance rates in 50 clinical E.coli and 47 clinical Klebsiella pneumoniae isolates. 24 different antibiotics were used for antibiotic susceptibility testing. Antibiotic resistance profiles of bacterial isolates (E.coli and Klebsiella pneumoniae, respectively), cefixime (80%-97.7%), piperacillin/tazobactam (20%-97.7%), ampicillin (100%-100%), ceftriaxone (98%-91.1%), cefuroxime (100%-97.7%), cefuroxime axetil (100%-97.7%), ciprofloxacin (76%-100%), fosfomycin (6%-35.7%), gentamicin (38%-26.6%), ertapenem (26%-22.2%) and ceftazidime (80%-95.5%). Trimethoprim/sulfamethoxazole resistance in Klebsiella pneumoniae was detected as 76.5%. Multi-drug resistance rates in E.coli and Klebsiella pneumoniae isolates were determined as 42% and 42.2%, respectively. Multiplex PCR was used to detect blaOXA-51, blaOXA-23, blaOXA-48 and blaOXA-24 like genes. blaCTX-M1, blaTEM, blaKPC, blaGES, blaSHV, blaVIM, blaPER-2, blaVEB, blaIMP, blaCMY-2, blaCTX-M2, blaMOX, blaFOX, blaDHA, blaMIR, blaMCR-1, qnrS, qnrA, qnrB, fosA, fosC2, fosA3, murA, uhpT, glpT genes, detected by PCR. In multiplex PCR, one E.coli strain was found to carry blaOXA-51, and 5 Klebsiella pneumoniae strains, to carry blaOXA-48. OXA-23 and OXA-24 type carbapenemases were not detected in any of the isolates. CTX-M1 type beta lactamases were detected in 14 isolates and TEM type beta lactamases, in 10 isolates. Other resistance genes were not detected in any isolate. These results indicate that CTX-M1 beta-lactamase is the most common type of class A beta-lactamase among extended-spectrum beta-lactamase producing E. coli and Klebsiella pneumoniae strains.
Benzer Tezler
- Genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz üreten escherichia coli ve klebsiella SPP. izolatlarının ertapenem, meropenem, imipenem, kolistin, fosfomisin ve temosilin'e fenotipik duyarlılığının belirlenmesi ve direnç genlerinin in house PCR yöntemiyle araştırılması
Determination of phenotypic susceptibility to ertapenem, meropenem, imipenem, colistin, fosfomycin and temocillin in which producing extended spectrum beta-lactamase isolates of eschericha coli and klebsiella spp. and investigation of resistance genes by in house pcr method
ARZU TANRIVERDİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
MikrobiyolojiAdıyaman ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLNUR TARHAN
- Ventilatör ilişkili pnömoni olgularındaki bakteriyel patojenler; direnç profillerinin moleküler değerlendirilmesi
Bacterial pathogens in ventilator-associated pneumonia; molecular assessment of resistance profiles
BESİM ÇAM
Doktora
Türkçe
2025
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ LOKMAN HİZMALİ
- Karaciğer nakli yapılan hastaların kan kültüründe üreyen karbapenem dirençli enterobacteriacea suşlarında fosfomisin duyarlılığı ve fosfomisin direnç genlerinin araştırılması
Investigation of phosphomycin sensitivity and phosphomycin resistance genes in carbapenem-resistant enterobacteriacea strains in the blood culture of liver transplant patients
YAKUP GEZER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİnönü ÜniversitesiKlinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAŞAR BAYINDIR
- Molecular identification and antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli isolated in urine cultures from Shamiya State Hospital (Iraq)
Şamiye Devlet Hastanesi (Irak) idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli'nin moleküler tanımlanması ve antimikrobiyal direnç profilleri
ALI HAMEED NEAMAH ALHUSSEINI
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
MikrobiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK
- Molecular identification of extended-spectrum beta-lactamase and aminoglycoside-modifying enzyme genes among lactose-fermenting enterobacteriaceae clinical isolates
Laktoz fermente eden enterobacteriaceae klinik izolatlarında geniş spektrumlu beta-laktamaz ve aminoglikozid modifiye edici enzim genlerinin moleküler tanımlanması
NOOR RADHWAN ABDULKADHIM ALBUNSRALLA
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDURRAHMAN AYVAZ
DOÇ. DR. PINAR SAĞIROĞLU