Bazı çiftlik hayvanlarında transforming growth faktörün (TGF BETA) biyoinformatik karakterizasyonu
Bioinformatic characterization of transforming growth factor (TGF BETA) in some livestock
- Tez No: 883887
- Danışmanlar: PROF. YAKUT GEVREKÇİ, DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNE DİLŞAT YEĞENOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Ziraat, Genetics, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Zootekni Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyometri ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
Transforming Growth Faktör (TGF-β) ya da Transforme Edici Büyüme Faktörü-B, T hücreleri tarafından üretilmekte ve esas olarak inhibitör bir sitokindir. 112 amino asitten oluşan; β1, β2, β3 olarak üç alt ünite içeren peptid yapılardır. TGF-β ailesi hücre çoğalması/farklılaşması, apoptozis, hücre dışı matriks üretimi, bağışıklık sisteminin düzenlenmesi, yaraların iyileşmesi ve ovaryumda önemli olan olayların düzenlenmesinde rol oynamaktadır. Bu çalışmada, TGF-β proteininin biyoinformatik karakterizasyonu incelenerek, TGF-β geninin protein dizilimi ve kromozomal dağılımları belirlenmiştir. Sığır genomunda TGF-β proteinine ait 34, koyun genomunda 28, keçi genomunda ise 27 gen bulunmuştur. TGF-β proteininin filogenetik ağaç oluşumunda aynı kollarda yer alan proteinlerin motifleri de benzer yapıda olduğu görülmüş, 3d protein yapılarında da incelenen tüm türlerde de β-yaprak yapının yoğunlukta olduğu saptanmıştır. Sığır, koyun ve keçi genomlarında kullanılabilir primerler belirlenmiştir. Elde edilen veriler, hayvancılık alanında yapılacak ıslah ve genetik çalışmalara katkı sağlayacaktır.
Özet (Çeviri)
Transforming Growth Factor-Beta (TGF-B) is produced by T cells and primarily functions as an inhibitory cytokine. It consists of three subunits, β1, β2, and β3, comprising a peptide structure with 112 amino acids. The TGF-B family plays a crucial role in regulating cell proliferation/differentiation, apoptosis, extracellular matrix production, immune system modulation, wound healing, and events essential in the ovary. In this study, the bioinformatic characterization of the TGF-B protein was examined, and the protein sequence and chromosomal distributions of the TGF-B gene were determined. In the bovine genome, 34 genes related to the TGF-B protein were identified, 28 in the sheep and 27 in the goat genome. The phylogenetic tree formation of TGF-B proteins revealed similarities in motifs among proteins in the same branches. The 3D protein structures across all species showed a predominance of beta-sheet structures. Primer sets suitable for cattle, sheep, and goat genomes were determined. The obtained data will contribute to breeding and genetic studies in the field of livestock.
Benzer Tezler
- İnsan olgularının görüldüğü endemik bölgelerdeki memeli çiftlik hayvanlarında hantavirusların moleküler ve serolojik yöntemlerle araştırılması
Investigation of hantaviruses by molecular and serological methods in mammalian farm animals reared in endemic regions, where human cases are detected
YAVUZ UYAR
- Çevre örneklerinde sık rastlanılan bazı antibiyotiklerin elektrokimyasal nanosensörlerle tayini
Determination of some common antibiotics in environmental samples with electrochemical nanosensors
NİDA AYDOĞDU ÖZDOĞAN
Doktora
Türkçe
2024
Eczacılık ve FarmakolojiAnkara ÜniversitesiAnalitik Kimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SİBEL AYŞIL ÖZKAN
DOÇ. DR. ERSİN DEMİR
- Koyunlarda anogenital uzunluk ve serum antimüllerian hormon düzeylerinin bazı fertilite özellikleri ile karşılaştırılması
Comparison of anogenital distance and serum antimüllerian hormone levels with some fertility characteristics in sheep
EMİR CAN BULUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiDoğum ve Jinekoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MESİH KOCAMÜFTÜOĞLU
- Ile de France x Anadolu merinosu melezi koyunlarda sıcaklık stresine tolerans parametreleri ile bazı aday genler arasındaki ilişkilerin belirlenmesi
Determination of the relationships between parameters associated with heat stress tolerance and some candidate genes in ile de France x Anatolian merino crossbred sheep
SEYDANUR SEVİM KAVUNLUK
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
ZiraatEskişehir Osmangazi ÜniversitesiZootekni Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TAKİ KARSLI
- Manda orijinli enterococcus faecium izolatlarının genotip, antibiyotip ve bazı virulens genleri açısından incelenmesi
Examination of antibiotype, genotype, and some virulencegenes for buffalo origin enterococcus faecium isolates
GÖZDE KILINÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TİMUR GÜLHAN