Endoplazmik retikulum stresi yanıt belirteçleri ve apoptotik marker C/EBP homolog proteini düzeylerinin COVİD-19 tanılı hastalardaki etkisi
The effect of endoplasmic reticulum stress response markers and apoptotic marker C-EBP homologous protein levels in patients of COVİD-19
- Tez No: 880874
- Danışmanlar: PROF. DR. DİLDAR KONUKOĞLU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 109
Özet
Hücrelerde protein sentez ihtiyacının artması, yapısal ya da fonksiyonel proteinlerin doğru katlanma kapasitesini bozar. Hücreler, bir tür hayatta kalma stratejisi olarak; protein katlama kapasitelerini, artmış ihtiyaç doğrultusunda tekrar düzenleme yoluna giderler. Bu düzenlemenin sağlanmasına kadar geçen sürede stres altındaki hücrede biriken yanlış katlı proteinler;“hatalı katlanmış protein cevabı (UPR) yolağı”olarak bilinen endoplazmik retikulum (ER) ile ilişkili bir dizi transkripsiyonel ve translasyonel süreci tetikler. Kronik streste UPR yolağı düzenleyici yerine sonlandırıcı başka bir planı devreye sokarak hücrenin apoptoz yoluyla kendi kendini ortadan kaldırmasının önünü açabildiğinden dolayı UPR birçok anormalinin hem sebebi hem de tedavisinde kilit noktadadır. Çalışmamızda ER stresi cevabı belirteçleri GRP78, PERK, eIF2alfa, ATF4, GADD34, CHOP ve miRNA-199 düzeyleri SARS-CoV-2 modelinde çalışılmış bu amaç doğrultusunda ARDS ve PCR kriterleri ile COVID-19 tanısı alarak hastaneye yatırılan 74 hasta ve sağlıklı 26 kontrol gönüllüsü çalışmaya dahil edilmiştir. Hasta grubu sonlanma şekline göre n= 49 kişi Sağ Kalım grubu n=25 kişi Ex grubu şeklinde ayrılmıştır. Çalışmamızda GRP78'in ve PERK'in viral yükün miktarından bağımsız olarak enfeksiyon durumunda sırasıyla aktive olarak yüksek kaldığı ve UPR'yi aktive ettiği bulunmuştur. Sağ Kalım grubunda stress ile beraber GADD34 proteini artışının, eIF2α'nin güçlü inhibisyonuna, böylece hücrede askıya alınmış protein translasyonu inhibisyonun ortadan kalkmasına, hücresel proteinlerin tekrar sentezine ve apoptotik belirteç CHOP'un azalmasına sebep olduğu bulunmuştur. Ex grubunda ise ilk ölçümden son ölçüme GADD34 değerindeki azalmanın, eIF2α'nin baskılanamamasına, hücresel protein translasyonunun durması ve sağkalım ile ilişkili proteinlerden ATF4'ün anlamlı artışına, bu artışın da apoptotik protein CHOP'un giderek artarak hücreyi apoptoza sürüklemesine sebep olduğu bulgulanmıştır.
Özet (Çeviri)
The increased requirement for protein synthesis in cells disrupts the correct folding capacity of structural or functional proteins. As a survival strategy, cells try to rearrange their protein folding capacity in line with the increased protein folding need. In the period until this regulation is achieved, misfolded proteins accumulate in the stressed cell; It triggers a series of transcriptional and translational processes associated with the endoplasmic reticulum (ER) known as the“misfolded protein response (UPR) pathway”. In chronic stress, the UPR pathway is at a key point in both the cause and treatment of many abnormalities, as it can pave the way for the cell to eliminate itself through apoptosis by activating another terminating plan instead of the regulator. In our study, the levels of ER stress response markers GRP78, PERK, eIF2alpha, ATF4, GADD34, CHOP and miRNA-199 were studied in the SARS-CoV-2 model. For this purpose, 74 patients who were hospitalized with a diagnosis of COVID-19 using ARDS and PCR criteria and 26 healthy control volunteers were included. According to termination patients were grouped as n = 49 Survival group and n = 25 as Ex group. In our study, GRP78 and PERK remained high and activated UPR, respectively, in case of infection, regardless of the amount of viral load, and the increase in GADD34 protein with eustress in the Survival group resulted in strong inhibition of eIF2α, which resulted in suspended protein translation in the cell. It was found to cause the removal of inhibition, re-synthesis of cellular proteins and reduction of the apoptotic marker CHOP. In the Ex group, it was found that the decrease in GADD34 value from the first measurement to the last measurement caused eIF2α not to be suppressed, cellular protein translation stopped, and ATF4, one of the proteins associated with survival, increased significantly, and this increase caused the apoptotic protein CHOP to increase gradually, dragging the cell into apoptosis.
Benzer Tezler
- Bombyx mori posterior ipek bezinde, otofaji mekanizmasında rol alan otofaji bağlantılı gen ATG6'nın susturulmasının apoptotik sürece etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of silencing the autophagy-related gene ATG6 on the apoptotic process in the Bombyx mori posterior silk gland
BÜŞRA GÜNAY
- Impacts of high-fat diet and genotype on blood-brain barrier and synaptic integrity in mouse cerebral cortex: An exploration of PERK pathway
Yüksek yağlı diyet ile genotipin farenin serebral korteksinde kan-beyin bariyeri ve sinaptik bütünlüğe etkileri: PERK yolağının araştırılması
BÜŞRANUR ŞEKER
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiNörobilim Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MICHELLE MARIE ADAMS
- X ışınlama ile indüklenen testiküler hasarda amniyon membranı kökenli mezenkimal kök hücrelerin oksidatif ve endoplazmik retikulum stresi mekanizmalarına etkisi
Effects of amnion membrane derived mesenchymal stem cells on oxidative and endoplasmic reticulum stress mechanisms in X- irradiation induced testicular damage
BÜŞRA ÇETİNKAYA ÜN
Doktora
Türkçe
2020
Histoloji ve EmbriyolojiZonguldak Bülent Ecevit ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MERYEM AKPOLAT FERAH
PROF. DR. YUSUFHAN YAZIR
- LNCaP hücrelerinde makrofaj kaynaklı enflamatuar çevresel stresle indüklenen entegre stres yanıtının tümör progresyonu ve antiandrojen terapötik yanıtları üzerindeki etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of M1 polarized macrophages-mediated inflammatory environmental stress induced integrated stress response on tumor progression and antiandrogen therapeutic efficacy in LNCaP cells
FATİH HUNÇ
Doktora
Türkçe
2022
BiyokimyaKocaeli ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELTEM ÖZLEN DİLLİOĞLUGİL
DR. ÖĞR. ÜYESİ KEREM TEKE
- Ratlarda oluşturulan deneysel sepsis modelinde kurkuminin over üzerine etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of curcumin on the ovary in an experimental sepsis model in rats
BETÜL AHMAD
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Histoloji ve EmbriyolojiAtatürk ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TUBA DEMİRCİ