Geri Dön

Functional analysis of long non-coding RNAs critical for the mesenchymal to epithelial transition

Mezenkimal epitelyal dönüşüm sürecinde kritik olan uzun kodlamayan RNA'ların işlevsel analizleri

PDF İndir

  1. Tez No: 852862
  2. Yazar: AYÇA ÖZKAN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HANI ALOTAIBI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Bilim ve Teknoloji, Genetik, Biyoloji, Science and Technology, Genetics, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: MET, EMT, lncRNA, Transkripsiyon, MET, lncRNA, EMT, Transcription
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyotıp ve Sağlık Teknolojileri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Epitelyal-mezenkimal dönüşüm (EMT) ve mezenkimal-epitelyal geçiş (MET), normal gelişim, yara iyileşmesi ve tümör oluşumu gibi çeşitli fizyolojik ve patolojik süreçler için çok önemli olan farklı biyolojik olaylardır. Daha önce MET, yalnızca EMT'nin tersinir bir süreci olarak görülüyordu; MET düzenlemesinden sorumlu olduğu düşünülen EMT'yi indükleyen faktörlerin ekspresyonu azalmıştı. Ayrıca EMT'de kodlamayan RNA'larla ilgili bazı yayınlar olmasına rağmen MET ile ilgili lncRNA'larla ilgili yayınlarda hala eksiklikler mevcut. EMT sürecine benzer şekilde MET düzenlemesindeki potansiyel rollerini gösteren MET ile ilişkili yeni lncRNA'lar vardır. Bu tezde amaç MET için kritik olan lncRNA'ları tanımlamaktı. Yüksek verimli veri üretimi, gen modülasyonu ve biyoinformatik içeren entegre bir yaklaşım kullandık; sonuçlarımız MET ile ilişkili lncRNA'ların hücre döngüsünde, kromozom ayrımında, DNA hasarı onarımında önemli roller oynadığını ve MET'i kontrol eden düzenleyici bir ağa katkıda bulunduğunu gösteriyor. Deneylerimizden NH.3067, MET'in kritik başlatıcısı olarak ortaya çıktı ve gelişmiş deneyler yoluyla daha fazla araştırması gerekiyor. Düzenleyici rollerinin ötesinde, bu lncRNA'lar potansiyel kanser biyobelirteçleri olarak umut vaat ediyor.

Özet (Çeviri)

Epithelial-mesenchymal transition (EMT) and mesenchymal-epithelial transition (MET) are biological events crucial for physiological and pathological processes like normal development, wound healing, and tumorigenesis. Previously, MET was viewed merely as a reversible process of EMT, with decreased expression of EMT-inducing factors considered responsible for MET regulation. Recently, there has been an increase in research describing the role of non-coding RNAs in EMT. However, the role of lncRNA in MET is still unknown. There are novel lncRNAs that are MET-associated, which indicates their potential role in MET regulation similar to the EMT process. In this thesis, the aim was to identify lncRNAs that are critical for MET. We employed an integrated approach involving high-throughput data generation, gene modulation, and bioinformatics. Our results indicate that MET-associated lncRNAs play crucial roles in the cell cycle, chromosome segregation, and DNA damage repair and contribute to a regulatory network controlling MET. From our experiments, NH.3067 emerged as a critical initiator of MET, warranting further exploration through advanced experiments. Beyond its regulatory roles, this lncRNA holds promise as a potential cancer biomarker.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    972953

    Discovery and characterization of isoform level complexity inestrogen-induced MCF7 cells using long-read rna sequencing

    Östrojenle indüklenmiş MCF7 hücrelerinde izoform düzeyi karmaşıklığının uzun okumalı rna dizileme kullanılarak keşfi ve karakterizasyonu

    İBRAHİM ÖZGÜL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    GenetikOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN

  2. Tez No

    582758

    Discovering regulatory non-coding RNA interactions

    Düzenleyici kodlanmayan RNA etkileşimlerinin keşfi

    GÜLDEN OLGUN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ABDULLAH ERCÜMENT ÇİÇEK

    YRD. DOÇ. DR. ÖZNUR TAŞTAN OKAN

  3. Tez No

    592495

    A study on RNA and protein effectors of transcription factor activity and gene expression

    Transkripsiyon faktörü aktivitesi ve gen ifadesinde RNA ve protein etkenleri üzerine bir çalışma

    AYŞE DERYA CAVGA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyolojiKoç Üniversitesi

    Kimya ve Biyoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEHRA ÖZLEM KESKİN ÖZKAYA

    PROF. DR. ATTİLA GÜRSOY

  4. Tez No

    998570

    Erişkin akut miyeloid lösemili hastalarda kemik iliği mikroçevresine etkili uzun kodlamayan rna uca1 düzeylerinin araştırılması

    Investigation of long non-coding rna uca1 levels affecting the bone marrow microenvironment in adult patients with acute myeloid leukemia

    BENGÜSU EREN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    HematolojiTrakya Üniversitesi

    Biyoteknoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. JÜLİDE TOZKIR

  5. Tez No

    987370

    Mesane kanserinde uzun kodlamayan RNA HOXA-AS2-mir520c-3p/TGF-β yolağının incelenmesi

    Investigation of the long non-coding RNA HOXA-AS2/miR-520c-3p/TGF-β pathway in bladder cancer

    ELİF DELEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İLKNUR BİNGÜL

    PROF. DR. SEVDA TANRIKULU KÜÇÜK

Geri Dön