Klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli Klebsiella pneumoniae suşlarında antibiyotik kombinasyonlarının İn Vitro etkinliğinin araştırılması
Investigation of the In Vitro effectiveness of antibiotic combinations on carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae strains isolated from clinical samples
- Tez No: 846482
- Danışmanlar: PROF. MÜCAHİDE ESRA KOÇOĞLU
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Medeniyet Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Hastanemizden izole edilen karbapenem dirençli K. pneumoniae izolatlarında seftazidim-avibaktam ve fosfomisine direnç oranlarının belirlenmesi, karbapenem direnç genlerinin varlığının incelenmesi ve seftazidim-avibaktama dirençli izolatlarda seftazidim-avibaktamın fosfomisin ve meropenem ile kombinasyonlarının sinerjik etkisinin araştırılması amaçlanmıştır. Göztepe Prof. Dr. Süleyman Yalçın Şehir Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarına gönderilen 01.10.2019-31.07.2023 tarihleri arasında çeşitli klinik örneklerden izole edilen ve VITEK 2 otomatize sistemi ile karbapeneme dirençli bulunan 100 K. pneumoniae izolatı çalışmaya dahil edildi. İzolatların karbapenem direnç genleri (blaKPC, blaNDM, blaOXA-48,blaVIM, blaIMP, blaOXA-51, blaOXA-23/OXA-58) multipleks polimeraz zincir reaksiyonu ile araştırıldı. Fosfomisin duyarlılığının belirlenmesi için agar dilüsyon yöntemi, meropenem ve seftazidim-avibaktam duyarlılığının belirlenmesi için ise sıvı mikrodilüsyon yöntemi kullanıldı. Seftazidim-avibaktam dirençli 15 karbapenem dirençli K. pneumoniae suşunda seftazidim-avibaktam ile meropenem ve seftazidim-avibaktam ile fosfomisin kombinasyonları dama tahtası yöntemi ile çalışıldı. Hesaplanan fraksiyonel inhibitör konsantrasyon indeksi (ΣFİK) sonucuna göre kombinasyonların in vitro sinerjik etkisi analiz edildi. Karbapenem dirençli 100 K. pneumoniae izolatının %15'i seftazidim-avibaktama dirençli, %38'i fosfomisine dirençli bulunmuştur. Çalışmamıza dahil edilen karbapenem dirençli K. pneumoniae izolatların 85'inde karbapenem direnç genlerinden en az biri saptanmıştır. Çalışılan izolatların %39'unun OXA-48, %10'unun KPC, %2'sinin NDM ve %1'inin OXA-51 olmak üzere 52 izolatın direnç genlerinden sadece birini taşıdıkları, %17'sinin OXA-48+KPC, %9'unun OXA-48+NDM, %3'ünün OXA-48+NDM+KPC, %2'sinin OXA-48+OXA-51, %1'inin OXA-48+OXA-23/58, %1'inin OXA-48+OXA-51+KPC taşıdığı tespit edilmiştir. İzolatların hiçbirinde IMP ve VIM enzimi saptanmamıştır. Onbeş seftazidim-avibaktam dirençli izolatın dama tahtası yöntemiyle yapılan seftazidim-avibaktam ile meropenem kombinasyonunda %100 kısmi sinerjistik etki bulunurken, seftazidim-avibaktam ile fosfomisin kombinasyonunda %33 kısmi sinerjistik etki bulunmuştur. Hastanemizde karbapenem dirençli K. pneumoniae izolatlarında OXA-48 geni yaygın olup, %33 oranında birden fazla direnç genine sahip izolat saptandı. Seftazidim-avibaktam dirençli olan ve kombinasyon testine tabi tutulan suşların 14'ü NDM geni taşımaktaydı. Sadece bir tane dirençli suşun direnç paterni tespit edilemedi. Seftazidim-avibaktam dirençli suşların tamamında meropenemli kombinasyonda kısmi sinerjik etki saptanırken fosfomisinli kombinasyonda suşların beşinde (%33) kısmi sinerjik etki saptandı. Seftazidim-avibaktamın fosfomisin ile kombinasyonundan ziyade meropenem ile kombinasyonu ciddi karbapenem dirençli K. pneumoniae enfeksiyonlarında bir tedavi seçeneği olarak önerilebilir. İn vitro çalışmayla elde ettiğimiz sonuçlarımız, in vivo ve klinik çalışmalar ile de desteklenmelidir.
