Geri Dön

Enflamatuvar mikroçevrede değişen mikrorna profillerinin prostat kanseri gelişimine olan etkilerinin araştırılması

Investigation of the effects on prostate cancer development of microrna profiles varying in the inflammatory micro environment

PDF İndir

  1. Tez No: 855623
  2. Yazar: GİZEM ÖRS KUMOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ege Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 183

Özet

Bu tezde biyoinformatik analizlerle prostat kanseri metastazında gen ekspresyon ifadelerinin değişmesine bağlı olarak meydana gelen epitel mezenkimal geçişte (EMT) sorumlu olabilecek iki mikroRNA (miR-133b ve miR-27b) belirlenmiştir. Metastaz özelliği gösteren prostat kanseri LNCaP hücre hatlarına miR-133b ve miR-27b transfeksiyonu yapılarak qPCR, Western Blot, immunofloresan boyama, migrasyon ve invazyon gibi birçok deney ile biyoinformatik analiz sonuçları doğrulanmıştır. Transfeksiyon sonrasında hücrelerin epitel fenotiplerinin korunduğu görülmüştür. EMT belirteçlerinden E-kaderin ekspresyonu artarken B-katenin ekspresyonu azalmıştır. Hücre göçü ve invazyonu azalmış, tümör hücrelerinin çoğalması ve koloni oluşum hızı yavaşlamıştır. TWIST, EGFR, HIF-1A gibi EMT'i indükleyen genlerin ifadesi azalmıştır. Gelecek yıllarda tez çalışmasından elde edinilen miR-133b ve miR-27b ile ilgili biyolojik bilginin kliniğe tercüme edilebileceği beklenmektedir. Biyoinformatik bilginin özümsenmesi ve bu bilgi ağının kullanımının incelenmesi karmaşık ve çoklu sinyal yolaklarının daha kolay anlaşılmasına, kanser tedavisi için yeni terapötik ajanların bulunmasına olanak sağlayacaktır.

Özet (Çeviri)

In this thesis, two microRNAs (miR-133b and miR-27b) that may be responsible for the epithelial mesenchymal transition (EMT), which occurs due to changes in gene expressions in prostate cancer metastasis, were determined by bioinformatic analysis. After transfection of miR-133b and miR-27b in prostate cancer LNCaP cell lines showing metastasis, the results of the bioinformatic analysis were confirmed by many experiments such as qPCR, Western Blot, immunofluorescent staining, migration and invasion. It was observed that the epithelial phenotypes of the cells were preserved after transfection. E-kaderin expression, one of the EMT markers, increased while B-katenin expression decreased. Cell migration and invasion decreased, and proliferation and colony formation rate of tumor cells slowed down. The expression of EMT-inducing genes, such as TWIST, EGFR, HIF-1A, was decreased. It is expected that the biological information on miR-133b and miR-27b from the thesis will be translated to the clinic in the coming years. The assimilation of bioinformatic information and the examination of the use of this information network will undoubtedly allow for an easier understanding of complex and multiple signaling pathways, and the discovery of new therapeutic agents for cancer treatment.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    912703

    Metastatik prostat kanseri gelişiminde enflamasyon ilişkili epitelyal mezenkimal geçiş mekanizmasının araştırılması

    Investigation of inflammation related epithelial-mesencymal transition mechanism in metastatic prostate cancer progression

    ELİF İŞEL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyoteknolojiEge Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BİLGE DEBELEÇ BÜTÜNER

  2. Tez No

    919272

    Bağırsak hasar modellerinde kemik iliği mezenkimal kök hücre ve bağırsak mezenkimal kök hücrelerin rejeneratif ve immün modülatuvar etkilerinin karşılaştırılması

    Comparison of regenerative and immune modulatory effecets of bone marrow and intestinal mesenchymal stem cells i intestinal damage models

    BURCU PERVİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİMA AERTS KAYA

  3. Tez No

    601637

    Mezenkimal kök/stromal hücre (MKH /MSH) ve insan kaynaklı makrofaj plastisitesi arasındaki etkileşimlerde gen ifadelerinin araştırılması

    Investigation of gene expressions in interactions of mesenchymal stem/stromal cells and plasticity of human

    CAN KILINÇARSLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Allerji ve İmmünolojiGazi Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. VEDAT BULUT

  4. Tez No

    946056

    Kanser ve bağışıklık hastalıklarında hedef olan TIPE2 and PAK1 ve pak1 proteinleriyle olan etkileşimlerinin moleküler seviyede ve dinamik olarak incelenmesi

    Molecular and Dynamic Investigation of the Interactions of RAC1, a Target in Cancer and Immune Diseases, with TIPE2 and PAK1 Proteins

    HACI ASLAN ONUR İŞCİL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    Biyofizikİstanbul Medeniyet Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SALİHA ECE ACUNER ZORLUUYSAL

  5. Tez No

    640629

    Meme kanseri hücreleri (MDA-MB-231) ve THP-1 orjinli makrofaj hücrelerinin KO-kültürü ile oluşturulacak mikroçevrede kanser hücre lizatı, oleuropein, alum ve QS-21'in etkilerinin araştırılması

    Investigation of cancer cell lysate, oleuropein, alum and QS-21 effect on CO-culture microenvironment of THP-1 origin macrophages and breast cancer cells

    BÜŞRA ÇAKIR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    BiyomühendislikEge Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE NALBANTSOY

Geri Dön