Tuzluluk ve kuraklık stresine maruz bırakılan adaçayı bitkisinde (Salvia officinalis L.) rosmarinik asit biyosentezinde yer alan bazı genlerin ifade düzeyleri ve mobil element özelliği gösteren dna dizilerinde dna sitozin metilasyonunun araştırılması
Expression levels of some genes involved in rosmarinic acid biosynthesis in the sage plant (Salvia officinalis L.) exposed to salinity and drought stress and investigation of dna cytozine methylation in dna sequences showing mobile element properties
- Tez No: 847604
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ADNAN AYDIN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Ziraat, Biotechnology, Genetics, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Iğdır Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 71
Özet
Adaçayı, Farmakope ve monograflarda Salvia officinalis L. (Lamiaceae, Labiatae) türünün taze veya kurutulmuş yapraklarından elde edilen drog olarak tanımlanmaktadır. Mevcut çalışmada, adaçayı bitkilerine tuz ve kuraklık stresi uygulanmıştır. Bu amaçla bitikler birinci periyotta kontrol, tuz ve kuraklık stresi uygulanan bitkiler olarak üç gruba ayrılmıştır. Daha sonra ikinci periyotta kuraklık ve tuz stresi uygulanan bitkilerde“recovery”ile iyileştirilmeleri de sağlanmıştır. Çalışma süresince adaçayı yapraklarında fenolik bileşikler, PAL, TAT ve RAS gen ifadelerinde meydana gelen değişimlerinin yanı sıra epigenetik çalışmalarda restriksiyon enzim yaklaşımıyla DNA sitozin metilasyonları arasındaki farklılıklar incelenmiştir. İncelenen parametreler bakımından yapılan uygulamalar arasında farklılıkların olduğu tespit edilmiştir. Gen ifadesi düzeyinde özellikle rasmoronik asit olak yolunun TAT geni ile kontrol edildiği saptanmıştır. Bu durum karşısında kuraklığın daha çok etkili olduğu gözlemlenmiştir. DNA siztozin metilasyonun araştırılmasında ise uygulanan stres koşulları ve bunların iyileştirilmesinde genomda bulunan mobil hareket özelliği olan DNA bölgeleri üzerine yoğunlaşılmıştır. Bu bağlamda üniversal olan 43 iPBS primeri kullanılmış ve bunlardan 13 tanesinin adaçayı bitkisinde amplikon oluşturduğu gözlemlenmiştir. Bu 13 iPBS primerinde ise hem primer bazında hem de uygulama bazında farklı metilasyon düzeyleri olduğu saptanmıştır. Sonuç olarak abiyotik stres faktörlerinin varlığında ve stres sonrası iyileştirmelerde bitkinin fizyolojisinde değişiklikler olduğu net olarak bir daha ıspat edilmiştir. Bunun yanı sıra bitki genomunda ise epigenetik mekanizmalardan DNA sitozin metiilasyonun farklılıklar gösterdiği saptanmıştır. Bu farklılıkların daha net ortaya konması için daha spesifik tekniklerin kullanılması sonucuna varılmıştır.
Özet (Çeviri)
Sage is defined as the drog obtained from fresh or dried leaves of Salvia officinalis L. (Lamiaceae,Labiatae) in Pharmacopoeias and monographs. In the present study, sage plants were subjected to salt and drought stress. For this purpose, the plants were divided into three groups as control, salt and drought stressed plants in the first period. Then, in the second period, drought and salt stressed plants were also treated by“recovery”. During the study, phenolic compounds, changes in PAL, TAT and RAS gene expressions in sage leaves, as well as the differences between DNA cytosine methylations by restriction enzyme approach in epigenetic studies were examined. It has been determined that there are differences between the applications in terms of the parameters examined. At the gene expression level, it has been determined that the rasmoronic acid pathway is specifically controlled by the TAT gene. It has been observed that drought is more effective in this situation. In the investigation of DNA syntosine methylation, the focus was on the stress conditions applied and the mobile DNA regions in the genome to improve them. In this context, 43 universal iPBS primers were used and 13 of them were observed to form amplicons in sage plants. It was determined that these 13 iPBS primers had different methylation levels both on a primer basis and on an application basis. As a result, it has been clearly proven that there are changes in the physiology of the plant in the presence of abiotic stress factors and post-stress improvements. In addition, it has been determined that DNA cytosine methylation, one of the epigenetic mechanisms, varies in the plant genome. It was concluded that more specific techniques should be used to reveal these differences more clearly.
Benzer Tezler
- Kuraklık stresi ve Orobanche crenata enfeksiyonuna maruz bırakılan kuraklığa toleransları farklı nohut (Cicer arietinum L.)çeşitlerinde antioksidan savunma yanıtları
The antioxidant responces against to drought stress and Orobanche crenata infection on chickpea (Cicer arietinum L.) varieties which have known diferent drought tolerances
BUŞRA ÇALIK
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OKAN ACAR
- Effect of drought and salt stresses on antioxidant defense system and physiology of lentil (Lens culinaris M. ) seedlings
Kuraklık ve tuz streslerinin mercimek (Lens culinaris M. ) fidelerinin antioksidan savunma sistemi ve fizyolojisi üzerine etkileri
OYA ERCAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜSEYİN AVNİ ÖKTEM
- Farkli yonca (Medicago sativa L.) popülasyonlarinin tuzluluk stresine tepkileri, in vivo seleksiyonu ve islah hatlarinin oluşturulmasi
Response of dıfferent alfalfa (Medicago sativa L.) populatıons to salınıty stress, ın vıvo selectıon and ımprovıng of breedıng lınes
BERNA EFE
- Fasulye (Phaseolus vulgaris L.) bitkisinde Yabby ve Dof genlerinin kuraklık stresi ile olan ilişkilerinin salisilik asit etkisiyle karşılaştırmalı olarak gen ifadesi düzeyinde incelenmesi
Investigation of the Yabby and Dof transcription factors at gene expression level during drought stress conditions in Phaseolus vulgaris L. and the effect of salicylic acid
ARZU GİZEM KIRICI
- Kuraklık ve tuz stresi altında yetiştirilen buğday (Triticum aestivum L. Ceyhan-99)'a silikon uygulamasının morfolojik, fizyolojik parametreler ve antioksidan enzim aktiviteleri ile MRNA seviyeleri üzerine etkisi
The effects of silicone application to wheat (Triticum aestivum L. Ceyhan-99) growed under drought and salt stress on morphologic, physiological parameters and antioxidant enzyme activities and MRNA levels
HAKAN GÜNEŞ
Doktora
Türkçe
2022
BiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMEL DIRAZ YILDIRIM