Türkiye'deki bazı etçil memeli türlerinin (Mammalia: Carnivora) DNA barkodlaması
Dna barcoding of some carnivorous mammal species (Mammalia: Carnivora) in Turkey
- Tez No: 864589
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ PERİNÇEK SEÇKİNOZAN ŞEKER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Artvin Çoruh Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışması kapsamında, Türkiye'de yaşayan bozayı (Ursus arctos), altın çakal (Canis aureus) ve kaya sansarı (Martes foina) olarak bilinen üç farklı karnivor memeli türünün DNA barkod bölgesi olarak bilinen mitokondriyal DNA'da bulunan sitokrom oksidaz c alt ünite I geni (COI) dizilendi. Elde edilen DNA dizileri, NCBI (National Center for Biotechnology Information) veritabanındaki BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) seçeneği kullanılarak, veritabanında mevcut olan diğer türlere ait diziler ile benzerlik bakımından (PI, pairwise identity, ikili benzerlik) karşılaştırıldı. Bunun yanı sıra, COI gen dizileri, Neighbour-Joining ve haplotip örgüsü olmak üzere, iki farklı filogenetik analiz yöntemine tabi tutuldu. BLAST sorgusu ve filogenetik analizler sonucunda, çalışılan türlere ait barkodlama bölgelerinin bu türler için taksonomik çalışmalarda karşılaşılan sorunların çözümü için faydalanılabilecek bir moleküler belirteç olabileceği kanısına varıldı.
Özet (Çeviri)
Within the scope of this study, the cytochrome oxidase c subunit I gene region (COI) of mitochondrial DNA, known as the DNA barcode region, of three different carnivorous mammal species living in Turkey, known as the brown bear (Ursus arctos), the golden jackal (Canis aureus) and the rock marten (Martes foina), was sequenced. The obtained DNA sequences were compared in terms of similarity (PI, pairwise identity, pairwise similarity) with the sequences of other species available in the database using the BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) option in the NCBI (National Center for Biotechnology Information) database. In addition, COI gene sequences were subjected to two different phylogenetic analysis methods: Neighbour-Joining and haplotype network. As a result of BLAST query and phylogenetic analyses, it was concluded that the barcoding regions of the studied species could be a molecular marker that can be used to clear the problems encountered in taxonomic studies for these species.
Benzer Tezler
- Ankara ili ve çevresindeki kene türlerine ait bazı ekolojik ve epidemiyolojik veriler
Some ecological and epidemiological data belonging to tick species in ankara and around
ÖMER ORKUN
- La Vie artistique litteraire culturelle et sociale l'Izmir en langue Française (du XVII'eme siecle a nos jours)
Fransızca'da İzmir'in sanatsal edebi kültürel ve toplumsal yaşamı (XVII'inci yüzyıldan günümüze)
HASAN ZORLUSOY
- Türkiye'deki ev hayvanları veteriner hekimlerinin bazı sosyo-demografik parametreleri ile kliniklerin teknik ve ekonomik analizi
Some socio-demographic parameters of companion animals veterinary medicine in Rurkey and technical and economic analysis of the clinics
CANBERK BALABAN
- Erzurum ve Erzincan yörelerindeki bazı bitkilerde bulunan eriophyoi dea (acarina:actinedida) akarları üzerinde çalışmalar
Studies an eriophyoid mites (eriophyoidea:acarina) on some plants in Erzurum and Erzincan regions
ÖZDEMİR ALAOĞLU
- Türkiye'de nüfusunu yitiren kırsal yerleşimlerin korunması için bir yöntem önerisi: Ödemiş-Lübbey Köyü örneği
A model proposal for conservation of abandoned rural settlements in Turkey: Case study of Odemis-Lubbey Village
KORAY GÜLER
