Geri Dön

Baş boyun kanserli hastaların (HNC) mikrobiyota profil analizi ve klinik parametrelerle ilişkisi

Microbiota profiling of patients with head and cancer and its link with clinical parameters

PDF İndir

  1. Tez No: 855558
  2. Yazar: İREMSU BAKIR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEMRA DEMOKAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Onkoloji, Biology, Microbiology, Oncology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Deneysel ve Moleküler Onkoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 77

Özet

Mikroorganizmaların hastalıkları ve tedavilere yanıtı modüle ettiği bilinmektedir. Gut mikrobiyotasından sonra en yüksek bakteri çeşitliliği oral mikrobiyotaya aittir. Burada bulunan türler HNC ile ilişkili olabilir. Bu ilişkiyi daha net anlayabilmek açısından çalışmamızda sağlıklı bireyler, HNC tanısı almış ancak tedavisine başlanılmamış bireyler ve bu bireylerin tedavi sonrası tükürük örnekleri toplandı. Çalışmada 10 adet sağlıklı ve 10 adet HNC hastası birey gönüllü oldu. Numunelerden mikrobiyal DNA izolasyonu sonrası Oxford Nanopore Teknolojisi kullanılarak (ONT) 16S rRNA amplikon sekanslama yapılmıştır. Elde edilen veriler biyoinformatik olarak analiz edilerek sağlıklı ve hasta bireylerin klinik parametreleriyle değerlendirilmiştir. İstatistiksel veriler için Wilcoxon Singed Rank Test ve Kruskal Wallis hipotez testleri kullanıldı. Alfa çeşitlilik için Shannon, Inverse Simpson indeksleri kullanıldı ve beta çeşitlilik için Bray-Curtis Dissimilarity, Jaccard Distance kullanıldı. Çalışmamızda 2479 bakteri türü tespit edilmiştir. Tedavi öncesi ve tedavi sonrası bireylerin mikrobiyota kompozisyonunda değişimler mevcuttur. Bacillota sağlıklı, tedavi öncesi ve tedavi sonrası bireylerde mikrobiyotada en bol bulunan filumdur. Ayrıca filum düzeyinde gözlemlenen alfa çeşitlilik istatistiksel olarak anlamlı olup (p0.05).

Özet (Çeviri)

Microorganisms are known to modulate disease and response to treatments. After the gut microbiota, the oral microbiota has the highest bacterial diversity. The species found here may be associated with HNC. To better understand this relationship, our study involved collecting saliva samples from healthy individuals, individuals diagnosed with HNC but not yet undergoing treatment, and individuals after treatment. A total of 10 healthy and 10 HNC patients volunteered for the study. Following microbial DNA isolation from the samples, 16S rRNA amplicon sequencing was performed using Oxford Nanopore Technology (ONT). The obtained data were analyzed bioinformatically and evaluated in relation to the clinical parameters of healthy and diseased individuals. Statistical data were analyzed using the Wilcoxon Signed Rank Test and Kruskal Wallis hypothesis tests. Shannon and Inverse Simpson indices were used for alpha diversity, while Bray-Curtis Dissimilarity and Jaccard Distance were used for beta diversity. In our study, 2479 bacterial species were identified. Changes in the microbiota composition were observed in individuals before and after treatment. Bacillota is the most abundant phylum in the microbiota of healthy, pre-treatment, and post-treatment individuals. Additionally, the observed alpha diversity at the phylum level is statistically significant (p 0.05).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    306131

    2007-2010 yılları arasında kliniğimizde tedavi edilen baş ve boyun kanserli hastaların retrospektif değerlendirilmesi

    Retrospective evaluation of patients with head and neck cancer treated in our clinic between 2007 and 2010

    EBRU ATASEVER AKKAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    OnkolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Radyasyon Onkolojisi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BİRSEN YÜCEL

  2. Tez No

    723623

    Baş boyun kanserli hastalarda perioperatif immünonütrisyon uygulamasının cerrahi komplikasyonlar ve yaşam kalitesi üzerine etkisi

    The effect of perioperative immunonutrition on surgical complications and quality of life in patients with head and neck cancer

    EDA BAŞMISIRLI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Beslenme ve DiyetetikErciyes Üniversitesi

    Beslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HABİBE ŞAHİN

  3. Tez No

    871902

    Estimation of proinflammatory cytokines and biochemical parameters in patients chronic periodontitis with post-radiotherapy head and neck cancer

    Radyoterapi sonrası baş boyun kanserli kronik periodonititli hastalarda proinflamatuar sitokinler ve biyokimyasal parametrelerin tahmini

    AHMED AMER LATEEF LATEEF

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyokimyaÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞEVKİ ADEM

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ZAİZAFOON NABEEL NASIF

  4. Tez No

    729944

    Lokal ileri baş boyun kanserinde prognozu öngören bir parametre olarak sarkopeninin değerlendirilmesi

    Evaluation of sarcopenia as A prognostic parameter in locally advanced head and neck cancer

    ENES ERUL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    OnkolojiHacettepe Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERCAN AKSOY

  5. Tez No

    712751

    Baş ve boyun kanserleri nedeniyle tedavi alan yetişkin hastaların beslenme alışkanlıkları, malnütrisyon durumu, serum albümin düzeyi ve yaşam kalitesinin değerlendirilmesi

    Assessments of nutritional habits, malnutrition status, serum albumin level and quality of life in adult patients treated for HEAD and neck cancers

    NİSA NUR ÜCEBAKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Beslenme ve DiyetetikAnkara Yıldırım Beyazıt Üniversitesi

    Beslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ NURAL ERZURUM ALİM

Geri Dön