Geri Dön

Üropatojenik E.coli izolatlarında virulans faktör genleri ve biyofilm oluşumunun araştırılması

Investigation of virulence factor genes and biofilm formation in uropathogenic E.coli isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 859316
  2. Yazar: YAHYE MOHAMUD MUMIN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. AZER ÖZAD DÜZGÜN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gümüşhane Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 71

Özet

İdrar yolu enfeksiyonlarının (İYE) en sık nedeni üropatojenik Escherichia coli'dir (UPEC) ve önemli bir halk sağlığı sorunudur. Bu tez çalışmada idrar yolu enfeksiyonundan izole edilen E.coli izolatlarının antibiyotik duyarlılığı, virülans genlerinin varlığı ve biyofilm oluşturma kapasitesi araştırıldı. İzolatların %52.2 sefepim, %85.5 amoksisilin/klavulanik asit, %53.3 seftazidim, %26.6 nitrofurontoin, %56.6 sefiksim, %37.7 gentamisin, %53.3 sefotaksim, %32.2 sefoxitin, %55.5 sefuroksim, %44.4 piperasilin/tazobaktam, %93.3 ampisilin, %37.7 seftriakson, %48.8 tobramisin, %28.8 fosfomisin, %61.1 siprofloksasin, %64.4 levofloksasin, %58.8 sülfametoksazal/trimetoprim, %90 ampisilin/sulbaktam, %24.4 amikasin, %16.6 meropenem, %15.5 ertapenem ve %16.6 imipeneme karşı dirençli olduğu tespit edildi. 90 E.coli'de virülans faktör genlerinin (sfa, pap, hly, cnf, aer, afa ve fim) varlığı araştırıldı. Elde edilen sonuçlara göre toplam 86 suşta virülans faktör genlerinin varlığı gözlendi. En yüksek oranda fim (%92.2) virülans faktör geni suşlarda tespit edildi. %30 Aer, %28.8 Afa, %13 pap, %13 cnf, %3.3 sfa, %2.2 hly virulans faktör genleri suşlar arasında görüldü. Ayrıca 90 E.coli izolatında 13 farklı virülans faktör gen paterni belirlendi. Biyofilm oluşturma kapasiteleri değerlendirilen 90 E. coli izolatından 42'sinin biyofilm oluşturma kapasitesine sahip olduğu belirlendi. Bunların 26'sı (%28,8) zayıf, 12'si (%13,3) orta ve 4'ü (%4,4) güçlü biyofilm oluşturduğu görüldü. Ayrıca zayıf biyofilm oluşturan suşların afa, aer, cnf, afa+pap, orta derecede biyofilm oluşturan suşlar afa, aer ve cnf, güçlü biyofilm oluşturan suşlar afa, aer+pap, pap+sfa+cnf virülans faktörü genlerini taşıdığı belirlendi. Sonuç olarak, idrar yolu enfeksiyonu önemli bir halk sağlığı sorunu olduğundan, İYE ile ilişkili bakteriyel patojenlerde antibiyotik direnci, virülans faktör genleri ve biyofilm oluşumunun araştırılması daha iyi tedavi seçenekleri açısından önemlidir.

Özet (Çeviri)

