Geri Dön

Tavuk dışkılarından izole edilen Salmonella serovarlarının antibiyotik direnç profillerinin araştırılması

Investigetion of antibiotic resistance profiles of Salmonella serovars isolated from chicken feces

PDF İndir

  1. Tez No: 870080
  2. Yazar: NUR SELCEN AKKAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEYYAL AK, DOÇ. DR. MEHMET CEMAL ADIGÜZEL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Veteriner Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 81

Özet

Bu çalışmada farklı tavukçuluk işletmeleri ve kesimhanelerden alınan dışkı örneklerinde Salmonella enterica serovarlarının prevalansı, serotip dağılımı ve antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi ve güncellenmesi amaçlandı. İstanbul, Balıkesir, Erzurum ve Erzincan illerindeki tavukçuluk işletmeleri ve kesimhanelerden Mart 2020-Aralık 2021 tarihleri arasında kloakal sürüntü ve kesimhane materyalini (sekum) içeren toplam 550 adet örnek Salmonella spp. yönünden incelendi. Toplanan örneklerde Salmonella spp. saptanması için ISO 6579:2002/Amd 1:2007 kültür metodu kullanıldı. Konvansiyonel testlerle Salmonella spp. olduğu saptanan suşların invazyon A(invA) genine spesifik primerlerin kullanıldığı PCR ve BD Phoenix™ ile doğrulaması yapıldı. İzolatların White Kauffmann-Le Minor-Şeması'na göre serotiplendirilmesi yapıldı. İzolatlar, çoklu antibiyotik dirençliği, genişlemiş spektrumlu beta laktamaz (GSBL), karbapenem ve AmpC beta laktamaz pozitifliği yönünden incelendi. Bu örneklerin selektif katı besiyerindeki koloni morfolojilerine göre 76 izolatın (%13,8) Salmonella spp. şüpheli koloni görünümüne sahip olduğu belirlendi. Yapılan konvansiyonel biyokimyasal testler, BD Phoenix™ M50 cihazı ve PCR analizi sonucunda 50 izolatın (%9,1, 50/550) Salmonella spp. olduğu saptandı. White-Kauffmann-Le Minor-Şeması'na göre serotiplendirilen izolatların tamamının Salmonella enterica subsp. enterica serovar Molade(8,20:z10:z6) olduğu saptandı. Antimikrobiyal duyarlılık testi sonucunda izolatların siprofloksasin'e %100.0 (50/50), tigesikline ise %88 (44/50) dirençli olduğu belirlendi. İzolatların tamamının GSBL, karbapenem ve AmpC beta laktamaz yönünden negatif olduğu belirlendi. İzolatlardan herhangi birinin üç veya daha fazla antibiyotiğe karşı direnç göstermediği için bu çalışmada çoklu antibiyotik dirençli izolat belirlenmedi. Elde edilen sonuçlar, Türkiye'de entegre bir işletmeden kesimhaneye gelen hayvanlarda saptanan S. Molade izolatlarında hayvan preparatları olmamasına rağmen saptanan yüksek oranda siprofloksasin ve tigesiklin direnci üzerinde durulması gerektiği ve bu antibiyotiklerin halk sağlığı açısından oldukça önemli olduğunu gösterdi. Özellikle hayvan izolatlarında direnç saptanması için kullanılan antibiyotik panellerinin de güncellenmesi ve hayvanlarda kullanılmasa bile halk sağlığı açısından önem taşıyan antibiyotiklerde gelişebilecek direnç durumlarının sürekli olarak izlenmesi gerektiği düşünüldü.

Özet (Çeviri)

In this study aimed to determine and update the prevalence, serotype distribution and antibiotic resistance profiles of Salmonella enterica serovars in fecal samples taken from poultry farms and slaughterhouses. A total of 550 samples, including cloacal swab and slaughterhouse material (cecum) from poultry farms and slaughterhouses in Istanbul, Balıkesir, Erzurum and Erzincan provinces, were examined for Salmonella spp. between March 2020 and December 2021. ISO 6579:2002/Amd 1:2007 culture method was used to detect Salmonella spp. in the collected samples. Strains identified as Salmonella spp. by conventional tests were confirmed with PCR and BD Phoenix™ using primers specific to the invasion A (invA) gene. The isolates were serotyped according to the White-Kauffmann-Le Minor-Scheme. The isolates were examined for multiple antibiotic resistance, Extended-spectrum Beta Lactamase (ESBL), carbapenem and AmpC beta lactamase positivity. According to the appearance of these samples on the selective solid medium, 76 isolates (13.8%) were determined to have a suspicious Salmonella spp. colony appearance. As a result of conventional biochemical tests, BD Phoenix™ M50 device and PCR analysis, 50 isolates (9.1%, 50/550) were confirmed to be Salmonella spp. All of the isolates serotyped according to the White Kauffmann-Le Minor-Scheme were determined to be Salmonella enterica subsp. enterica serovar Molade (8,20:z10:z6). As a result of the antimicrobial susceptibility test, it was determined that the isolates were 100.0% (50/50) resistant to ciprofloxacin and 88% (44/50) resistant to tigecycline. All isolates were determined to be negative for Extended Spectrum Beta Lactamase (ESBL), carbapenem and AmpC beta lactamase. No multiple antibiotic resistant isolates were identified in this study, as none of the isolates showed resistance to three or more antibiotics. The results obtained showed that the high rate of ciprofloxacin and tigecycline resistance detected in S. Molade isolates detected in animals coming to the slaughterhouse from an integrated enterprise in Turkey, although there were no animal preparations, should be emphasized and that these antibiotics are very important for public health. It was thought that the antibiotic panels used to detect resistance, especially in animal isolates, should be updated and the resistance situations that may develop in antibiotics that are important for public health, even if they are not used in animals, should be constantly monitored.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    753511

    Kanatlı hayvan işletmelerinde salmonella serotiplerine özgü litik faj izolasyonu ve karakterizasyonu

    Lytic phage isolation and characterization specific to salmonella serotypes in poultry enterprise

    AYŞEGÜL ÜNVERDİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BANU KAŞKATEPE

  2. Tez No

    138320

    Bazı kanatlıların dışkılarında salmonella türlerinin varlığı ve yaygınlığı ile antibiyotiklere duyarlılığı

    The occurance and prevalence salmonella species in faeces of certain fowls and their susceptibility to antibiotics

    ABDULBAKİ AKSAKAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BANUR BOYNUKARA

  3. Tez No

    203117

    Çeşitli hayvan dışkılarında Salmonella etkenlerinin konvansiyonel ve moleküler yöntemlerle saptanması

    Detection of Salmonella strains from animal faeces by conventional and molecular methods

    SEYİT CANPOLAT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MEHMET AKAN

  4. Tez No

    368858

    Subtyping of Salmonella isolated from human clinical and animal non-clinical cases, as well as different food samples using pulsed field gel electrophoresis (PFGE)

    Klinik insan vakaları, klinik olmayan hayvan vakaları ve farklı gıdalardaki Salmonella çeşitliliğinin vuruşlu alan jel elektroforezi (PFGE) kullanılarak moleküler düzeyde belirlenmesi

    ECE BULUT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. YEŞİM SOYER

    PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ

  5. Tez No

    578031

    Tavuk dışkılarından izole edilen escherichia coli'lerde plazmit aracılı kolistin direnci sağlayan MCR--1 geninin araştırılması

    Investigation of the plasmid mediated colistin resistance gene MCR-1 in escherichia coli isolates from chicken feces

    NİLÜFER ERZAİM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERKAN İKİZ

Geri Dön