Investigation of antibiotic resistance gene profile and microbiological characteristics of ceftazidyme-resistant Pseudomonas aeruginosa isolates from different hospitals in Iraq
Investıgatıon of antıbıotıc resıstance gene profıle and mıcrobıologıcal characterıstıcs of ceftazıdyme-resıstant Pseudomonas aeruginosa ısolates from dıfferent hospıtals ın Iraq
- Tez No: 882430
- Danışmanlar: PROF. DR. ABDURRAHMAN AYVAZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Infectious Diseases and Clinical Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Pseudomonas aeruginosa, blaGES, blaAmpC, blaampD, blaimp MexB, MexA, exoS, exoA ve pelF genleri, RT-PCR, VITEK2, API20E, Pseudomonas aeruginosa, The blaGES, blaAmpC, blaampD, blaimp MexB, MexA, exoS, exoA and pelF, RT-PCR, VITEK2, API20E
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 101
Özet
P. aeruginosa izolatlarının virülans genlerini ve antibiyotik direncini tespit etmek amacıyla Irak'ın farklı bölgelerindeki hastanelerin yara ve yanık ünitelerinde yatan hastalardan toplam 283 bakteri izolatı elde edildi. Örnekler 1 ile 70 yaş arasındaki erkek ve kadın hastalardan alındı. Bu izolatların 176'sı yaralı vücut bölgelerinden, 107'si ise yanık vücut bölgelerinden alındı. Mikroskobik, fenotipik ve biyokimyasal testler ile API 20E testleriyle bu izolatlardan 117'sinin P. aeruginosa olduğu belirlendi. Bu P. aeruginosa izolatlarının sırasıyla %58,97'si (69) ve 41,0%'ı (48) yanık ve yaralı vücut bölgelerinden sağlandı. Disk difüzyon yöntemiyle 117 izolatın 35%'inin (41) Ceftazidyme karşı dirençli olduğu belirlendi. Ayrıca E-Test yöntemiyle Minimal İnhibitör Konsantrasyonlar (MIC) hesaplandı. Seftazidime dirençli izolatların biyofilm üretim kapasitesi ELISA ile belirlendi. Konvansiyonel PCR ve RT-PCR ile yara ve yanık örneklerinden alınan izolatların blaGES, blaAmpC, blaampD, blaimp MexB, MexA, exoS, exoA ve pelF virülans genleri tarandı. blaGES ve pelF genlerinin en yüksek frekansta olduğu belirlendi. SE18 ve SE36 izolatları, taranan virülans genlerinin tamamını taşıdığından, en yüksek frekansa sahip blaGES ile pelF genleri dizilendi ve biyoinformatik olarak analiz edildi.
Özet (Çeviri)
In order to determine the virulence genes and antibiotic resistance of P. aeruginosa isolates, a total of 283 bacterial samples were obtained from patients hospitalized in wound and burn units of hospitals in different regions of Iraq. Samples were taken from male and female patients aged between 1 and 70 years, 176 of these isolates were taken from wounds and 107 from burned body parts. Using microscopic, phenotypic and biochemical tests and API 20E, 117 of these isolates were determined to be P. aeruginosa, and respectively 58.97% (69) and 41.0% (48) of these were obtained from burn and wounds. By disk diffusion method, 35% (41) of 117 isolates were determined to be resistant to Ceftazidime. Additionally, Minimal Inhibitory Concentrations were calculated with the E-Test. Biofilm production capacity of ceftazidime-resistant isolates was determined by ELISA. The blaGES, blaAmpC, blaampD, blaimp MexB, MexA, exoS, exoA and pelF virulence genes of the isolates taken from wound and burn samples were screened with conventional PCR and RT-PCR, and it was determined that the blaGES and pelF genes were found at the highest frequency. Since isolates SE18 and SE36 carried all of the screened virulence genes, the blaGES and pelF genes with the highest frequency were sequenced and analyzed bioinformatically.
Benzer Tezler
- Karbapenem dirençli Acinetobacter baumannii klinik izolatlarında direnç genlerinin moleküler yöntemlerle araştırılması
Investigation into clinical isolates of resistance genes in carbapenem resistant Acinetobacter baumannii by using molecular methods
HÜSEYİN BURAK ÖZÇELİK
- Investigation of colistin heteroresistance in multidrug resistant Acinetobacter baumannii
Çok sayıda ilaca dayanıklı Acinetobacter baumannii'in colistin heterorezistansının incelenmesi
SHAHAD NAHEDH HUSSEIN HUSSEIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ABDURRAHMAN AYVAZ
DR. SALMAN SHAHEER AHMED
- Investigation of antibiotic resistance profiles, mecA and blaZ resistance genes of staphylococcus aureus strains isolated from clinical samples at Sammara General Hospital in Iraq
Irak'ta Sammara Genel Hastanesindeki klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus çeşitlerinin antibiyotik direnç profilleri ile mecA ve blaZ direnç genlerinin araştırılması
OMAR JAMAL IBRAHIM ALFATOUH
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EBRU DERELLİ TÜFEKÇİ
DOÇ. DR. ASMAA EASA MAHMOOD
- Hastalıktan ari büyükbaş hayvancılık işletme çiğ sütlerinde mikrobiyolojik niteliklerin izlenmesi
Investigation of some microbiological properties of milk from disease-FREE facilities
ŞEYDA AYSUN KAYABAŞI
Doktora
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiErciyes ÜniversitesiVeteriner Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim dalı
PROF. DR. ZAFER GÖNÜLALAN
- Yatan hasta ve hastane personelinin burun örneklerinden izole metisiline dirençli Staphylococcus aureus suşlarında (MRSA) PVL gen bölgesinin araştırılması
Investigation of PVL gene loci in methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) strains isolated from nosocomial samples of hospital patient and hospital staff
HATİCE YAREN
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
BiyolojiSelçuk ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HASİBE CİNGİLLİ VURAL