Özet (Çeviri)
It was aimed to determine the resistance rates to ceftazidime-avibactam and fosfomycin in carbapenem-resistant K. pneumoniae isolates isolated from our hospital, to examine the presence of carbapenem resistance genes, and to investigate the synergistic effect of combinations of ceftazidime-avibactam with fosfomycin and meropenem in ceftazidime-avibactam -resistant isolates. Between 01.10.2019 and 31.07.2023, 100 K. pneumoniae isolates isolated from various clinical specimens at Göztepe Prof. Dr. Süleyman Yalçın City Hospital Medical Microbiology Laboratory and found carbapenem-resistant by VITEK 2 automated system were included in the study. Carbapenem resistance genes of the isolates (blaKPC, blaNDM, blaOXA-48, blaVIM, blaIMP, blaOXA-51, blaOXA-23/58) were investigated by multiplex polymerase chain reaction. The agar dilution method was used to determine fosfomycin sensitivity, and the broth microdilution method was used to determine meropenem and ceftazidime avibactam sensitivity. Combinations of ceftazidime-avibactam with meropenem and ceftazidime-avibactam with fosfomycin were studied using the checkerboard method in 15 ceftazidime-avibactam-resistant carbapenem-resistant K. pneumoniae strains. The in vitro synergistic effect of the combinations was analysed according to the calculated fractional inhibitory concentration index (ΣFIC). Of 100 carbapenem-resistant K. pneumoniae isolates, 15% were resistant to ceftazidime-avibactam and 38% were resistant to fosfomycin. At least one of the carbapenem resistance genes was detected in 85 of the carbapenem resistant K. pneumoniae isolates included in our study. Of the 52 isolates, 39% carried OXA-48, 10% carried KPC, 2% carried NDM and 1% carried OXA-51. It was determined that 17% carried OXA-48+KPC, 9% carried OXA-48+NDM, 3% carried OXA-48+NDM+KPC, 2% carried OXA-48+OXA-51, 1% carried OXA-48+OXA-23/58, 1% carried OXA-48+OXA-51+KPC. IMP and VIM enzymes were not detected in any of the isolates. While a 100% partial synergistic effect was found in the combination of ceftazidime-avibactam and meropenem made by the checkerboard method on fifteen ceftazidime-avibactam resistant isolates, a 33% partial synergistic effect was found in the combination of ceftazidime-avibactam and fosfomycin. The OXA-48 gene is common in carbapenem-resistant K. pneumoniae isolates in our hospital, and 33% of isolates with more than one resistance gene were detected. 14 of the isolates resistant to ceftazidime-avibactam and subjected to combination testing carried the NDM gene. The resistance pattern of only one resistant strain could not be detected. While a partial synergistic effect was detected in the combination with meropenem in all ceftazidime-avibactam-resistant strains, a partial synergistic effect was detected in five (33%) of the strains in the combination with fosfomycin. The combination of ceftazidime-avibactam with meropenem rather than with fosfomycin may be recommended as a treatment option for severe carbapenem-resistant K. pneumoniae infections. Our results obtained by in vitro study should be supported by in vivo and clinical studies.
Benzer Tezler
- Karbapenem dirençli klebsiella pneumoniae suşlarında çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının etkinliğinin araştırılması
Evaluation of the efficacy of various antibiotic combinations against carbapenem resistant klebsiella pneumoniae strains
MERVE KÖLE
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
MikrobiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMEL SESLİ ÇETİN
- Farklı klinik numunelerden izole edilen e. coli ve klebsiella pneumoniae suşlarında karbapenem, kinolon, kolistin direncinin araştırılması ve karbapenem dirençli suşlarda multipleks pcr yöntemi ile kpc, ndm, vım, oxa-48, ımp-1 genlerin tespiti
An investigation of carbapenem, quinolone and colistin resistance in e. coli and klebsiella pneumoniae strains isolated from different clinical samples and detection of kpc, ndm, vim, oxa-48, imp-1 genes by multiplex pcr in carbapenem-resistant strains.
ÖZGE ALKAN BİLİK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
MikrobiyolojiHarran ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET BAYRAKTAR
- Karbapenemaz üreten enterobacterıaceae kökenlerinde çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının in vitro etkinliklerinin araştırılması
In vitro evaluation of various antibiotic combinations for carbapenemase-producing enterobacteriaceae
ÜMİT KILIÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
MikrobiyolojiSakarya ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ALTINDİŞ
- Escherichia coli ve klebsiella pneumoniae izolatlarında karbapenem direnci ve dirençten sorumlu enzimlerin araştırılması
Investigation of carbapenem resistance and responsible enzymes in escherichia coli and klebsiella pneumoniae isolates
ÖZLEM ALBAYRAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
MikrobiyolojiAfyon Kocatepe ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BEYTULLAH KENAR
- Klebsiella pneumoniae izolatlarında kolistin direncinin farklı yöntemlerle belirlenerek MCR direnç genlerinin araştırılması
Investigation of MCR resistance genes by determining colistin resistance in Klebsiella pneumoniae isolats by different methods
KÜBRA NUR TUTAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET PARLAK
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞE ÖZKAÇMAZ