Immunogenic and molecular methods detection of HHV-6 and interleukin-10 genetic polymorphisms in patients with B-cell non-Hodgkin lymphoma
B hücre non-Hodgkin lenfoma hastalarında HHV-6 ve interlökin-10 genetik polimorfizmlerinin immunolojik ve moleküler yöntemlerle belirlenmesi
- Tez No: 873245
- Danışmanlar: DOÇ. DR. TÜLİN GÜVEN GÖKMEN, PROF. DR. SHAKİR H. MOHAMMED AL-ALWANY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Viral hepatit, İnterlökin 10, Interleukin 10
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Lenfoma yaygın bir hematopoietik kanserdir. Hodgkin olmayan lenfoma (NHL), en sık görülen lenfoma türlerinden biridir. Etiyolojisinde birçok virüs, çeşitli sitokinlerin düzeyleri ve polimorfizmleri incelenmektedir. Bu çalışmanın amacı, Irak popülasyonundan oluşan bir grupta Human Herpes Virüsü-6 (HHV-6) varlığının, IL-10 düzeyinin ve IL-10 rs1518111 lokusundaki polimorfizmin, malign NHL etiyolojisinde risk potansiyellerini belirlemektir. İki yüz kan örneğini (100 Hodgkin dışı lenfoma vakası ve 100 görünüşte sağlıklı kontrol) içeren kesitsel bir vaka kontrol çalışmasında PCR yöntemi kullanılarak HHV-6 tespiti yapıldı ve IL-10 rs1518111 gen polimorfizmi incelendi. IL-10 seviyelerini incelemek için ELISA yöntemi kullanıldı. Sonuç olarak bu çalışmaya dahil edilen 100 NHL'lı hastanın kan örneğinin %42'sinde (100 üzerinden 42) viral enfeksiyon olduğu tespit edildi. Kontrol grubu olarak incelenen sağlıklı görünen hastaların örneklerinin tamamında hiçbir viral nükleik asit belirlenmedi. HHV-6A PCR ile %40,5'inin pozitif, %59,5'inin negatif olduğunu görüldü. HHV-6B PCR ile %35,7'sinin pozitif ve %64,3'ünün negatif olduğunu belirlendi. IL-10 polimorfizmleri açısından gen ekspresyon düzeylerine göre hem TT hem de CC'nin kontrol grubuna göre istatistiksel olarak yüksek olduğu görüldü (P<0.05). Ayrıca serum IL-10 konsantrasyonu, NHL hastalarında kontrol gruplarına göre anlamlı derecede yüksekti. Mevcut sonuçlar, HHV-6 ve IL-10 rs1518111 polimorfizminin, yüksek IL-10 seviyesinin tümör biyolojisinde rol oynayabileceğini ve NHL gelişimine katkıda bulunabileceğini düşündürmektedir.
Özet (Çeviri)
Lymphoma is a common hematopoietic cancer. Non-Hodgkin lymphoma (NHL) is one of the most common types of lymphoma. Many viruses, levels and polymorphisms of various cytokines are examined in its etiology. The aim of this study was to determine whether the percentage of Human Herpes Virus-6 (HHV-6), IL-10 level, and polymorphisms in the IL-10 rs1518111 locus modulate the risk of developing malignant NHL in a group of Iraqi population samples. In a cross-sectional case-control study involving 200 blood samples (100 non-Hodgkin's lymphoma cases and 100 apparently healthy controls), HHV-6 detection was performed using the PCR method and the IL-10 rs1518111 gene polymorphism was examined. ELISA method was used to examine IL-10 levels. As a result, 42% (42 out of 100) of the 100 NHL blood samples included in this study were found to have viral infection. No viral nucleic acid was detected in all (100) seemingly healthy samples examined as a control group. A positive result by PCR showed that 40.5% were HHV6 A positive and 59.5% were negative. A positive result by PCR showed that 35.7% were HHV6 B positive and 64.3% negative. For IL-10 polymorphisms, both of TT and CC were statistically higher than those of the control group according to the gene expression levels (P<0.05). Besides, serum IL-10 concentration was significantly higher in NHL patients and relative to apparently healthy control (AHC) groups. The present results suggest that the HHV-6 and IL-10 rs1518111 polymorphism, IL-10 high level may play a role in tumor biology and may contribute to the development of NHL.
Benzer Tezler
- Theileria annulata'nın tanısında serolojik (indirekt ELISA) ve moleküler (PZR, çoklu PZR ve lamp) yöntemlerin geliştirilmesi
Development of serological (indirect ELISA) and molecular (PCR, multiplex PCR and LAMP) techniques for the detection of Theileria annulata
HÜSEYİN BİLGİN BİLGİÇ
Doktora
Türkçe
2010
ParazitolojiAdnan Menderes ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TÜLİN KARAGENÇ
- Leishmania tropica parazitlerinden elde edilen immünojen moleküllere karşı tanıda kullanılmak üzere hibridoma teknolojisine dayalı antikor üretilmesi
Generation of hybridoma technology based antibodies against immunogen molecules isolated from leishmania tropica parasites in order to use in diagnosis
ASLI PINAR ZORBA
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyomühendislikYıldız Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ADİL ALLAHVERDİYEV
DR. EMRAH ŞEFİK ABAMOR
- Biyoinformatik yöntemler kullanılarak kene patojenlerinin moleküler verilerinde aşı adayı bölgelerinin saptanması
Bioinformatics detection of vaccine candidate regions in molecular data of tick pathogens
AHMET EFE KÖSEOĞLU
- Nörotoksin analizi için immünassay geliştirilmesi
Development of immunoassay for neurotoxin analysis
MERYEM IŞIK
Doktora
Türkçe
2021
MikrobiyolojiKocaeli ÜniversitesiTıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NACİ ÇİNE
DOÇ. DR. SELMA ÖZTÜRK
- Helicobacter pylori pozitif fonksiyonel dispepsili hastalarda Cag A varlığının eradikasyon tedavisindeki başarıya ve semptomatik iyileşmeye etkisi
The role of the Cag A status on the rates of treatment success and symptom relief of helicobacter pylori eradication in patients with functional dyspepsia
ÖNDER OVALI