Non-alkolik steatohepatit'de mitokondriyal DNA kontrol bölgesi nükleotit varyasyonları ve olası haplotiplerin hastalığın patogeneziyle ilişkisi
The association of mitochondrial DNA control region nucleotide variations and their potential haplotypes with the pathogenesis of non-alcoholic steatohepatitis
- Tez No: 462722
- Danışmanlar: DOÇ. DR. FATİH EREN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Gastroenteroloji, Genetik, Tıbbi Biyoloji, Gastroenterology, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 69
Özet
Amaç: Bu çalışmada, mitokondriyal DNA (mtDNA) kontrol bölgesinde yer alan T16189C gibi yaygın varyantlar ile non-alkolik steatohepatit (NASH) arasındaki ilişki araştırıldı. Gereç ve Yöntem: 150 NASH ve 150 sağlıklı kontrol bireyin yaş ve cinsiyeti eşleştirildi.“Endonükleaz MnlI enzimi”kullanılarak restriksiyon parça uzunluk polimorfizm (RFLP) analizi ile mtDNA 16189 np genotipleri incelendi ve doğrudan dizi analizi ile mtDNA kontrol bölgesi (15911-16540 np) varyasyonları saptandı. Bulgular: T16189C polimorfizmi açısından gruplar arasında anlamlı bir fark yoktu, ancak atipik RFLP bant paternlerine sahip bireyler tespit edildi ve dizi analizi ile sınıflandırıldı. Yeni bir mutasyon (C16053G) ve iki yeni heteroplazmik varyasyon (16234 C-CT; 16256 C-CT) tanımlandı. Ayrıca üç tri-nükleotit polimorfizmi (C16294-C16295-C19296, TTT; C16187-C16188-T16189, TAC; C16187-C16188-T16189, TGC) bulundu. Katılımcıların tümü R makro-haplogrubu, H2a2a1 haplotipi idi. Bu varyasyonlar arasında, NASH grubu içinde, mtDNA kontrol bölgesi nükleotit varyasyonlarından bazıları istatistiksel olarak anlamlı bulundu. Sonuçlar: mtDNA kontrol bölgesi nükleotit varyasyonlarının NASH patogenezi üzerindeki etkisinin daha geniş çalışma gruplarında araştırılmasının önemi anlaşıldı. Atipik paternlere neden olan nükleotit kombinasyonlarının varlığı nedeniyle, kullanılan MnlI PZR-RFLP analizinin, T16189C polimorfizmini tespit etmekte hassas bir yöntem olmadığı ortaya çıkarıldı. mtDNA T16189C varyantını MnlI PZR-RFLP ile araştıranların, doğru sonuçları bildirmek adına yayınlarını revize etmesi gerektiği anlaşıldı.
Özet (Çeviri)
Aim: In this study, the relationship between non-alcoholic steatohepatitis (NASH) and common variants such as T16189C in the mitochondrial DNA (mtDNA) control region was investigated. Materials and Methods: We matched 150 NASH and 150 healthy controls for age and sex. We detected mtDNA np 16189 genotypes by restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis with MnII enzyme and identified mtDNA control region (np 15911-16540) variations by direct sequencing analysis. Findings: There was no significant difference between groups for T16189C polymorphism, but we individuals with atypical RFLP banding patterns were identified and classified. A novel mutation (C16053G), two new heteroplasmic variations (16234 C-CT; 16256 C-CT) were determined. Also, three trinucleotide polymorphisms (C16294-C16295-C19296, TTT; C16187-C16188-T16189, TAC; C16187-C16188-T16189, TGC) were found. All of the participants were H2a2a1 haplotype. Among these variations, there were statistically significant some of the nucleotide variations in the mtDNA control region in the NASH group. Results: It was understood that the effect of nucleotide variations on the pathogenesis of NASH in the mtDNA control region should be investigated in larger study groups. Due to the presence of nucleotide combinations causing atypical patterns, the MnII PCR-RFLP assay used was found to be non-sensitive to detect T16189C polymorphism. It was understood that those who studied the T16189C variant with MnlI PCR-RFLP should revise their publications to report the correct results.
Benzer Tezler
- Mitokondriyal DNA nikotinamid adenin dinükleotid dehidrogenaz 5 12361 adenin/guanin ve displacement-loop 16189 timin/citozin polimorfizmlerinin nonalkolik steatohepatit hastalarında görülme sıklığı ve klinik önemi
The prevalence and clinical significance of 12361 adenine/guanine in mitochondrially encoded NADH dehydrogenase 5 and 16189 thymine/cytosine in mitochondrial displacement-loop polymorphisms in nonalcoholic steatohepatitis
EMEL GÜNER
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
GenetikMarmara ÜniversitesiTemel Tıp Bilimleri Bölümü
YRD. DOÇ. DR. FATİH EREN
- Nonalkolik yağlı karaciğer hastalığında mitokondriyal nikotinamid adenin dinükleotid dehidrogenaz 5 (nd5) geni mt12361a/g polimorfizminin klinik önemi
Clinical signifiance of mt12361a/g polymorphism in mitochondrial nicotinamide adenin dinükleotide dehidrogenase 5 (nd5) gene in nonalcoholic fatty liver disease
MERVE ORKUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
GenetikMarmara ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. FATİH EREN
- Non-alkolik steatohepatitde peroksizom proliferatörleri ile aktive olan reseptör-alfa ekspresyonun klinik ve histopatolojik parametreler ile ilişkisi
The relationship between PPAR-α expression, the clinical and the histopathological parameters of the nonalcoholic steatohepatitis
METİN RAHŞAN OLGA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2006
GastroenterolojiAnkara Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. HAKAN BOZKAYA
- Non-alkolik steatohepatitte pentoksifilin tedavisinin etkinliği
Non-alkoli̇k steatohepati̇tte pentoksi̇fi̇li̇n tedavi̇si̇ni̇n etki̇nli̇ği̇
ÖZLEM MUTLUAY SOYER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
GastroenterolojiSağlık Bakanlığıİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NECATİ YENİCE
- Non-alkolik steatohepatit'li ratlarda metformin, rosiglitazon, N-asetilsistein ve etodolakın tedavi edici etkilerinin değerlendirilmesi
Evaluation biochemical therapeutic effect of metformin, roziglitazon, N-Acetyl cysteine and etodalac in a model of nonalcoholic steatohepatitis in the rat
SEDAT YILMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
BiyokimyaDicle ÜniversitesiBiyokimya ve Klinik Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NAİME CANORUÇ