The most common cause of urinary tract infections (UTI) is uropathogenic Escherichia coli (UPEC) and is an important public health problem. In this thesis study, antibiotic sensitivity, presence of virulence genes and biofilm formation capacity of E.coli isolates isolated from urinary tract infection were investigated. The isolates, 52.2% cefepime, 85.5% amoxicillin/clavulanic acid, 53.3% ceftazidime, 26.6% nitrofurontoin, 56.6% cefixime, 37.7% gentamicin, 53.3% cefotaxime, 32.2% cefoxitin, 55.5% cefuroxime, 44.4% piperacillin/tazobactam, 93.3%. ampicillin , 37.7% ceftriaxone, 48.8% tobramycin, 28.8% fosfomycin, 61.1% ciprofloxacin, 64.4% levofloxacin, 58.8% sulfamethoxasal/trimethoprim, 90% ampicillin/sulbactam, 24.4% amikacin, 16.6% meropenem, 15.5% ertapenem and 16.6%. imipenem were found to be resistant. The presence of virulence factor genes (sfa, pap, hly, cnf, aer, afa and fim) was investigated in 90 E.coli. According to the total obtained, the presence of virulence factor genes was observed in a total of 86 strains. The highest rate of fim (92.2%) virulence factor gene was detected in the strains. 30% Aer, 28.8% Afa, 13% pap, 13% cnf, 3.3% sfa, 2.2% hly virulence factor genes were seen among the strains. Also, 13 different virulence factor gene patterns were determined in 90 E.coli isolates. The biofilm-forming capacity of 90 clinical E.coli isolates were evaluated and it was determined that 42 strains formed biofilm. It was observed that 26 (28.8%) of the biofilm-forming strains had weak, 12 (13.3%) moderate and 4 (4.4%) strong biofilm-forming capacities. In addition, weak biofilm strains carry afa, aer, cnf, afa+pap, medium biofilm strains carry afa, aer and cnf, and strong biofilm strains carry afa, aer+pap, pap+sfa+cnf virulence factor genes. In conclusion, since urinary tract infection is an important public health problem, investigating antibiotic resistance, virulence factor genes and biofilm formation in bacterial pathogens associated with UTI is important for better treatment options.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    797320

    Çocuklarda üriner sistem enfeksiyonu etkeni olan escherıchıa colı izolatlarında virülans faktörleri, filogenetik grup özellikleri ve st131 klonu varlığının araştırılması

    Investigation of virulence factors, phylogenetic group features, and the presence of ST131 clone in escherichia coli isolates, A urinary tract infection agent in children

    SELİN GAMZE KILIÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLLÜ İŞTAR DOLAPÇI

  2. Tez No

    815028

    Anbar vilayetinde idrar yolu enfeksiyonu ve doğurganlık problemi olan erkeklerden izole edilen E. coli'nin virülans faktör genlerinin karakterizasyonu

    Charecterization of the virulence factors genes of E. coli isolated from men suffering from urinary tract infection and fertility problems in Anbar province

    MOHAMMED NASRI HASAN AL-BAYATI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞENUR KAYABAŞ AVŞAR

  3. Tez No

    610958

    Klinik Escherichia coli izolatlarında antibiyotik direnç genlerinin araştırılması ve bazı bitki özütlerinin kinolon dirençli izolatlar üzerine etkisinin belirlenmesi

    Investigation of antibiotic resistance genes in clinical Escherichia coli isolates and determination of the effect of some plant extracts on quinolon resistant isolates

    FUNDA OKUMUŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiGümüşhane Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AZER ÖZAD DÜZGÜN

  4. Tez No

    794621

    Üriner sistem enfeksiyonu olan ıraklı hastalardan üropatojenik escherichia coli'de (UPEC) sitotoksik nekrotizan faktör, kolibaktin, sitoletal distansiyon toksinin moleküler analizi

    Molecular analysis of citotoxic necrotizing factor, colibactin, cytoletal distension toxin in uropatogenic escheri̇chia coli (UPEC) from iraqi patients with urinary system infection

    HIBA NASER ALI ALSAHO

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKER ŞİMŞEK

  5. Tez No

    790791

    İdrar yolu enfeksiyonundan izole edilen patojenik Escherichia coli bakteri suşlarının antibiyotik direncinin ve genetik özelliklerinin belirlenmesi

    Determination of antibiotic resistance and genetic properties of pathogenic Escherichia coli bacterial strains isolated from urinary tract infection

    OSAMAH FAISAL KOKAZ ALZUBAIDI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    GenetikKastamonu Üniversitesi

    Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NEJDET GÜLTEPE

Geri Dön