Geri Dön

Meme kanseri hücre hatlarında propolis bileşenlerinin mikrodizi yöntemi ile miRNA ekspresyonu düzeylerindeki etkilerinin biyoinformatik araçlarla araştırılması

Investigation of the effects of propolis components on microarray method and miRNA expression levels in breast cancer cell lines with bioinformatics tools

PDF İndir

  1. Tez No: 883420
  2. Yazar: FATİH YANAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HÜLYA YILMAZ AYDOĞAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 87

Özet

Meme kanseri tüm dünyada kadınlar arasında en sık teşhis edilen kanser türü olup kanser sebepli ölümlerin önce gelen sebeplerinden biridir. Kanser tedavisinde kullanılan geleneksel yöntemlere ek olarak, yapılan araştırmalarda propolis içeriğinde yüksek miktarda bulunabilen flavonoidlerin de apoptoz sürecine olumlu etki gösterdiği bulunmuştur. Araştırma grubumuzun önceki çalışmasında hazırlanan flavonoid karışımının MCF7 meme kanseri hücre tipi üzerinde apoptoza yönlendirici etkileri gözlenmiş, fakat kontrol grubu olan MCF10A hücre tipi üzerinde apoptotik bir etki göstermemiştir. Bu verilerden yola çıkılarak antikanser etkisi gösteren flavonoidlerin moleküler mekanizmasının incelenmesi amacıyla daha önceden gerçekleştirilen mRNA mikrodizi çalışmasına ek olarak miRNA mikrodizi analizi gerçekleştirilmiş ve sonuçlar biyoinformatik araçlar kullanılarak incelenmiştir. miRNA mikrodizi ekspresyon analizi Rstudio ve limma paketi kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Sonuçlar MEINTURNET, miRTarBase, DAVID, KEGG gibi çevrimiçi araçlar ve veritabanları kullanılarak incelenmiştir. Analiz sonucunda daha önce yapılan çalışmamızla uyumlu olacak şekilde apoptoz ile ilgili birçok yolakta rol alan genin miRNA'ların hedef geni olduğu bulunmuştur. Biyoinformatik analizler MCF7 hücre hattında gözlenen flavonoid aracılı apoptotik etkinin pozitif ekspresyon gösteren hsa-miR-630 aracılığıyla olabileceğini göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Breast cancer is the most commonly diagnosed cancer among women worldwide and a leading cause of cancer-related deaths. In addition to traditional cancer treatments, research has shown that flavonoids found abundantly in propolis can positively impact the apoptosis process. Our research group previously observed pro-apoptotic effects of a flavonoid mixture prepared in our earlier study on MCF7 breast cancer cells, while no apoptotic effect was seen on the control group, MCF10A cells. Building on these findings, in addition to mRNA microarray analysis conducted previously to investigate the molecular mechanisms of anticancer flavonoids, miRNA microarray analysis was performed. The results were analyzed using bioinformatics tools including Rstudio, limma package, and online resources such as MEINTURNET, miRTarBase, DAVID, and KEGG databases. As a result of the analysis, it was found that many genes involved in apoptotic pathways are target genes of miRNAs, consistent with our previous work. Bioinformatic analyses suggest that the flavonoid-mediated apoptotic effect observed in the MCF7 cell line could be mediated through the positive expression of hsa-miR-630

Benzer Tezler

  1. Tez No

    335642

    Effects of biological compound Turkish propolis extract on breast cancer cells

    Biyolojik bileşke Türk propolisinin meme kanseri hücrelerine etkileri

    DENİZ UĞURLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. IŞIK YULUĞ

  2. Tez No

    576468

    Propolis ham etanol ekstresi ile yüklü niozomların, 2 boyutlu çeşitli tümör, normal hücre kültürlerinde antikanser aktivitelerinin doza ve zamana bağlı olarak araştırılması ve karşılaştırılması

    Investigation and comparison of the antiscent activitiesin the 2-dimensional tumor and normal cell cultures ofthe propolis ham ethanol extract with the problem ofhem ethanol extract

    İLKNUR ÖZDEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiKocaeli Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CANAN SEVİMLİ GÜR

  3. Tez No

    433263

    Propolis içeriğindeki çeşitli flavonoid ve fenolik etken maddelerinin MCF-7 meme kanseri ve MCF-10A normal epitel hücre soyları üzerine etkileri

    Effects of various flavonoid and phenolic active substances in propolis upon MCF-7 breast cancer and MCF-10a normal epithelial cell lines

    MEHMET FATİH SEYHAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Moleküler Tıpİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OĞUZ ÖZTÜRK

  4. Tez No

    359626

    Meme kanseri hücre hatlarında mir-221-3P ve pak1 gen ifadesinin araştırılması

    The investigation of mir-221-3P and pak1 gene expressions in breast cancer cell lines

    TAYEB SADIQ TAYEP

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Tıbbi BiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. SERDAR ÖZTUZCU

  5. Tez No

    493373

    Meme kanseri hücre hatlarında keton cisimlerinin etkisi

    Effect of ketone bodies on breast cancer cell lines

    ZUHAL KAYA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyokimyaMarmara Üniversitesi

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET SUHA YALÇIN

Geri Dön