Association of mitochondrial DNA copy number variations in triple negative breast cancer patients
Mitokondriyal DNA kopya sayısı değişimleri ile üçlü negatif meme kanseri arasaındaki ilişki
- Tez No: 880715
- Danışmanlar: PROF. DR. UĞUR ÖZBEK, DOÇ. CEMALİYE AKYERLİ BOYLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Meme kanseri, Mitokondriyal DNA, PCR, Mitochondrial DNA
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genom Çalışmaları Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genom Çalışmaları Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Üçlü Negatif Meme Kanseri Hastalarında Mitokondriyal DNA Kopya Sayısı Değişimlerinin İlişkisi Araştırmalar mitokondriyal DNA (mtDNA) kopya sayısı değişimlerinin çeşitli kanser türleriyle ilişkili olduğunu ortaya koymaktadır. Bu bağlamda, mtDNA kopya sayısı değişimleri (KSD), kanser için güçlü bir biyobelirteç adayıdır. Üçlü negatif meme kanseri (ÜNMK), meme kanserinin en agresif alt tipi olarak kabul edilmektedir, bu nedenle tedavi yöntemlerinin hastanın gereksinimlerine göre dikkatle seçilmesi önemlidir. Ancak mtDNA KSD ve ÜNMK arasındaki spesifik ilişki bilinmemektir. Tanı ve tedavi yaklaşımlarında mtDNA'nın rolünün anlaşılması bu hastaların prognozuna ve etkin tedavi almalarına önemli katkılar sağlayabilir. Bu kapsamda amacımız neoadjuvan kemoterapisi gören ÜNMK hastalarında mtDNA KSD'lerini araştırarak prognostik amaçlar için mtDNA biyobelirteci tanımlamaktır. Bu doğrultuda, tümör dokularından ve bu dokulara karşılık gelen sağlıklı dokulardan total DNA izolasyonu gerçekleştirildi. Sonrasında mtDNA KSD'leri SYBR-green'e dayalı kantitatif gerçek zamanlı-PZR ile ölçüldü. Sonuçların anlamlılığını değerlendirmek için Student T testi ile istatistiksel analizler yapıldı, (P<0.05). Yapılan analizler sonucunda 23 örnekten 18'inde tümör dokusundaki mtDNA seviyesi, karşılık gelen normal dokuya kıyasla anlamlı ölçüde daha düşük seviyede tespit edildi. Çalışmamızda analiz edilen örneklerde yaş, neoadjuvan kemoterapiye yanıt durumu ile mtDNA seviyeleri arasında anlamalı bir ilişki bulunamadı. Sonuç olarak, risk değerlendirmesi için biyobelirteç olarak kullanılacak mtDNA KSD'nin klinik etkilerini tam olarak aydınlatmak için daha fazla araştırma yapılması gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
Association of Mitochondrial DNA Copy Number Variations in Triple Negative Breast Cancer Patients Alterations in mitochondrial DNA (mtDNA) have been associated with various cancer types, impacting cancer risk, metastasis, and prognosis. In this context, mtDNA copy number variations (CNV) are strong candidate biomarkers. Triple negative breast cancer (TNBC) is the most aggressive subtype, therefore it is crucial to choose treatment methods. However, the specific relationship between mtDNA-CNV and TNBC is unknown. Understanding mtDNA's role in diagnosis and treatment approaches can significantly contribute to the prognosis and effective treatment of these patients. Our aim is to identify mtDNA biomarkers for prognostic purposes by investigating mtDNA CNV in TNBC patients undergoing neoadjuvant treatment. To achieve this, total DNA was isolated from tumors and corresponding normal tissues. Quantification of mtDNA and nuclear DNA (nDNA) was conducted using real-time quantitative PCR with SYBR-green and specific primers. Statistical analyses, including student's t-test, were performed to evaluate the significance of the results (P<0.05). Among 23 samples, 18 exhibited a decrease in mtDNA content in tumor tissue compared to its corresponding normal tissue, significantly. In our study, there was no significant association between age, response to neoadjuvant chemotherapy and mtDNA content in analyzed samples. In conclusion, further research is necessary to fully elucidate the clinical implications of mtDNA CNV to be used as a biomarker for risk assessment.
Benzer Tezler
- İnfertil erkeklerde paternal kalıtımla ilişkili endog geninin analizi
Analysis of the endog gene associated with paternal inheritance in infertile men
MEHMET ULAŞ BİLİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
İstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Yükleniyor...
- Mitokondriyal DNA değişimlerinin kanser ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of mitochondrial DNA changes in association to cancer
CENK ARAL
- Non-alkolik steatohepatit'de mitokondriyal DNA kontrol bölgesi nükleotit varyasyonları ve olası haplotiplerin hastalığın patogeneziyle ilişkisi
The association of mitochondrial DNA control region nucleotide variations and their potential haplotypes with the pathogenesis of non-alcoholic steatohepatitis
BURCU HASTÜRK
- Mitokondriyal MOTS-C geni nükleotit varyasyonlarının nonalkolik yağlı karaciğer hastalığı etyopatogenezi ile ilişkisi
The associ̇ati̇on of mi̇tochondri̇al MOTS-C gene nucleoti̇de vari̇ati̇ons wi̇th the eti̇opathogenesi̇s of non-alcoholi̇c fatty li̇ver di̇sease
AYÇA ÖNAL
- The association of parkinson's disease with dna topoisomerase IIβ in neural-differentiated SH-SY5Y cell line
Parkinson hastalığı ile nöral farklılaşmış SH-SY5Y hücre hattında dna topoizomeraz IIβ ilişkisinin araştırılması
BERÇEM YEMAN
