Investigation on the effect of candidate genes with growth traits in goat breeds
Keçi ırklarında aday genlerin büyüme özelliklerine etkisinin araştırılması
- Tez No: 853014
- Danışmanlar: PROF. DR. BAHRİ DEVRİM ÖZCAN, DR. ÖĞR. ÜYESİ MERVAN BAYRAKTAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyometri ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmanın amacı, Saanen, Alpin ve Boer keçi ırklarında GH, IGF1 ve Pit-1 (POUF-1) gen polimorfizmleri ile vücut ağırlığı, göğüs çevresi, vücut uzunluğu, cidago yüksekliği ve göğüs genişliği gibi büyüme özellikleri arasındaki ilişkinin belirlenmesidir. Çukurova Üniversitesi Ziraat Fakültesi Keçicilik İşletmesinde yetiştiriciliği yapılan keçilerden toplanan 203 adet kan örneğinden izole edilen DNA örnekleri genotipleme için kullanılmıştır. PCR-RFLP yönteminde hayvanlardan alınan kan örneklerinden izole edilen DNA'lar PCR işlemine tabi tutulmuştur. PCR amplikonlarında Pit-1 geni için PstI polimorfizmi (450 bp), IGF-1 geni için HaeIII polimorfizmi (363 bp) ve GH geni için HaeIII polimorfizmi (422 bp) araştırılmıştır. GH/HaeIII sonuçları iki alel (A ve B) ve iki genotip (AB ve BB) ortaya koymuştur. Saanen, Alpin ve Boer ırkları için A ve B allel frekansları sırasıyla 0.438 ve 0.562, 0.444 ve 0.556, 0.197 ve 0.803 olarak bulunmuştur. AB ve BB genotip frekansları yine aynı sırayla 0.876 ve 0.124, 0.889 ve 0.111, 0.394 ve 0.606 olarak bulunmuştur. Sonuçlar incelenen popülasyonun Hardy-Weinberg dengesinde olmadığını göstermiştir (P<0.05). IGF-1/HaeIII sonuçları iki alel (A ve B) ve üç genotip (AB, BB ve AA) ortaya koymuştur. Saanen, Alpin ve Boer ırklarında A ve B allel frekansları sırasıyla 0,191 ve 0.809, 0.173 ve 0.827, 0.182 ve 0.818 olarak bulunmuştur. AB, BB ve AA genotip frekansları ise sırayla Saanen ırkı için 0.315, 0.652 ve 0.033, Alpin ırkı için 0.247, 0.704 ve 0.049, Boer ırkı için ise 0.242, 0.697 ve 0.061 olarak bulunmuştur. IGF-1/HaeIII bakımından popülasyonun Hardy-Weinberg dengesinde olduğu belirlenmiştir (P>0.05). PstI polimorfizmi açısından T ve C alel frekansları Saanen, Alpin ve Boer ırkları için sırasıyla 0.921 ve 0.079, 0.988 ve 0.012, 0.985 ve 0.015 olarak belirlenmiştir. CC genotipi her üç ırkta da tespit edilememiştir. TT ve TC genotip frekansları ise Saanen, Alpin ve Boer keçilerinde sırasıyla 0.843 ve 0.157, 0.975 ve 0.025, 0.970 ve 0.030 olarak bulunmuştur. Pit-1 geninin ekzon 6 bölgesindeki PstI polimorfizmi açısından popülasyonun Hardy-Weinberg dengesinde oldğu belirlenmistir (P<0.05). Gen polimorfizmleri ve büyümeye bağlı parametreler arasındaki ilişki çalışması, Boer keçilerinde GH/HaeIII BB genotipinin vücut ağırlığı ile anlamlı bir ilişkiye (p<0.05) sahip olduğunu ortaya çıkarmıştır. Bu, mutant B alelinin varlığının Boer ırklarında büyüme özellikleri üzerinde ilave bir etkiye sahip olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
This study aims to determine an effect between GH, IGF-1, and Pit-1 (POUF-1) gene polymorphisms and growth traits such as body weight, heart girth, body length, height at wither, and chest width in Saanen, Alpine, and Boer goat breeds. Knowing how candidate gene polymorphisms affect production traits like growth, body size, and milk yield is essential to make good plans for genetic improvement, management, and gene marker-assisted selection. Two hundred three blood samples from Saanen, Alpine, and Boer goat populations were collected from Cukurova University's Small Ruminant Farms and used for DNA extraction and genotyping. For the PCR-RFLP method, blood is first taken from the animals, DNA is isolated, and then