Geri Dön

Farklı klinik numunelerden izole edilen e. coli ve klebsiella pneumoniae suşlarında karbapenem, kinolon, kolistin direncinin araştırılması ve karbapenem dirençli suşlarda multipleks pcr yöntemi ile kpc, ndm, vım, oxa-48, ımp-1 genlerin tespiti

An investigation of carbapenem, quinolone and colistin resistance in e. coli and klebsiella pneumoniae strains isolated from different clinical samples and detection of kpc, ndm, vim, oxa-48, imp-1 genes by multiplex pcr in carbapenem-resistant strains.

PDF İndir

  1. Tez No: 494712
  2. Yazar: ÖZGE ALKAN BİLİK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET BAYRAKTAR
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2017
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Harran Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 130

Özet

Amaç: Karbapenem dirençli Enterobacteriaceae (KDE) sınırlı tedavi seçenekleri ile ciddi ve hayatı tehdit eden enfeksiyonlara neden olur. Karbapenem direncinin en sık nedeni karbapenem hidrolizi yapan karbapenemazlardır. A sınıfı (KPC), B sınıfı (IMP, VIM, NDM) ve D sınıfı (OXA-48) karbapenemazlar en sık saptananlardır. Bu çalışma ile Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesinde çeşitli klinik örneklerden izole edilen E. coli ve K. pneumoniae suşlarında bazı antibiyotik direnç oranlarını belirlemek, fenotipik ve moleküler yöntemlerle karbapenem direnç mekanizmalarını göstermek amaçlandı. Gereç ve Yöntem: Çalışma, retrospektif veri analizi ve karbapenem direnç mekanizmalarının gösterilmesi olmak üzere iki aşamada planlandı. Çalışmanın retrospektif ayağında; Temmuz 2016- Temmuz 2017 tarihleri arasında Dicle Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi klinik ve yoğun bakımlardan bakteriyoloji laboratuvarına gönderilen çeşitli klinik örneklerden izole edilen 922 E. coli ve 564 K. pneumoniae izolatı olmak üzere toplam 1486 izolatın antibiyotik duyarlılık profilleri incelendi. İkinci aşamada, PhoenixTM 100 (Becton-Dickinson, ABD) otomatize sistemi ile karbapenemlerden biri veya birkaçına orta dirençli veya dirençli bulunan izolatlardan 15 E. coli, 74 K. pneumoniae olmak üzere toplam 89 KDE izolatı çalışmaya dahil edildi. İzolatların antibiyotik duyarlılıkları Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile de değerlendirildi. Karbapenemazların fenotipik yolla saptanması için Modifiye Hodge testi, kombinasyon disk testi (KDT) ve çift disk sinerji testi çalışıldı. KPC, NDM, VIM, OXA-48 ve IMP-1 karbapenemaz genlerini saptamak için Xpert Carba-R (Cepheid, ABD) multiplex PCR sistemi kullanıldı. Bulgular: Ertapenem, imipenem, meropenem, siprofloksasin ve kolistin direnci E. coli suşlarında sırasıyla %20,9, %7,4, %6,7, %52,4 ve %2,7 olarak; K. pneumoniae suşlarında ise sırasıyla %52,8, %38,4, %32,8, %63,3 ve %23,2 olarak saptandı. Toplam 193 (% 20,9) E. coli ve 298 (% 52,8) K. pneumoniae izolatı karbapenemlerden en az birine dirençliydi. KDE görülme oranı erkek hastalarda kadınlara göre; yoğun bakım hastalarında da klinik hastalarına göre ve K. pneumoniae izolatlarında E. coli izolatlarına göre anlamlı olarak yüksek bulundu (p

Özet (Çeviri)

