Kan kültüründen izole edilen Pseudomonas aeruginosa suşlarında karbapenem direnç mekanizmalarının fenotipik ve moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation of Carbapenem resistance mechanisms by phenotypic and molecular methods in Pseudomonas aeruginosa strains isolated from blood culture
- Tez No: 872619
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ESRA ÖZKAYA
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Karbapenem dirençli Pseudomonas aeruginosa (KDPA) tüm dünyada önemli bir enfeksiyon etkeni olarak görülmektedir. Bu çalışmada kan kültüründe üreyen P. aeruginosa izolatlarında karbapenem direnci ile ilişkili mekanizmaların araştırılması amaçlanmıştır. Yöntem: Çalışmamıza kan örneklerinden üretilen KDPA izolatları dahil edildi. Karbapenem minimum inhibitor konsantrasyon değerleri sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle belirlendi. Karbapenemaz üretiminin tespiti için karbapenem inaktivasyon metodu ve karbapenemaz genlerinin araştırılması için polimeraz zincir reaksiyonu kullanıldı. İndüklenebilir AmpC β-laktamaz tespiti için disk antagonizm testi yapıldı. Efluks pompasının aşırı üretimi, efluks pompa inhibitörü olan fenilalanin-arjinin β-naftilamid kullanılarak sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle ve çeşitli efluks pompa genlerinin (mexB, mexD, mexF, mexY) gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) yöntemiyle belirlendi. Porin proteini geni oprD'nin ekspresyon seviyeleri RT-PCR ile incelendi. Bulgular ve Sonuç: Kan örneklerinden izole edilen 48 KDPA izolatı çalışmaya dahil edildi. İzolatların tamamı imipeneme, %97,9'u doripeneme, %75'i meropeneme dirençli ve %50'sinin çok ilaca dirençli olduğu saptandı. İzolatların 7'sinde (%14,6) fenotipik olarak karbapenemaz varlığı tespit edildi ve blaVIM geni bulundu diğer karbapenemaz genleri ise tespit edilemedi. İzolatların 23'ünde (%47,9) indüklenebilir AmpC β-laktamaz varlığı saptandı. İzolatların 35'inde (%72,9) fenotipik olarak efluks pompasının aşırı ekspresyonu tespit edildi; 36'sında (%75) mexY, 5'inde (%10,5) mexB, 5'inde (%10,5) mexF ve 1'inde (%2) mexD efluks pompası geninin aşırı ekspresyonu saptandı. İzolatların hiçbirinde oprD geninin ekspresyon seviyesinin anlamlı azalması belirlenemedi.
Özet (Çeviri)
Objective: Carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa (CRPA) is considered an important infection agent all over the world. This study aimed to investigate the mechanisms associated with carbapenem resistance in P. aeruginosa isolates grown in blood culture. Methods: CRPA isolates grown from blood samples were included in our study. Carbapenem minimum inhibitor concentration values were determined by the broth microdilution method. The carbapenem inactivation method was used to detect carbapenemase production and the polymerase chain reaction was used to investigate carbapenemase genes. Disc antagonism test was performed for detection of inducible AmpC β-lactamase. Overproduction of the efflux pump was determined by the broth microdilution method using the efflux pump inhibitor phenylalanine-arginine β-naphthylamide and by real-time polymerized chain reaction (RT-PCR) of various efflux pump genes (mexB, mexD, mexF, mexY). Expression levels of the porin protein gene oprD were examined by RT-PCR. Results and Conclusions: 48 CRPA isolates isolated from blood samples were included in the study. All the isolates were resistant to imipenem, 97,9% were resistant to doripenem, 75% were resistant to meropenem and half were found to be multidrug resistant. The presence of carbapenemase was detected phenotypically in 7 of the isolates (14,6%), and the blaVIM gene was found, while other carbapenemase genes could not be detected. Inducible AmpC β-lactamase was detected in 23 (47,9%) of the isolates. Overexpression of the efflux pump was detected phenotypically in 35 (72,9%) of the isolates; Overexpression of the efflux pump gene mexY was detected in 36 (75%), mexB in 5 (10,5%), mexF in 5 (10,5%) and mexD in 1 (2%) of the isolates. No significant decrease in the expression level of the oprD gene was detected in any of the isolates.
Benzer Tezler
- Atherosklerotik kalp hastalıklarında risk faktörleri
Risk factors in the coronary artery disease
MURAT SUHER
- Testosteron dihidrotestosteron ve östrojenin benign prostat hiperplazisindeki etyolojik rolleri
The roles of testosterone, dihydrotestosterone and estradiole on the etiology of benign prostatic hyperplasia
HALUK TOKUÇOĞLU
- Çocuklarda akut stres hiperglisemisinde hormonal değişikliklerin ve kısa süreli prognozun incelenmesi
Başlık çevirisi yok
AYGÜN DİNDAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Hemşireliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜLYA GÜNÖZ
- Pulmoner hipertansiyon etyopatogenezinde prostasiklin ve lökotrien C4'ün rolü
Possible role of leukotrien C4 and prostacyclin in the development of pulmonary hypertension
ÜLKÜ AYBERK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGazi ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı