Geri Dön

Klebsiella pneumoniae suşlarında antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi ve karbapenemaz direnç allellerinin araştırılması

Determination of antibiotic resistance profiles and investigation of carbapenemase resistance alleles in Klebsiella pneumaniae strains

PDF İndir

  1. Tez No: 882645
  2. Yazar: ESİN KARAMAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FATİH ŞABAN BERİŞ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 67

Özet

Klebsiella pneumoniae hastaneye yatırılmış ve immun bağışıklığı baskılanmış kişilerde sağlık bakımı ilişkili enfeksiyonlara yol açan Gram negatif fırsatçı bir patojendir. Halk sağlığı için önemli bir tehdit olarak bilinen K. pneumoniae, hastane kaynaklı ve toplum kaynaklı enfeksiyonların en sık etkenidir. Çalışmamızda Rize Devlet Hastanesi'ndeki yoğun bakım ve servis hastalarının çeşitli klinik örneklerinden (kan, idrar, yara yeri sürüntü örneği, apse, doku örneği, balgam, bronko alveolar lavaj (BAL), dren, endotrakeal aspirat (ETA), intraabdominal mayi, safra, nefrotomi, katater ucu, fırça ucu, periton sıvısı, rektal sürüntü (RS) izole edilen ve son yıllarda direnç gelişmeye başladığı gözlemlenen karbapenem duyarlı olmayan K. pneumoniae suşlarının antibiyotik direnç genlerinin belirlenmesi ve replikon tiplendirmesi amaçlanmaktadır. Çalışmada 2015-2017 yılları arasında Rize Devlet Hastanesiden çeşitli örneklerden elde edilen 60 K. pneumoniae suşu dahil edilmiştir. Kirby-Bauer disk difüzyon testi ve Vitek-2 otomatik sistem (BioMerieux, Fransa) ile suşların antibiyotik duyarlılık testleri yapıldı.Suşlar -20 ve -80 derecede stoklandı. Antibiyotik direnç genleri (blaTEM, blaSHV, blaCTX-M1, blaCTX-M2, blaGES, blaVEB, blaPER, blaKPC, blaIMP, blaVIM, blaNDM, blaOXA-51, blaOXA-58, blaOXA-23, blaOXA-40 ve blaOXA-48) PZR yöntemi ile karakterize edildi. HI1, HI2, I1, X, L/M, N, FIA, FIB, W, Y, P, FIC, A/C, T, FIIs, FrepB ve K/B replikonlarına spesifik primerler ile replikon tiplendirmesi yapıldı. K. pneumaniae izolatlarının en çok yoğun bakım ünitesinden gönderilen örneklerden (n=24) izole edildiği saptanmıştır. Çalışmamızda, tüm izolatların kolistine duyarlı olduğu görülmüş; amikasin, amoksiklav, ampisilin, sefepim, sefotaksim, siprofloksasin, kolistin, ertapenem, imipenem, meropenem, piperasillin, tigesiklin ve gentamisine direnç oranları sırasıyla; %1.7, %98.4, %100, %65, %86.4, %71.7, %0, %100, %76.7, %85.04, %96.7,%15.1, %38.4 olarak belirlenmiştir. İzolatlarda en sık olarak blaOXA-48 geni saptanmış olup, izolatların 58 (%96.6) tanesinde tek başına blaOXA-48 tespit edilmiştir. En sık I1 plazmit tipine rastlanılmış olup aynı zamanda farklı beş suşta 3 farklı plazmit tipine rastlanılmıştır. Yaptığımız bu çalışmayla K. pneumoniae'nın neden olduğu infeksiyonlarda antibiyotik direnç riskinin ve direnç yayılımının indirgenmesine katkı sağlayarak gelecekteki tedavi yöntemleri için fikir vermesi ve çalışacağımız gen bölgelerinin saptanmasıyla kritik hasta gruplarında antibiyotik seçiminde yol gösterici olması beklenmektedir.