Aim: Carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) cause serious and life-threatening infections with limited treatment options. The most common causes of carbapenem resistance are carbapenemases, which hydrolyze carbapenems. Class A (KPC), class B (IMP, VIM, NDM), and class D (OXA-48) carbapenemases are the leading ones. We aimed to determine some antibiotic resistance rates and to show carbapenem resistance mechanisms by phenotypic and molecular methods in E. coli and K. pneumoniae strains isolated from various clinical specimens in Dicle University Hospital. Material and Method: The study was conducted at Dicle University Hospital and scheduled in two stages: retrospective data analysis and demonstration of carbapenem resistance mechanisms. Antibiotic susceptibility profiles of a total of 1486 (922 E. coli and 564 K. pneumoniae) strains were retrospectively studied during July 2016 and July 2017. The isolates sent to the bacteriology laboratory were from inpatients of various clinical specimens including clinicals and intensive care units. In the second stage, 89 CRE isolates (15 E. coli, 74 K. pneumoniae) which were resistant or moderately resistant to one or more of the carbapenems with the Phoenix ™ 100 (Becton-Dickinson, USA) automated system were included. Antibiotic susceptibilities of isolates were also assessed by Kirby-Bauer Disc Diffusion Method. Modified hodge test (MHT), combination disc test (CDT) and double disc synergy tests were performed to detect carbapenemase as phenotypically. Xpert Carba-R (Cepheid, USA) multiplex PCR system was used to detect carbapenemase genes, KPC, NDM, VIM, OXA-48 and IMP-1. Findings: Ertapenem, imipenem, meropenem, ciprofloxacin and colistin resistance were found to be 20.9%, 7.4%, 6.7%, 52.4% and 2.7% respectively in E. coli strains, whereas in K. pneumoniae strains, 52.8%, 38.4%, 32.8%, 63.3% and 23.2%, respectively. A total of 193 (20.9%) E. coli and 298 (52.8%) K. pneumoniae were resistant to at least one of the carbapenems. The incidence of CRE was significantly higher in male patients than in women; in the intensive care patients than other inpatients. CRE rates were higher in K. pneumoniae isolates compared to E. coli isolates (p

Benzer Tezler

  1. Tez No

    591989

    Gram negatif bakterilerde çeşitli toksin ve beta laktamaz direnç genlerinin sıklığı ile çeşitli antimikrobiyallere duyarlılıkları

    Frequency of various toxin and beta lactamase resistance genes in gram negative bacteria and susceptibilities to antimicrobials

    İPEK YILMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİZAMİ DURAN

  2. Tez No

    781557

    Microbial and antimicrobial study of bloodstream infection of recovered COVID-19 patients

    İyileşmiş COVID-19 hastalarının kan dolaşımı enfeksiyonunun mikrobiyal ve antimikrobiyal çalışması

    OMAR HUSSEIN ALI ALI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    MikrobiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ RAMAZAN SERDAR ESMER

    PROF. DR. HADEEL MİZHER YOUNIS

  3. Tez No

    740157

    Molecular study and bacteriological characteristics of escherichia coli isolated from burn patients

    Yanık hastalarından izole edilen escherıchıa colı'nin moleküler çalışması ve bakteriyolojik özellikleri

    IMAN ABDULQADER YOUNIS AL SARHAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiHarran Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SEDAT ÇAM

  4. Tez No

    779453

    Investigation of efflux pump and aminoglycoside resistance genes in Staphylococcus aureus strains isolated from clinical specimens in Iraq

    Irak'ta klinik numunelerden izole edilen Staphylococcus aureus suşlarında atım pompası ve aminoglikosit direnç genlerinin incelenmesi

    AHMED AWAD FATTOOH MUSLMAWI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ HİBA JASİM HAMZA

  5. Tez No

    803127

    Klinik örneklerden izole edilen enterococcus SPP'nin antibiyotik direnç oranlarının yıllar içindeki değişimi

    The change of antibiotic resistance rates of enterococcus SPP isolated from clinical specimens over the years

    TUĞBA GEDİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiTekirdağ Namık Kemal Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURİ KİRAZ

Geri Dön