the DNA is subjected to PCR-RFLP to look at the Pit-1/PstI gene polymorphism (450 bp), the IGF-1/HaeIII gene polymorphism (363 bp), and the GH/HaeIII gene polymorphism (422 bp). GH/HaeIII gene polymorphism results identified two alleles (A and B) and two genotypes (AB and BB). A and B allele frequencies for Saanen, Alpine, and Boer goat breeds were found to be 0.438 and 0.562, 0.444 and 0.556, and 0.197 and 0.803, respectively. AB and BB genotype frequencies were found to be 0.876 and 0.124, 0.889 and 0.111, and 0.394 and 0.606, respectively. It was determined that the population studied was not in Hardy-Weinberg equilibrium in the Saanen and Alpine goat breeds (P<0.05). However, in the Boer goat breed, the population is in Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05). IGF-1/HaeIII gene polymorphism results identified two alleles (A and B) and three genotypes (AB, BB, and AA). A and B allele frequencies for the Saanen, Alpine, and Boer breeds were found to be 0.191 and 0.809, 0.173 and 0.827, and 0.182 and 0.818, respectively. The AB, BB, and AA genotype frequencies were found to be 0.315, 0.652, 0.033 for Saanen, 0.247, 0.704, 0.049 for Alpine, and 0.242, 0.697, and 0.061, for Boer respectively. For the three goat breeds under study, it was found that the population was in Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05). Regarding Pit-1/PstI gene polymorphism, T and C allele frequencies were determined as 0.921 and 0.079, 0.988 and 0.012, and 0.985 and 0.015 for Saanen, Alpine, and Boer breeds, respectively. The CC genotype was not detected in all breeds. TT and TC genotype frequencies were found to be 0.843 and 0.157, 0.975 and 0.025, and 0.970 and 0.030 in Saanen, Alpine and Boer goats, respectively. Concerning the Pit-1/PstI gene polymorphism, the population was in Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05).The association study between gene polymorphism and growth traits revealed that the GH/HaeIII BB genotypes in Boer goats have a significant association (p<0.05) with a higher body weight. This suggests that the presence of the mutant B allele has an additive impact on growth traits in Boer breeds.
Benzer Tezler
- İzmir'de bazı yolların kapatılarak yaya bölgeleri oluşturma da kent peyzajını geliştirme açısından yeniden planlanması üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
BAHAR TÜRKYILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Şehircilik ve Bölge PlanlamaEge ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
- Kuyruk modelleri ve analizi üzerine bir uygulama
Başlık çevirisi yok
DİDEM ÖZPULAT
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
İstatistikEge ÜniversitesiBilgisayar Bilimleri ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİKRET İKİZ
- Samsun ve çevresinde tarla sarmaşığı (conuolvulus arvensis L.)'na karşı biyolojik savaşa esas olacak fauna tespiti
Investigations on the insect fauna of the field binweed (Conuolvulus arvensis L.) related to its biological control in Samsun Province
YASEMİN UFUK GERMAN
- Gebelik ve doğum olgularında prolaktin düzeylerinin değerlendirilmesi
The Evaluation of prolactin values during pregnancy labour and in deliveries
TÜLİN AKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MÜLAZIM YILDIRIM
- Bromtimol mavisi, bromkresol moru ve klorfenol kırmızısı indikatörleri katılmış özel besiyerlerinin sütlerde antibiyotik belirtilmesine uygunluğu üzerine araştırmalar
Başlık çevirisi yok
ESENGÜL TUNCER
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiSüt Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN YAYGIN