Özet (Çeviri)

Klebsiella pneumoniae is a Gram-negative opportunistic pathogen that causes healthcare-associated infections in hospitalized and immunocompromised individuals. Known as an important threat to public health, K. pneumoniae is the most common cause of hospital-acquired and community-acquired infections. In our study, K. pneumoniae strains (non-susceptible to carbapenem) were obtained from various clinical samples (blood, urine, wound swab sample, abscess, tissue sample, sputum, BAL, drain, ETA, etc.) intraabdominal fluid, bile, nephrotomy, catheter tip, brush tip, peritoneal fluid and RS) and it is aimed to identify antibiotic resistance genes and replicon typing. In the study, K. pneumoniae strains (n=60) obtained from various samples from Rize State Hospital between 2015-2017 were included. . Antibiotic susceptibility tests of the strains were performed using Kirby-Bauer disc diffusion test and Vitek-2 automatic system (BioMerieux, France). Strains were stocked at -20 and -80 °C. Antibiotic resistance genes (blaTEM, blaSHV, blaCTX-M1, blaCTX-M2, blaGES, blaVEB, blaPER, blaKPC, blaIMP, blaVIM, blaNDM, blaOXA-51, blaOXA-58, blaOXA-23, blaOXA-40 and blaOXA-48) was characterized by PCR method. Replicon typing was performed with primers specific for HI1, HI2, I1, X, L/M, N, FIA, FIB, W, Y, P, FIC, A/C, T, FIIs, FrepB and K/B replicons. It was determined that K. pneumaniae isolates were mostly isolated from the samples of the intensive care unit (n=24). All isolates were found to be susceptible to colistin; resistance rates to amikacin, amoxiclav, ampicillin, cefepime, cefotaxime, ciprofloxacin, colistin, ertapenem, imipenem, meropenem, piperacillin, tigecycline and gentamicin, respectively; 1.7%, 98.4%, 100%, 65%, 86.4%, 71.7%, 0%, 100%, 76.7%, 85.04%, 96.7%, 15.1%, 38.4%. The blaOXA-48 gene was mostly detected in isolates (n=58, 96.6%) of the isolates. The most common type of plasmid was I1 and at the same time, 3 different plasmid types were found in five different strains. With this study, it is expected that it will contribute to the reduction of the risk of antibiotic resistance and the spread of resistance in infections caused by K. pneumoniae, giving ideas for future treatment methods, and guiding the selection of antibiotics in critical patient groups by determining the gene regions we will study.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    570526

    Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürü örneklerinden izole edilen mikroorganizmaların identifikasyonu, antibiyotik duyarlılıkları ve ESBL direnç durumunun araştırılması

    Identification, antibiotic susceptibility and investigation of ESBL resistance of microorganisms isolated from blood culture samples of inpatients in intensive care units

    OSMAN ORUÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ASHABİL AYGAN

  2. Tez No

    704662

    Çocuk hastalıkları servislerinde nozokomiyal enfeksiyon etkenleri ve direnç dağılımının belirlenmesi

    Determination of nosocomial infection agents and resistance distribution in inpati̇ent wards of the department of pediatrics

    İREM YILMAZ AKPINAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıBezm-i Alem Vakıf Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖZDEN TÜREL

  3. Tez No

    415372

    Trabzon ve Giresun illerindeki çeşitli hastanelerde izole edilen Klebsiella pneumoniae suşlarında antibiyotik direnç profillerinin belirlenmesi ve beta-laktamaz genlerinin araştırılması

    Investigation of antibiotic resistancy profiles and beta lactamases genes of Klebsiella pneumoniae strains isolated from trabzon and gi̇resun hospitals

    MERYEM GEZİCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Halk SağlığıRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FATİH ŞABAN BERİŞ

  4. Tez No

    418544

    Rize ili'ndeki çeşitli hastanelerden izole edilen Klebsiella pneumoniae suşlarında antibiyotik direnç profilerinin belirlenmesi ve beta- laktamaz genlerinin araştırılması

    Investigation of antibiotic resistance profiles and beta lactamase genes of Klebsiella pneumoniae strains isolated from rize hospital

    DİLEK ÖZTÜRKOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Halk SağlığıRecep Tayyip Erdoğan Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. FATİH ŞABAN BERİŞ

  5. Tez No

    170942

    Trabzon'daki derelerin fekal koliform kirliliği ve koliform bakterilerin antibiyotik direnç profillerinin araştırılması

    Investigation of fecal coliform pollution of rivers in Trabzon and antibiotic resistance profiles of coliform bacteria

    ALİ SEVİM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    BiyolojiKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. OSMAN BİROL ÖZGÜMÜŞ

Geri Dön