Enflamatuvar mikroçevrede değişen mikrorna profillerinin prostat kanseri gelişimine olan etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects on prostate cancer development of microrna profiles varying in the inflammatory micro environment
- Tez No: 855623
- Danışmanlar: PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 183
Özet
Bu tezde biyoinformatik analizlerle prostat kanseri metastazında gen ekspresyon ifadelerinin değişmesine bağlı olarak meydana gelen epitel mezenkimal geçişte (EMT) sorumlu olabilecek iki mikroRNA (miR-133b ve miR-27b) belirlenmiştir. Metastaz özelliği gösteren prostat kanseri LNCaP hücre hatlarına miR-133b ve miR-27b transfeksiyonu yapılarak qPCR, Western Blot, immunofloresan boyama, migrasyon ve invazyon gibi birçok deney ile biyoinformatik analiz sonuçları doğrulanmıştır. Transfeksiyon sonrasında hücrelerin epitel fenotiplerinin korunduğu görülmüştür. EMT belirteçlerinden E-kaderin ekspresyonu artarken B-katenin ekspresyonu azalmıştır. Hücre göçü ve invazyonu azalmış, tümör hücrelerinin çoğalması ve koloni oluşum hızı yavaşlamıştır. TWIST, EGFR, HIF-1A gibi EMT'i indükleyen genlerin ifadesi azalmıştır. Gelecek yıllarda tez çalışmasından elde edinilen miR-133b ve miR-27b ile ilgili biyolojik bilginin kliniğe tercüme edilebileceği beklenmektedir. Biyoinformatik bilginin özümsenmesi ve bu bilgi ağının kullanımının incelenmesi karmaşık ve çoklu sinyal yolaklarının daha kolay anlaşılmasına, kanser tedavisi için yeni terapötik ajanların bulunmasına olanak sağlayacaktır.
Özet (Çeviri)
In this thesis, two microRNAs (miR-133b and miR-27b) that may be responsible for the epithelial mesenchymal transition (EMT), which occurs due to changes in gene expressions in prostate cancer metastasis, were determined by bioinformatic analysis. After transfection of miR-133b and miR-27b in prostate cancer LNCaP cell lines showing metastasis, the results of the bioinformatic analysis were confirmed by many experiments such as qPCR, Western Blot, immunofluorescent staining, migration and invasion. It was observed that the epithelial phenotypes of the cells were preserved after transfection. E-kaderin expression, one of the EMT markers, increased while B-katenin expression decreased. Cell migration and invasion decreased, and proliferation and colony formation rate of tumor cells slowed down. The expression of EMT-inducing genes, such as TWIST, EGFR, HIF-1A, was decreased. It is expected that the biological information on miR-133b and miR-27b from the thesis will be translated to the clinic in the coming years. The assimilation of bioinformatic information and the examination of the use of this information network will undoubtedly allow for an easier understanding of complex and multiple signaling pathways, and the discovery of new therapeutic agents for cancer treatment.
Benzer Tezler
- Metastatik prostat kanseri gelişiminde enflamasyon ilişkili epitelyal mezenkimal geçiş mekanizmasının araştırılması
Investigation of inflammation related epithelial-mesencymal transition mechanism in metastatic prostate cancer progression
ELİF İŞEL
Doktora
Türkçe
2024
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BİLGE DEBELEÇ BÜTÜNER
- Mezenkimal kök/stromal hücre (MKH /MSH) ve insan kaynaklı makrofaj plastisitesi arasındaki etkileşimlerde gen ifadelerinin araştırılması
Investigation of gene expressions in interactions of mesenchymal stem/stromal cells and plasticity of human
CAN KILINÇARSLAN
Doktora
Türkçe
2018
Allerji ve İmmünolojiGazi Üniversitesiİmmünoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VEDAT BULUT
- Meme kanseri hücreleri (MDA-MB-231) ve THP-1 orjinli makrofaj hücrelerinin KO-kültürü ile oluşturulacak mikroçevrede kanser hücre lizatı, oleuropein, alum ve QS-21'in etkilerinin araştırılması
Investigation of cancer cell lysate, oleuropein, alum and QS-21 effect on CO-culture microenvironment of THP-1 origin macrophages and breast cancer cells
BÜŞRA ÇAKIR
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE NALBANTSOY
- Cellular characterization of immune cells in non-small cell lung cancer and mesothelioma
Küçük hücreli dışı akciğer kanseri ve mezotelyomada immün hücrelerin hücresel karakterizasyonu
GÖNÜL SEYHAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYÇA SAYI YAZGAN
- İndüklenmiş pluripotent kök hücreden (İPKH) mikroglia farklılaşması ve nöroinflamatuar yanıttaki yeri
Microglia differentiation from induced pluripotent stem cell (İPKH) and its role in neuroinflammatory response
GÖZE BECEREN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZLEM YEŞİL ÇELİKTAŞ