Geri Dön

Asi nehrinden Escherıchıa colı izolasyonu, filogenetik grupları ve virülans özellikleri

Escherichia coli isolation from the orontes river, phylogenetic groups and virulance characteristics

PDF İndir

  1. Tez No: 848455
  2. Yazar: FATMA DEMİRTAŞ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. EBRU ŞEBNEM YILMAZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 75

Özet

İnsan kaynaklı her türlü kirleticinin nehirlere girişi, suyun fiziksel, kimyasal ve biyolojik bozulmasına yol açar. Bu çalışma başta tarımsal sulama ve çeşitli amaçlarla kullanılan Amik ovasını besleyen Asi Nehri boyunca belirlenen üç ayrı istasyonda on iki aylık örnekleme yapılarak gerçekleştirilmiştir. Bu amaçla, otuzaltı yüzey suyu örneğinin bazı su kalite parametre ölçümleri ile toplam koliform, E. coli sayımları gerçekleştirilerek, 34 (%94,4) E. coli izole edilmiştir. İzolatların 16 farklı antibiyotiğe olan duyarlılıkları, geniş spektrumlu beta laktamaz/plazmid aracılı AmpC beta laktamaz üretimleri, filogenetik grupları ve virülans özellikleri araştırıldı. Ölçümü gerçekleştirilen her su kalite parametresinin kendi içinde değişken değerler gösterdiği belirlendi. Toplam koliform ve E. coli sayım sonuçları değerlendirildiğinde en az kontaminasyonun Eşrefiye istasyonu, en çok kontamine istasyonun ise Küçük Asi istasyonu olduğu gözlemlendi. Fenotipik olarak 15 izolat (%44,11) geniş spektrum beta-laktamaz (GSBL) ve 5 izolat ise (%14,7) plazmid aracılı AmpC (pAmpC) beta-laktamaz üretimi yönünden pozitif değerlendirildi. İzolatlarda en yaygın GSBL tipi CTX-M (n:9) ve TEM (n:3) olarak bulunurken, pAmpC tip beta laktamaz üretici izolatların 6'sında CMY-2 tip beta-laktamaz enzimi belirlendi. Oniki (%35,29) E. coli izolatı test edilen antibiyotiklerin tamamına duyarlı bulunurken, diğer izolatların tamamı (imipenem hariç) antibiyotiklere değişen oranlarda direnç gösterdi. İzolatların PZR ile filogenetik grup dağılımları; A1 (n:15), B1 (n:6), B22 (n:5), B23 (n:4) ve A0 (n:4) olarak belirlendi. E. coli izolatlarının %58,8'inde (n: 20) en az bir veya daha fazla virülans geni tespit edilirken, 14 izolatta (%41,2) hiçbir virülans geni belirlenmedi. En yaygın virülans geni olarak papC (n:14, %41,2) ve iucD (n:11, % 32,3) tespit edildi. Tez bulguları, Asi Nehrinde mikrobiyolojik kaynaklı ciddi bir su kirliliğinin varlığını göstermiştir. Sonuçlarımız, su kaynaklarının sürdürülebilirliğini sağlamak ve halk sağlığını korumak için su kalitesi yönetiminde daha etkin stratejilerin benimsenmesi gerektiğinin önemini vurgulamaktadır.

Özet (Çeviri)

The entry of all types of human-induced pollutants into rivers leads to the physical, chemical, and biological degradation of water. This study was conducted by sampling at three different stations identified along the Asi River, which feeds the Amik Plain primarily for agricultural irrigation and various other purposes, over a period of twelve months. For this purpose, thirty-six surface water samples were collected, and certain water quality parameters were measured along with total coliform and E. coli counts, resulting in the isolation of 34 (94.4%) E. coli. The susceptibility of isolates to 16 different antibiotics, production of extended spectrum beta-lactamase/plasmid-mediated AmpC beta-lactamase, phylogenetic groups, and virulence properties were investigated. It was found that each measured water quality parameter exhibited variable values. When evaluating total coliform and E. coli counts, it was observed that the Eşrefiye station had the least contamination, while the Küçük Asi station had the most contamination. Phenotypically, 15 isolates (44.11%) were positive for producing extended spectrum beta-lactamase (ESBL), and 5 isolates (14.7%) were positive for plasmid-mediated AmpC (pAmpC) beta-lactamase production. The most common ESBL types found in isolates were CTX-M (n:9) and TEM (n:3), while the CMY-2 type beta-lactamase enzyme was identified in isolates producing pAmpC beta-lactamase. Twelve (35.29%) E. coli isolates were found to be susceptible to all tested antibiotics, while all other isolates (except imipenem) showed varying degrees of resistance to antibiotics. Phylogenetic group distribution of isolates by PCR was determined as A1 (n:15), B1 (n:6), B22 (n:5), B23 (n:4), and A0 (n:4). Virulence genes were detected in 58.8% (n: 20) of E. coli isolates, while no virulence genes were detected in 41.2% (n: 14) of isolates. The most common virulence genes detected were papC (n:14, 41.2%) and iucD (n:11, 32.3%). The findings of the thesis indicate the presence of significant microbiological pollution in the Asi River. Our results emphasize the importance of adopting more effective strategies in water quality management to ensure the sustainability of water resources and protect public health.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    98226

    Antakya kent dokusu içerisinde yer alan Asi nehrinden rekreasyonel amaçlı kullanım olanaklarının irdelenmesi

    Assessment of opportunuties of recreational uses of orontes rivers within the urban of Antakya

    CENK GİRAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    Peyzaj MimarlığıMustafa Kemal Üniversitesi

    Peyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KAMURAN GÜÇLÜ

  2. Tez No

    215900

    Garra rufa ve Garra variabilis'in morfometrik ve sitogenetik yönden karşılaştırmalı olarak incelenmesi

    Comparative investigation of Garra rufa and Garra variabilis by account of sitogenetic and morphometrik

    ARZU KARAHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyolojiMersin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. SERAP ERGENE

  3. Tez No

    873551

    Afet bölgelerinde kurulan yerleşim birimlerinin enerji ihtiyacının şebekeden bağımsız hibrit sistemlerle karşılanmasının tekno-ekonomik analizi

    Techno-economic analysis of energy demand of settlements established in post-disaster areas with off-grid hybrid systems

    ENDER YILMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Enerjiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Enerji Bilim ve Teknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MURAT ÇAKAN

  4. Tez No

    77352

    Assesment of the water potential of Asi (Orontes) basin in Turkey

    Asi (Orontes) havzası su potansiyeli

    ALİ KILINÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1998

    İnşaat MühendisliğiDokuz Eylül Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. TÜRKAY BARAN

  5. Tez No

    77081

    Asi Nehri (Antakya)'nın bazı fiziksel, kimyasal ve biyolojik parametrelerinin tespiti

    An Investigation on some physical, chemical and biological parameters of orontes river (Antakya)

    MELTEM TAŞDEMİR (DURAL)

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Su ÜrünleriÇukurova Üniversitesi

    Su Ürünleri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. M. ZİYA LUGAL GÖKSU

Geri Dön